MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 2437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TTTCG	2	10	2379	2388	0 %	60 %	20 %	20 %	294138775
2	NC_014012	TAGTC	2	10	11956	11965	20 %	40 %	20 %	20 %	294138784
3	NC_014012	CATAA	2	10	13515	13524	60 %	20 %	0 %	20 %	294138788
4	NC_014012	TGTAA	2	10	13674	13683	40 %	40 %	20 %	0 %	294138788
5	NC_014012	TCTCT	2	10	15361	15370	0 %	60 %	0 %	40 %	294138788
6	NC_014012	TGTCT	2	10	15692	15701	0 %	60 %	20 %	20 %	294138788
7	NC_014012	GCGAA	2	10	21466	21475	40 %	0 %	40 %	20 %	294138794
8	NC_014012	CCGTA	2	10	23134	23143	20 %	20 %	20 %	40 %	294138795
9	NC_014012	ATTTG	2	10	24070	24079	20 %	60 %	20 %	0 %	294138795
10	NC_014012	GTCTG	2	10	24346	24355	0 %	40 %	40 %	20 %	294138795
11	NC_014012	AGTCT	2	10	26665	26674	20 %	40 %	20 %	20 %	294138797
12	NC_014012	TAAGT	2	10	28039	28048	40 %	40 %	20 %	0 %	294138798
13	NC_014012	CGTAG	2	10	30868	30877	20 %	20 %	40 %	20 %	294138802
14	NC_014012	TACCG	2	10	31816	31825	20 %	20 %	20 %	40 %	294138803
15	NC_014012	ATTTC	2	10	34755	34764	20 %	60 %	0 %	20 %	294138805
16	NC_014012	AGTTC	2	10	35207	35216	20 %	40 %	20 %	20 %	294138805
17	NC_014012	GCCCA	2	10	43116	43125	20 %	0 %	20 %	60 %	294138812
18	NC_014012	AAGCT	2	10	43275	43284	40 %	20 %	20 %	20 %	294138812
19	NC_014012	AGCTG	2	10	50736	50745	20 %	20 %	40 %	20 %	294138820
20	NC_014012	TCAAA	2	10	51495	51504	60 %	20 %	0 %	20 %	294138821
21	NC_014012	TCTTT	2	10	57320	57329	0 %	80 %	0 %	20 %	294138825
22	NC_014012	TGCAG	2	10	66634	66643	20 %	20 %	40 %	20 %	294138833
23	NC_014012	CGGCG	2	10	66933	66942	0 %	0 %	60 %	40 %	294138833
24	NC_014012	CATCT	2	10	68213	68222	20 %	40 %	0 %	40 %	294138835
25	NC_014012	AGTTA	2	10	68617	68626	40 %	40 %	20 %	0 %	294138835
26	NC_014012	GGCTC	2	10	69670	69679	0 %	20 %	40 %	40 %	294138836
27	NC_014012	CGAAA	2	10	69845	69854	60 %	0 %	20 %	20 %	294138836
28	NC_014012	ATCTT	2	10	70750	70759	20 %	60 %	0 %	20 %	294138837
29	NC_014012	TGCTC	2	10	71211	71220	0 %	40 %	20 %	40 %	294138838
30	NC_014012	TGAGG	2	10	72786	72795	20 %	20 %	60 %	0 %	294138838
31	NC_014012	GGCCC	2	10	73911	73920	0 %	0 %	40 %	60 %	294138840
32	NC_014012	GCTTT	2	10	75184	75193	0 %	60 %	20 %	20 %	294138841
33	NC_014012	GCTTT	2	10	75358	75367	0 %	60 %	20 %	20 %	294138842
34	NC_014012	GCTTT	2	10	75537	75546	0 %	60 %	20 %	20 %	294138843
35	NC_014012	ATTTA	2	10	76032	76041	40 %	60 %	0 %	0 %	294138844
36	NC_014012	AATGC	2	10	84713	84722	40 %	20 %	20 %	20 %	294138847
37	NC_014012	GAAAA	2	10	84850	84859	80 %	0 %	20 %	0 %	294138847
38	NC_014012	TGTCC	2	10	85194	85203	0 %	40 %	20 %	40 %	294138848
39	NC_014012	TGCTT	2	10	98315	98324	0 %	60 %	20 %	20 %	294138854
40	NC_014012	AACTC	2	10	100668	100677	40 %	20 %	0 %	40 %	294138857
41	NC_014012	TAGCT	2	10	103646	103655	20 %	40 %	20 %	20 %	294138859
42	NC_014012	TAAAG	2	10	109509	109518	60 %	20 %	20 %	0 %	294138864
43	NC_014012	GCCTG	2	10	109579	109588	0 %	20 %	40 %	40 %	294138864
44	NC_014012	CTGTT	2	10	114323	114332	0 %	60 %	20 %	20 %	294138869
45	NC_014012	TCGAT	2	10	118444	118453	20 %	40 %	20 %	20 %	294138873
46	NC_014012	GTTTT	2	10	119255	119264	0 %	80 %	20 %	0 %	294138874
47	NC_014012	TAAGC	2	10	122433	122442	40 %	20 %	20 %	20 %	294138877
48	NC_014012	TCATC	2	10	122668	122677	20 %	40 %	0 %	40 %	294138877
49	NC_014012	GCCAA	2	10	123590	123599	40 %	0 %	20 %	40 %	294138878
50	NC_014012	AATAT	2	10	123675	123684	60 %	40 %	0 %	0 %	294138878
51	NC_014012	GGCTT	2	10	133797	133806	0 %	40 %	40 %	20 %	294138887
52	NC_014012	GGTTA	2	10	149127	149136	20 %	40 %	40 %	0 %	294138899
53	NC_014012	TAACA	2	10	151410	151419	60 %	20 %	0 %	20 %	294138900
54	NC_014012	TGTTT	2	10	154118	154127	0 %	80 %	20 %	0 %	294138902
55	NC_014012	GTGAA	2	10	155506	155515	40 %	20 %	40 %	0 %	294138903
56	NC_014012	CAATA	2	10	155714	155723	60 %	20 %	0 %	20 %	294138903
57	NC_014012	CGTTT	2	10	156663	156672	0 %	60 %	20 %	20 %	294138905
58	NC_014012	TGGTT	2	10	160092	160101	0 %	60 %	40 %	0 %	294138908
59	NC_014012	CAGAT	2	10	160779	160788	40 %	20 %	20 %	20 %	294138909
60	NC_014012	GGTCC	2	10	164530	164539	0 %	20 %	40 %	40 %	294138911
61	NC_014012	CGAGT	2	10	166097	166106	20 %	20 %	40 %	20 %	294138913
62	NC_014012	GCGAC	2	10	166849	166858	20 %	0 %	40 %	40 %	294138914
63	NC_014012	ACTCG	2	10	167013	167022	20 %	20 %	20 %	40 %	294138914
64	NC_014012	ACCAA	2	10	167659	167668	60 %	0 %	0 %	40 %	294138915
65	NC_014012	TGTAG	2	10	168114	168123	20 %	40 %	40 %	0 %	294138915
66	NC_014012	GTGCT	2	10	169441	169450	0 %	40 %	40 %	20 %	294138916
67	NC_014012	TCGTG	2	10	169562	169571	0 %	40 %	40 %	20 %	294138916
68	NC_014012	CAGGA	2	10	171801	171810	40 %	0 %	40 %	20 %	294138917
69	NC_014012	GCTAC	2	10	172629	172638	20 %	20 %	20 %	40 %	294138917
70	NC_014012	CGATA	2	10	176580	176589	40 %	20 %	20 %	20 %	294138920
71	NC_014012	GATAA	2	10	181118	181127	60 %	20 %	20 %	0 %	294138924
72	NC_014012	AAATC	4	20	182031	182050	60 %	20 %	0 %	20 %	294138924
73	NC_014012	GGAAG	2	10	182432	182441	40 %	0 %	60 %	0 %	294138925
74	NC_014012	GGCCA	2	10	183526	183535	20 %	0 %	40 %	40 %	294138925
75	NC_014012	AAGGC	2	10	184279	184288	40 %	0 %	40 %	20 %	294138926
76	NC_014012	TCACT	2	10	187587	187596	20 %	40 %	0 %	40 %	294138930
77	NC_014012	GCATC	2	10	193199	193208	20 %	20 %	20 %	40 %	294138933
78	NC_014012	AGCTG	2	10	196530	196539	20 %	20 %	40 %	20 %	294138936
79	NC_014012	CCATA	2	10	197391	197400	40 %	20 %	0 %	40 %	294138936
80	NC_014012	TGGCC	2	10	199686	199695	0 %	20 %	40 %	40 %	294138937
81	NC_014012	GATGA	2	10	199830	199839	40 %	20 %	40 %	0 %	294138937
82	NC_014012	TGGCT	2	10	203939	203948	0 %	40 %	40 %	20 %	294138941
83	NC_014012	GAATA	2	10	204584	204593	60 %	20 %	20 %	0 %	294138941
84	NC_014012	TTACC	2	10	206099	206108	20 %	40 %	0 %	40 %	294138943
85	NC_014012	AGGAT	2	10	206153	206162	40 %	20 %	40 %	0 %	294138943
86	NC_014012	CAGCG	2	10	210679	210688	20 %	0 %	40 %	40 %	294138947
87	NC_014012	TCATC	2	10	210699	210708	20 %	40 %	0 %	40 %	294138947
88	NC_014012	GATTA	2	10	213655	213664	40 %	40 %	20 %	0 %	294138947
89	NC_014012	ATTTT	2	10	217857	217866	20 %	80 %	0 %	0 %	294138951
90	NC_014012	TAGCT	2	10	218548	218557	20 %	40 %	20 %	20 %	294138952
91	NC_014012	GATGA	2	10	220573	220582	40 %	20 %	40 %	0 %	294138954
92	NC_014012	GGGGT	2	10	221891	221900	0 %	20 %	80 %	0 %	294138956
93	NC_014012	TGGCC	2	10	224294	224303	0 %	20 %	40 %	40 %	294138960
94	NC_014012	GCCAG	2	10	225939	225948	20 %	0 %	40 %	40 %	294138961
95	NC_014012	AAGGC	2	10	235961	235970	40 %	0 %	40 %	20 %	294138970
96	NC_014012	CCAGT	2	10	237097	237106	20 %	20 %	20 %	40 %	294138971
97	NC_014012	CAGGC	2	10	237612	237621	20 %	0 %	40 %	40 %	294138971
98	NC_014012	ACAAA	2	10	237799	237808	80 %	0 %	0 %	20 %	294138971
99	NC_014012	GAGTC	2	10	240103	240112	20 %	20 %	40 %	20 %	294138974
100	NC_014012	TAGCG	2	10	240223	240232	20 %	20 %	40 %	20 %	294138974
101	NC_014012	GTGAA	2	10	240248	240257	40 %	20 %	40 %	0 %	294138974
102	NC_014012	AAGCA	2	10	240801	240810	60 %	0 %	20 %	20 %	294138975
103	NC_014012	CATCA	2	10	242872	242881	40 %	20 %	0 %	40 %	294138976
104	NC_014012	AACCG	2	10	245230	245239	40 %	0 %	20 %	40 %	294138976
105	NC_014012	CTAAT	2	10	246689	246698	40 %	40 %	0 %	20 %	294138978
106	NC_014012	GTTAA	2	10	250114	250123	40 %	40 %	20 %	0 %	294138982
107	NC_014012	TGTGA	2	10	250437	250446	20 %	40 %	40 %	0 %	294138982
108	NC_014012	CAAGA	2	10	252063	252072	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
109	NC_014012	CAAGA	2	10	252087	252096	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
110	NC_014012	CAAGA	2	10	252111	252120	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
111	NC_014012	CAAGA	2	10	252207	252216	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
112	NC_014012	CAAGA	2	10	252495	252504	60 %	0 %	20 %	20 %	294138984
113	NC_014012	CCGCG	2	10	253543	253552	0 %	0 %	40 %	60 %	294138984
114	NC_014012	CTTGG	2	10	255669	255678	0 %	40 %	40 %	20 %	294138986
115	NC_014012	TTCGT	2	10	256500	256509	0 %	60 %	20 %	20 %	294138987
116	NC_014012	GAGTC	2	10	259812	259821	20 %	20 %	40 %	20 %	294138989
117	NC_014012	CTGAG	2	10	261787	261796	20 %	20 %	40 %	20 %	294138991
118	NC_014012	AAGTT	2	10	262540	262549	40 %	40 %	20 %	0 %	294138991
119	NC_014012	GAATG	2	10	262878	262887	40 %	20 %	40 %	0 %	294138992
120	NC_014012	GTGCC	2	10	265115	265124	0 %	20 %	40 %	40 %	294138994
121	NC_014012	TGATC	2	10	265816	265825	20 %	40 %	20 %	20 %	294138995
122	NC_014012	TGACA	2	10	266676	266685	40 %	20 %	20 %	20 %	294138996
123	NC_014012	TATTT	2	10	267093	267102	20 %	80 %	0 %	0 %	294138997
124	NC_014012	TCTAC	2	10	271265	271274	20 %	40 %	0 %	40 %	294139001
125	NC_014012	GTGCG	2	10	271381	271390	0 %	20 %	60 %	20 %	294139001
126	NC_014012	CCTAG	2	10	275180	275189	20 %	20 %	20 %	40 %	294139003
127	NC_014012	AAGCA	2	10	275466	275475	60 %	0 %	20 %	20 %	294139004
128	NC_014012	GCGTG	2	10	277356	277365	0 %	20 %	60 %	20 %	294139007
129	NC_014012	TAATC	2	10	281221	281230	40 %	40 %	0 %	20 %	294139011
130	NC_014012	AGGTG	2	10	281699	281708	20 %	20 %	60 %	0 %	294139012
131	NC_014012	AGTGA	2	10	282198	282207	40 %	20 %	40 %	0 %	294139012
132	NC_014012	TGCAT	2	10	283254	283263	20 %	40 %	20 %	20 %	294139013
133	NC_014012	ACCCT	2	10	284748	284757	20 %	20 %	0 %	60 %	294139014
134	NC_014012	CAAAC	2	10	285247	285256	60 %	0 %	0 %	40 %	294139015
135	NC_014012	CTGTA	2	10	296543	296552	20 %	40 %	20 %	20 %	294139020
136	NC_014012	TAGCC	2	10	296646	296655	20 %	20 %	20 %	40 %	294139020
137	NC_014012	TTATC	2	10	300377	300386	20 %	60 %	0 %	20 %	294139025
138	NC_014012	CAAGC	2	10	300776	300785	40 %	0 %	20 %	40 %	294139026
139	NC_014012	AGTGC	2	10	300904	300913	20 %	20 %	40 %	20 %	294139026
140	NC_014012	ACTAA	2	10	307244	307253	60 %	20 %	0 %	20 %	294139032
141	NC_014012	TTGGG	2	10	308142	308151	0 %	40 %	60 %	0 %	294139033
142	NC_014012	TGGTG	2	10	308748	308757	0 %	40 %	60 %	0 %	294139033
143	NC_014012	TATGG	2	10	311145	311154	20 %	40 %	40 %	0 %	294139035
144	NC_014012	CATGG	2	10	311798	311807	20 %	20 %	40 %	20 %	294139035
145	NC_014012	TAAAC	2	10	320593	320602	60 %	20 %	0 %	20 %	294139038
146	NC_014012	GGCGC	2	10	322680	322689	0 %	0 %	60 %	40 %	294139039
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148	NC_014012	AAGGT	2	10	328187	328196	40 %	20 %	40 %	0 %	294139042
149	NC_014012	TAATT	2	10	331119	331128	40 %	60 %	0 %	0 %	294139045
150	NC_014012	TCAGT	2	10	331210	331219	20 %	40 %	20 %	20 %	294139045
151	NC_014012	ACCAC	2	10	333025	333034	40 %	0 %	0 %	60 %	294139047
152	NC_014012	AGGCA	2	10	334411	334420	40 %	0 %	40 %	20 %	294139048
153	NC_014012	CTTGC	2	10	335791	335800	0 %	40 %	20 %	40 %	294139048
154	NC_014012	AGATG	2	10	340837	340846	40 %	20 %	40 %	0 %	294139052
155	NC_014012	ACTGT	2	10	341411	341420	20 %	40 %	20 %	20 %	294139052
156	NC_014012	TCTCC	2	10	341425	341434	0 %	40 %	0 %	60 %	294139052
157	NC_014012	CTTAG	2	10	341471	341480	20 %	40 %	20 %	20 %	294139052
158	NC_014012	TAAGT	2	10	342681	342690	40 %	40 %	20 %	0 %	294139053
159	NC_014012	CCGAC	2	10	344523	344532	20 %	0 %	20 %	60 %	294139056
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161	NC_014012	CCTTG	2	10	347622	347631	0 %	40 %	20 %	40 %	294139059
162	NC_014012	AGCAG	2	10	348671	348680	40 %	0 %	40 %	20 %	294139060
163	NC_014012	ACTAC	2	10	349728	349737	40 %	20 %	0 %	40 %	294139060
164	NC_014012	AGTCA	2	10	352656	352665	40 %	20 %	20 %	20 %	294139063
165	NC_014012	CAATG	2	10	355340	355349	40 %	20 %	20 %	20 %	294139067
166	NC_014012	TATCG	2	10	360362	360371	20 %	40 %	20 %	20 %	294139072
167	NC_014012	GGTCG	2	10	361707	361716	0 %	20 %	60 %	20 %	294139072
168	NC_014012	ATCGA	2	10	363823	363832	40 %	20 %	20 %	20 %	294139073
169	NC_014012	TGAGC	2	10	363908	363917	20 %	20 %	40 %	20 %	294139073
170	NC_014012	AGACT	2	10	365119	365128	40 %	20 %	20 %	20 %	294139073
171	NC_014012	TGGTG	2	10	366745	366754	0 %	40 %	60 %	0 %	294139074
172	NC_014012	GTCGA	2	10	368992	369001	20 %	20 %	40 %	20 %	294139077
173	NC_014012	AAGCT	2	10	371699	371708	40 %	20 %	20 %	20 %	294139079
174	NC_014012	TGGAA	2	10	372033	372042	40 %	20 %	40 %	0 %	294139079
175	NC_014012	CAGGT	2	10	373070	373079	20 %	20 %	40 %	20 %	294139079
176	NC_014012	ATTCG	2	10	374623	374632	20 %	40 %	20 %	20 %	294139079
177	NC_014012	TAAAT	2	10	376911	376920	60 %	40 %	0 %	0 %	294139081
178	NC_014012	CGCTT	2	10	377762	377771	0 %	40 %	20 %	40 %	294139082
179	NC_014012	AGCTG	2	10	386556	386565	20 %	20 %	40 %	20 %	294139088
180	NC_014012	CTTGG	2	10	388683	388692	0 %	40 %	40 %	20 %	294139090
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198	NC_014012	TAGCC	2	10	436693	436702	20 %	20 %	20 %	40 %	294139133
199	NC_014012	CGTAA	2	10	440367	440376	40 %	20 %	20 %	20 %	294139137
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201	NC_014012	CCCTG	2	10	443277	443286	0 %	20 %	20 %	60 %	294139138
202	NC_014012	TGTTC	2	10	444988	444997	0 %	60 %	20 %	20 %	294139142
203	NC_014012	TGGCT	2	10	449144	449153	0 %	40 %	40 %	20 %	294139146
204	NC_014012	AAATA	2	10	450353	450362	80 %	20 %	0 %	0 %	294139146
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206	NC_014012	ATTGG	2	10	455799	455808	20 %	40 %	40 %	0 %	294139153
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209	NC_014012	TCACT	2	10	460299	460308	20 %	40 %	0 %	40 %	294139160
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211	NC_014012	GTAAG	2	10	461923	461932	40 %	20 %	40 %	0 %	294139162
212	NC_014012	TATCG	2	10	462402	462411	20 %	40 %	20 %	20 %	294139162
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217	NC_014012	CGCGG	2	10	470525	470534	0 %	0 %	60 %	40 %	294139171
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219	NC_014012	TCAGA	2	10	474024	474033	40 %	20 %	20 %	20 %	294139176
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223	NC_014012	GTCTT	2	10	482912	482921	0 %	60 %	20 %	20 %	294139185
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227	NC_014012	GTCAG	2	10	489808	489817	20 %	20 %	40 %	20 %	294139195
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229	NC_014012	TAGAG	2	10	494008	494017	40 %	20 %	40 %	0 %	294139200
230	NC_014012	AACTT	2	10	495541	495550	40 %	40 %	0 %	20 %	294139201
231	NC_014012	TGGTG	2	10	498984	498993	0 %	40 %	60 %	0 %	294139207
232	NC_014012	TTCCA	2	10	499094	499103	20 %	40 %	0 %	40 %	294139207
233	NC_014012	AGGAG	2	10	501152	501161	40 %	0 %	60 %	0 %	294139209
234	NC_014012	GGTGA	2	10	502188	502197	20 %	20 %	60 %	0 %	294139209
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236	NC_014012	CTGCT	2	10	503779	503788	0 %	40 %	20 %	40 %	294139210
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238	NC_014012	TAGGT	2	10	516959	516968	20 %	40 %	40 %	0 %	294139221
239	NC_014012	TTATG	2	10	520725	520734	20 %	60 %	20 %	0 %	294139224
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241	NC_014012	ATTGA	2	10	526802	526811	40 %	40 %	20 %	0 %	294139233
242	NC_014012	TTTGT	2	10	527544	527553	0 %	80 %	20 %	0 %	294139233
243	NC_014012	TTGTC	2	10	535921	535930	0 %	60 %	20 %	20 %	294139240
244	NC_014012	GGTGA	2	10	536151	536160	20 %	20 %	60 %	0 %	294139240
245	NC_014012	TCTTT	2	10	538052	538061	0 %	80 %	0 %	20 %	294139243
246	NC_014012	AATTT	2	10	541566	541575	40 %	60 %	0 %	0 %	294139246
247	NC_014012	ATTTT	2	10	542006	542015	20 %	80 %	0 %	0 %	294139246
248	NC_014012	CATTT	2	10	544479	544488	20 %	60 %	0 %	20 %	294139249
249	NC_014012	AGGTA	2	10	550177	550186	40 %	20 %	40 %	0 %	294139253
250	NC_014012	AGAGG	2	10	550291	550300	40 %	0 %	60 %	0 %	294139253
251	NC_014012	GAGCT	2	10	550786	550795	20 %	20 %	40 %	20 %	294139254
252	NC_014012	GCATT	2	10	551117	551126	20 %	40 %	20 %	20 %	294139254
253	NC_014012	GTTAT	2	10	555649	555658	20 %	60 %	20 %	0 %	294139258
254	NC_014012	TGGTT	2	10	559602	559611	0 %	60 %	40 %	0 %	294139262
255	NC_014012	CATCG	2	10	560413	560422	20 %	20 %	20 %	40 %	294139263
256	NC_014012	AGCAT	2	10	562996	563005	40 %	20 %	20 %	20 %	294139266
257	NC_014012	TATCA	2	10	568831	568840	40 %	40 %	0 %	20 %	294139269
258	NC_014012	CACAG	2	10	578331	578340	40 %	0 %	20 %	40 %	294139280
259	NC_014012	AACGC	2	10	580926	580935	40 %	0 %	20 %	40 %	294139282
260	NC_014012	GGCTT	2	10	582189	582198	0 %	40 %	40 %	20 %	294139285
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262	NC_014012	CTTTT	2	10	584378	584387	0 %	80 %	0 %	20 %	294139287
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387	NC_014012	GACTC	3	15	865849	865863	20 %	20 %	20 %	40 %	294139498
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389	NC_014012	ATCGT	2	10	868126	868135	20 %	40 %	20 %	20 %	294139499
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