MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 49103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TCT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138772
2	NC_014012	AGA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138772
3	NC_014012	TCG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138772
4	NC_014012	CTA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138772
5	NC_014012	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138773
6	NC_014012	TTA	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138774
7	NC_014012	CGA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
8	NC_014012	ATC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138774
9	NC_014012	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138774
10	NC_014012	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
11	NC_014012	AGA	2	6	1780	1785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138774
12	NC_014012	CAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138774
13	NC_014012	GGT	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138774
14	NC_014012	GTT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
15	NC_014012	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
16	NC_014012	TGG	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
17	NC_014012	CGA	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
18	NC_014012	TGG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
19	NC_014012	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
20	NC_014012	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138775
21	NC_014012	GAG	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
22	NC_014012	GTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138775
23	NC_014012	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138775
24	NC_014012	AAT	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138775
25	NC_014012	TAT	2	6	3123	3128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138775
26	NC_014012	CCA	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138775
27	NC_014012	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138775
28	NC_014012	GCG	2	6	3270	3275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138775
29	NC_014012	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138775
30	NC_014012	GAT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
31	NC_014012	ATG	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138775
32	NC_014012	ATC	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138775
33	NC_014012	AGG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138775
34	NC_014012	CAT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
35	NC_014012	CCA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
36	NC_014012	ATG	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
37	NC_014012	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138776
38	NC_014012	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
39	NC_014012	ATT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138776
40	NC_014012	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
41	NC_014012	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138776
42	NC_014012	TTC	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
43	NC_014012	ATG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
44	NC_014012	CAT	2	6	4153	4158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
45	NC_014012	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
46	NC_014012	CAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
47	NC_014012	GAT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
48	NC_014012	CTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
49	NC_014012	CGG	2	6	4429	4434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
50	NC_014012	ATG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
51	NC_014012	TGT	2	6	4609	4614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138776
52	NC_014012	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
53	NC_014012	TCT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138776
54	NC_014012	CCA	3	9	4671	4679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
55	NC_014012	ATG	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
56	NC_014012	CGG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138776
57	NC_014012	TGG	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
58	NC_014012	TGG	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138776
59	NC_014012	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138776
60	NC_014012	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138776
61	NC_014012	AAG	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138776
62	NC_014012	CCA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
63	NC_014012	GAT	2	6	5392	5397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
64	NC_014012	ACC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138776
65	NC_014012	GAT	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
66	NC_014012	GAG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138776
67	NC_014012	TGA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138776
68	NC_014012	GCA	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138777
69	NC_014012	TCT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
70	NC_014012	GCT	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
71	NC_014012	TGT	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138777
72	NC_014012	CTG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
73	NC_014012	TCT	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138777
74	NC_014012	GGC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138777
75	NC_014012	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138777
76	NC_014012	GAT	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
77	NC_014012	AGC	3	9	6268	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138778
78	NC_014012	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
79	NC_014012	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138778
80	NC_014012	CAT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138778
81	NC_014012	AAT	2	6	6520	6525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138778
82	NC_014012	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138778
83	NC_014012	AGG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138778
84	NC_014012	CTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138778
85	NC_014012	CCG	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138778
86	NC_014012	TGG	2	6	7178	7183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
87	NC_014012	ACT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
88	NC_014012	ATC	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138779
89	NC_014012	GTT	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138779
90	NC_014012	GTG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138779
91	NC_014012	TTA	2	6	7340	7345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138779
92	NC_014012	TGC	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
93	NC_014012	CTG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138780
94	NC_014012	ATC	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138780
95	NC_014012	TAG	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
96	NC_014012	GAT	2	6	8127	8132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138780
97	NC_014012	ACA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138781
98	NC_014012	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138781
99	NC_014012	GAT	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
100	NC_014012	ATC	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
101	NC_014012	CCA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138781
102	NC_014012	TGT	2	6	8559	8564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138781
103	NC_014012	TGG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138781
104	NC_014012	GCT	2	6	8734	8739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138781
105	NC_014012	GTG	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138781
106	NC_014012	CGC	2	6	8856	8861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138781
107	NC_014012	CTT	2	6	8925	8930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138781
108	NC_014012	GAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
109	NC_014012	CTA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
110	NC_014012	ATG	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138781
111	NC_014012	AGA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138781
112	NC_014012	TGT	2	6	9248	9253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138781
113	NC_014012	CAT	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138781
114	NC_014012	GAA	2	6	9431	9436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138782
115	NC_014012	AGT	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138782
116	NC_014012	CCA	2	6	9508	9513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138782
117	NC_014012	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138782
118	NC_014012	AAT	2	6	9537	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138782
119	NC_014012	GCG	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138782
120	NC_014012	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138782
121	NC_014012	TGC	2	6	9711	9716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138782
122	NC_014012	CAG	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138782
123	NC_014012	TCA	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138782
124	NC_014012	AGC	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138782
125	NC_014012	TGA	2	6	11002	11007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138783
126	NC_014012	GCT	2	6	11029	11034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138783
127	NC_014012	TTC	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138784
128	NC_014012	TAG	2	6	11686	11691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138784
129	NC_014012	AGA	2	6	11722	11727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138784
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254	NC_014012	GAC	3	9	26095	26103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138797
255	NC_014012	GCC	2	6	26114	26119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138797
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258	NC_014012	TCT	2	6	26419	26424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138797
259	NC_014012	CTG	2	6	26452	26457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138797
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374	NC_014012	TCT	2	6	35602	35607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
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