MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 7447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TA	3	6	20	25	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014012	AG	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014012	GT	3	6	604	609	0 %	50 %	50 %	0 %	294138772
4	NC_014012	TA	3	6	1113	1118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014012	AT	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	294138774
6	NC_014012	GA	3	6	2069	2074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014012	TA	3	6	3234	3239	50 %	50 %	0 %	0 %	294138775
8	NC_014012	TC	3	6	3262	3267	0 %	50 %	0 %	50 %	294138775
9	NC_014012	AG	3	6	3597	3602	50 %	0 %	50 %	0 %	294138775
10	NC_014012	TA	3	6	3731	3736	50 %	50 %	0 %	0 %	294138776
11	NC_014012	CT	3	6	3783	3788	0 %	50 %	0 %	50 %	294138776
12	NC_014012	GT	3	6	5879	5884	0 %	50 %	50 %	0 %	294138777
13	NC_014012	AT	3	6	6038	6043	50 %	50 %	0 %	0 %	294138777
14	NC_014012	CT	3	6	7644	7649	0 %	50 %	0 %	50 %	294138780
15	NC_014012	TG	3	6	7748	7753	0 %	50 %	50 %	0 %	294138780
16	NC_014012	AT	3	6	8288	8293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014012	TG	3	6	8428	8433	0 %	50 %	50 %	0 %	294138781
18	NC_014012	AT	3	6	8646	8651	50 %	50 %	0 %	0 %	294138781
19	NC_014012	AT	3	6	9180	9185	50 %	50 %	0 %	0 %	294138781
20	NC_014012	CG	3	6	9677	9682	0 %	0 %	50 %	50 %	294138782
21	NC_014012	AT	3	6	10207	10212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014012	GT	3	6	11378	11383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014012	CT	3	6	11698	11703	0 %	50 %	0 %	50 %	294138784
24	NC_014012	TC	3	6	11776	11781	0 %	50 %	0 %	50 %	294138784
25	NC_014012	AC	3	6	11922	11927	50 %	0 %	0 %	50 %	294138784
26	NC_014012	CA	3	6	13049	13054	50 %	0 %	0 %	50 %	294138787
27	NC_014012	CT	3	6	13706	13711	0 %	50 %	0 %	50 %	294138788
28	NC_014012	AG	3	6	13938	13943	50 %	0 %	50 %	0 %	294138788
29	NC_014012	GA	3	6	14482	14487	50 %	0 %	50 %	0 %	294138788
30	NC_014012	AC	3	6	14532	14537	50 %	0 %	0 %	50 %	294138788
31	NC_014012	CT	3	6	14595	14600	0 %	50 %	0 %	50 %	294138788
32	NC_014012	AT	3	6	14656	14661	50 %	50 %	0 %	0 %	294138788
33	NC_014012	GC	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	294138788
34	NC_014012	TG	3	6	15706	15711	0 %	50 %	50 %	0 %	294138788
35	NC_014012	GA	4	8	15769	15776	50 %	0 %	50 %	0 %	294138788
36	NC_014012	TG	3	6	16128	16133	0 %	50 %	50 %	0 %	294138788
37	NC_014012	GA	3	6	16585	16590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014012	AG	3	6	18815	18820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014012	CT	3	6	20486	20491	0 %	50 %	0 %	50 %	294138793
40	NC_014012	GT	3	6	22312	22317	0 %	50 %	50 %	0 %	294138795
41	NC_014012	GT	3	6	22327	22332	0 %	50 %	50 %	0 %	294138795
42	NC_014012	AT	3	6	22869	22874	50 %	50 %	0 %	0 %	294138795
43	NC_014012	GA	3	6	24404	24409	50 %	0 %	50 %	0 %	294138795
44	NC_014012	GA	3	6	24791	24796	50 %	0 %	50 %	0 %	294138796
45	NC_014012	AG	3	6	25409	25414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014012	TC	3	6	27313	27318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014012	TG	3	6	28875	28880	0 %	50 %	50 %	0 %	294138798
48	NC_014012	AT	3	6	29001	29006	50 %	50 %	0 %	0 %	294138798
49	NC_014012	AC	3	6	30311	30316	50 %	0 %	0 %	50 %	294138802
50	NC_014012	CG	3	6	30494	30499	0 %	0 %	50 %	50 %	294138802
51	NC_014012	AG	3	6	31122	31127	50 %	0 %	50 %	0 %	294138802
52	NC_014012	GA	3	6	31676	31681	50 %	0 %	50 %	0 %	294138803
53	NC_014012	AG	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	294138804
54	NC_014012	GA	3	6	34199	34204	50 %	0 %	50 %	0 %	294138804
55	NC_014012	CT	3	6	35813	35818	0 %	50 %	0 %	50 %	294138805
56	NC_014012	AG	3	6	37960	37965	50 %	0 %	50 %	0 %	294138808
57	NC_014012	TG	3	6	38121	38126	0 %	50 %	50 %	0 %	294138808
58	NC_014012	CT	3	6	38275	38280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014012	CT	3	6	38816	38821	0 %	50 %	0 %	50 %	294138809
60	NC_014012	TC	3	6	39062	39067	0 %	50 %	0 %	50 %	294138809
61	NC_014012	AG	3	6	39399	39404	50 %	0 %	50 %	0 %	294138810
62	NC_014012	AT	3	6	39889	39894	50 %	50 %	0 %	0 %	294138810
63	NC_014012	AG	3	6	40626	40631	50 %	0 %	50 %	0 %	294138811
64	NC_014012	AT	3	6	41344	41349	50 %	50 %	0 %	0 %	294138812
65	NC_014012	GC	3	6	44798	44803	0 %	0 %	50 %	50 %	294138814
66	NC_014012	TC	3	6	45462	45467	0 %	50 %	0 %	50 %	294138815
67	NC_014012	CT	3	6	47442	47447	0 %	50 %	0 %	50 %	294138815
68	NC_014012	TG	3	6	48812	48817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014012	AT	3	6	49859	49864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014012	AT	3	6	50070	50075	50 %	50 %	0 %	0 %	294138819
71	NC_014012	TC	3	6	50971	50976	0 %	50 %	0 %	50 %	294138820
72	NC_014012	TG	3	6	51077	51082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014012	TG	3	6	51131	51136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014012	CA	3	6	53102	53107	50 %	0 %	0 %	50 %	294138822
75	NC_014012	TA	3	6	53523	53528	50 %	50 %	0 %	0 %	294138823
76	NC_014012	AG	3	6	55432	55437	50 %	0 %	50 %	0 %	294138823
77	NC_014012	TA	3	6	56216	56221	50 %	50 %	0 %	0 %	294138824
78	NC_014012	CT	3	6	56995	57000	0 %	50 %	0 %	50 %	294138824
79	NC_014012	GT	3	6	57358	57363	0 %	50 %	50 %	0 %	294138825
80	NC_014012	TG	3	6	57720	57725	0 %	50 %	50 %	0 %	294138825
81	NC_014012	TG	3	6	58743	58748	0 %	50 %	50 %	0 %	294138826
82	NC_014012	TG	3	6	59213	59218	0 %	50 %	50 %	0 %	294138826
83	NC_014012	CT	3	6	59725	59730	0 %	50 %	0 %	50 %	294138827
84	NC_014012	GA	3	6	60390	60395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014012	GT	3	6	60489	60494	0 %	50 %	50 %	0 %	294138829
86	NC_014012	TC	3	6	60748	60753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014012	GC	3	6	61663	61668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014012	AC	3	6	63316	63321	50 %	0 %	0 %	50 %	294138830
89	NC_014012	TC	3	6	65711	65716	0 %	50 %	0 %	50 %	294138832
90	NC_014012	CT	3	6	66239	66244	0 %	50 %	0 %	50 %	294138832
91	NC_014012	GC	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	294138832
92	NC_014012	CT	3	6	67922	67927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014012	AT	3	6	68136	68141	50 %	50 %	0 %	0 %	294138835
94	NC_014012	CT	3	6	68551	68556	0 %	50 %	0 %	50 %	294138835
95	NC_014012	GA	3	6	69038	69043	50 %	0 %	50 %	0 %	294138835
96	NC_014012	TA	3	6	69439	69444	50 %	50 %	0 %	0 %	294138836
97	NC_014012	TA	3	6	70291	70296	50 %	50 %	0 %	0 %	294138836
98	NC_014012	TG	3	6	70498	70503	0 %	50 %	50 %	0 %	294138837
99	NC_014012	TA	3	6	71696	71701	50 %	50 %	0 %	0 %	294138838
100	NC_014012	TA	3	6	72912	72917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014012	CT	3	6	73558	73563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014012	AT	3	6	75150	75155	50 %	50 %	0 %	0 %	294138841
103	NC_014012	AC	3	6	75158	75163	50 %	0 %	0 %	50 %	294138841
104	NC_014012	GA	3	6	75213	75218	50 %	0 %	50 %	0 %	294138841
105	NC_014012	AT	3	6	75324	75329	50 %	50 %	0 %	0 %	294138842
106	NC_014012	AC	3	6	75332	75337	50 %	0 %	0 %	50 %	294138842
107	NC_014012	AT	3	6	75503	75508	50 %	50 %	0 %	0 %	294138843
108	NC_014012	AC	3	6	75511	75516	50 %	0 %	0 %	50 %	294138843
109	NC_014012	GA	3	6	75566	75571	50 %	0 %	50 %	0 %	294138843
110	NC_014012	AC	3	6	75770	75775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014012	CA	3	6	75863	75868	50 %	0 %	0 %	50 %	294138844
112	NC_014012	TG	3	6	77884	77889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014012	GT	3	6	78485	78490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014012	AC	3	6	79307	79312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014012	AC	3	6	79476	79481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014012	CA	3	6	79660	79665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014012	AC	3	6	80882	80887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014012	GA	3	6	81362	81367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014012	GA	3	6	81601	81606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014012	CT	3	6	81682	81687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014012	GT	3	6	82795	82800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014012	TG	3	6	85343	85348	0 %	50 %	50 %	0 %	294138848
123	NC_014012	TA	3	6	85780	85785	50 %	50 %	0 %	0 %	294138848
124	NC_014012	TA	3	6	86298	86303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014012	AG	3	6	86706	86711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014012	TA	3	6	86747	86752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014012	TA	3	6	86755	86760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014012	AT	3	6	86788	86793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014012	TG	3	6	87229	87234	0 %	50 %	50 %	0 %	294138849
130	NC_014012	GT	3	6	87831	87836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014012	AC	3	6	88653	88658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014012	AC	3	6	88822	88827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014012	CA	3	6	89006	89011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014012	AC	3	6	90210	90215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014012	GA	3	6	90690	90695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014012	GA	3	6	90929	90934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014012	CT	3	6	91010	91015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014012	GT	3	6	92123	92128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014012	AG	3	6	93779	93784	50 %	0 %	50 %	0 %	294138851
140	NC_014012	GA	4	8	94092	94099	50 %	0 %	50 %	0 %	294138851
141	NC_014012	CG	3	6	94661	94666	0 %	0 %	50 %	50 %	294138852
142	NC_014012	TC	3	6	95197	95202	0 %	50 %	0 %	50 %	294138852
143	NC_014012	AT	3	6	95349	95354	50 %	50 %	0 %	0 %	294138852
144	NC_014012	TA	3	6	95696	95701	50 %	50 %	0 %	0 %	294138852
145	NC_014012	AT	3	6	97528	97533	50 %	50 %	0 %	0 %	294138853
146	NC_014012	AT	3	6	97730	97735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014012	AG	3	6	98428	98433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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