MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aminobacterium colombiense DSM 12261 chromosome

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014011	TTTCAA	2	12	20436	20447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014011	CTCTTC	2	12	22096	22107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014011	TAAAAA	2	12	84159	84170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014011	TTGTCA	2	12	94250	94261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014011	ACTTTG	2	12	101471	101482	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014011	ATTCCT	2	12	124980	124991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014011	ATTATG	2	12	255684	255695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014011	CTTTTT	2	12	299698	299709	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014011	GGATAT	2	12	330462	330473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014011	TGTCAA	2	12	337761	337772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014011	CTTTAG	2	12	358000	358011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014011	TGCTTT	2	12	397215	397226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014011	TTTTAT	2	12	408070	408081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014011	GGGCAG	2	12	430903	430914	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014011	GTTCGA	2	12	455442	455453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014011	AATATT	2	12	477776	477787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014011	ATATAA	2	12	510170	510181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014011	TTTACG	2	12	540192	540203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014011	TGTTCT	2	12	556042	556053	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014011	AATTTG	2	12	617394	617405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014011	TAAATA	2	12	622690	622701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014011	ACTTAT	2	12	713755	713766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014011	ACTATA	6	36	732101	732136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014011	TGATGC	2	12	877356	877367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014011	GCTCTC	2	12	898350	898361	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014011	CAAGGG	2	12	955423	955434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014011	ACTGTA	2	12	980961	980972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014011	GCTTTT	2	12	986073	986084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014011	GTTTTT	2	12	1153933	1153944	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014011	AATTCG	3	18	1163763	1163780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014011	AATTTA	2	12	1210250	1210261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014011	TGTTAT	2	12	1234132	1234143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014011	TAAGAA	2	12	1249177	1249188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014011	CTCCAC	2	12	1258975	1258986	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014011	TTTGTA	2	12	1312914	1312925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014011	ATTATC	2	12	1335468	1335479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014011	AAAAAC	2	12	1342490	1342501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014011	AAATAT	2	12	1344800	1344811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014011	ATTTCT	2	12	1372747	1372758	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014011	GAAAGG	2	12	1547351	1547362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014011	GTCTTC	2	12	1582978	1582989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014011	TTAATA	2	12	1706372	1706383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014011	TTAAAA	2	12	1718206	1718217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014011	AAAGAA	2	12	1837622	1837633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014011	TTATTT	2	12	1878719	1878730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014011	ACAAAT	2	12	1905284	1905295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014011	GTAAAT	2	12	1905329	1905340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014011	AAAATT	2	12	1929940	1929951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014011	CTCCTT	2	12	1956176	1956187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014011	CTTCCG	2	12	1956620	1956631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014011	ACGGCA	2	12	1957500	1957511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.