MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 58230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TAT	3	9	33	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014012	TCT	2	6	59	64	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014012	TAT	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014012	GCG	2	6	103	108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014012	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014012	ATA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014012	TCT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138772
8	NC_014012	AGA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138772
9	NC_014012	TCG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138772
10	NC_014012	CTA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138772
11	NC_014012	GAT	2	6	863	868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014012	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138773
13	NC_014012	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014012	TTA	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138774
15	NC_014012	CGA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
16	NC_014012	ATC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138774
17	NC_014012	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138774
18	NC_014012	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
19	NC_014012	AGA	2	6	1780	1785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138774
20	NC_014012	CAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
21	NC_014012	GGT	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
22	NC_014012	TAA	2	6	2095	2100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014012	TCT	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014012	GTT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
25	NC_014012	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
26	NC_014012	TGG	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
27	NC_014012	CGA	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
28	NC_014012	TGG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
29	NC_014012	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
30	NC_014012	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
31	NC_014012	GAG	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
32	NC_014012	GTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
33	NC_014012	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138775
34	NC_014012	AAT	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138775
35	NC_014012	TAT	2	6	3123	3128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
36	NC_014012	CCA	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138775
37	NC_014012	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
38	NC_014012	GCG	2	6	3270	3275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138775
39	NC_014012	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138775
40	NC_014012	GAT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
41	NC_014012	ATG	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
42	NC_014012	ATC	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138775
43	NC_014012	AGG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
44	NC_014012	CAT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
45	NC_014012	CCA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
46	NC_014012	ATG	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
47	NC_014012	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138776
48	NC_014012	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
49	NC_014012	ATT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138776
50	NC_014012	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
51	NC_014012	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138776
52	NC_014012	TTC	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
53	NC_014012	ATG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
54	NC_014012	CAT	2	6	4153	4158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
55	NC_014012	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
56	NC_014012	CAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
57	NC_014012	GAT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
58	NC_014012	CTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
59	NC_014012	CGG	2	6	4429	4434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
60	NC_014012	ATG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
61	NC_014012	TGT	2	6	4609	4614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138776
62	NC_014012	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
63	NC_014012	TCT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
64	NC_014012	CCA	3	9	4671	4679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
65	NC_014012	ATG	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
66	NC_014012	CGG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
67	NC_014012	TGG	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
68	NC_014012	TGG	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
69	NC_014012	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138776
70	NC_014012	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
71	NC_014012	AAG	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138776
72	NC_014012	CCA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
73	NC_014012	GAT	2	6	5392	5397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
74	NC_014012	ACC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
75	NC_014012	GAT	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
76	NC_014012	GAG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138776
77	NC_014012	TGA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
78	NC_014012	GCA	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138777
79	NC_014012	TCT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
80	NC_014012	GCT	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
81	NC_014012	TGT	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138777
82	NC_014012	CTG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
83	NC_014012	TCT	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
84	NC_014012	GGC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138777
85	NC_014012	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
86	NC_014012	GAT	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014012	GAT	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
88	NC_014012	AGC	3	9	6268	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138778
89	NC_014012	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
90	NC_014012	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
91	NC_014012	CAT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138778
92	NC_014012	AAT	2	6	6520	6525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138778
93	NC_014012	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138778
94	NC_014012	AGG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138778
95	NC_014012	CTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138778
96	NC_014012	CCG	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138778
97	NC_014012	GCT	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014012	TGG	2	6	7178	7183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
99	NC_014012	ACT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
100	NC_014012	ATC	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
101	NC_014012	GTT	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138779
102	NC_014012	GTG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
103	NC_014012	TTA	2	6	7340	7345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138779
104	NC_014012	TGC	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
105	NC_014012	CTG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
106	NC_014012	ATC	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138780
107	NC_014012	TAG	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
108	NC_014012	GAT	2	6	8127	8132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
109	NC_014012	TAA	2	6	8204	8209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014012	ATG	2	6	8230	8235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014012	GCA	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014012	ACA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138781
113	NC_014012	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138781
114	NC_014012	GAT	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
115	NC_014012	ATC	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
116	NC_014012	CCA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138781
117	NC_014012	TGT	2	6	8559	8564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138781
118	NC_014012	TGG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138781
119	NC_014012	GCT	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138781
120	NC_014012	GTG	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138781
121	NC_014012	CGC	2	6	8856	8861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138781
122	NC_014012	CTT	2	6	8925	8930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138781
123	NC_014012	GAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
124	NC_014012	CTA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
125	NC_014012	ATG	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
126	NC_014012	AGA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138781
127	NC_014012	TGT	2	6	9248	9253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138781
128	NC_014012	CAT	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
129	NC_014012	GAA	2	6	9431	9436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138782
130	NC_014012	AGT	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138782
131	NC_014012	CCA	2	6	9508	9513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138782
132	NC_014012	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138782
133	NC_014012	AAT	2	6	9537	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138782
134	NC_014012	GCG	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138782
135	NC_014012	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138782
136	NC_014012	TGC	2	6	9711	9716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138782
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140	NC_014012	CGG	2	6	10049	10054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014012	TTA	2	6	10115	10120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014012	TAT	2	6	10272	10277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014012	TCA	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014012	CAT	2	6	10435	10440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014012	ATT	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014012	TCT	2	6	10512	10517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014012	CTT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014012	CTG	2	6	10749	10754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014012	ATC	2	6	10804	10809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014012	TGA	2	6	11002	11007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138783
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152	NC_014012	CTT	2	6	11183	11188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014012	AGC	2	6	11210	11215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014012	ACG	2	6	11325	11330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_014012	TTC	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138784
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226	NC_014012	GGA	2	6	18454	18459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_014012	ATC	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138794
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258	NC_014012	CTC	2	6	21311	21316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138794
259	NC_014012	ATA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138794
260	NC_014012	ATA	2	6	21683	21688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_014012	GCT	2	6	21717	21722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_014012	TCT	2	6	21766	21771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_014012	CAA	2	6	21908	21913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_014012	CCT	2	6	21931	21936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_014012	TAT	2	6	22130	22135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138795
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499	NC_014012	ATA	2	6	40056	40061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014012	ATT	2	6	40098	40103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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