MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Aminobacterium colombiense DSM 12261 chromosome

Total Repeats: 580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014011	GGCGAT	2	12	1702021	1702032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294102641
502	NC_014011	TTAATA	2	12	1706372	1706383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014011	GCGGCA	2	12	1711902	1711913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294102651
504	NC_014011	CACATC	2	12	1714281	1714292	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294102653
505	NC_014011	TTAAAA	2	12	1718206	1718217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014011	CAATAT	2	12	1723896	1723907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294102663
507	NC_014011	CTCGCT	2	12	1731581	1731592	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294102670
508	NC_014011	TGCCGT	2	12	1733024	1733035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294102672
509	NC_014011	AAAGGA	2	12	1734919	1734930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294102674
510	NC_014011	CAAAGC	2	12	1743203	1743214	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	294102680
511	NC_014011	GCAATA	2	12	1746131	1746142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294102683
512	NC_014011	GTATGG	2	12	1747455	1747466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294102683
513	NC_014011	GAACAG	2	12	1762610	1762621	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294102695
514	NC_014011	TGCCCT	2	12	1764040	1764051	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294102696
515	NC_014011	TGGAGC	2	12	1773067	1773078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294102704
516	NC_014011	AGCTAT	2	12	1773827	1773838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294102706
517	NC_014011	AAAAGC	2	12	1774632	1774643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294102707
518	NC_014011	CCCCGG	2	12	1775331	1775342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294102707
519	NC_014011	TAAAAT	2	12	1779342	1779353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294102710
520	NC_014011	GATTAA	2	12	1783981	1783992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294102715
521	NC_014011	CAGCAC	2	12	1785171	1785182	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294102716
522	NC_014011	TAGCGG	2	12	1787072	1787083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294102718
523	NC_014011	TGCCAA	2	12	1789766	1789777	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294102724
524	NC_014011	AAGTCG	2	12	1792254	1792265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294102726
525	NC_014011	CAGCGG	2	12	1793853	1793864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294102728
526	NC_014011	GTTTTT	2	12	1801598	1801609	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294102735
527	NC_014011	TTTAAG	2	12	1803915	1803926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294102736
528	NC_014011	AATATC	2	12	1805925	1805936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294102738
529	NC_014011	CGTAAA	2	12	1818659	1818670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294102749
530	NC_014011	CCTGGG	2	12	1823965	1823976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294102755
531	NC_014011	GCTGGA	2	12	1825056	1825067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294102756
532	NC_014011	TTTCTT	2	12	1826654	1826665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294102757
533	NC_014011	CCCTTC	2	12	1828123	1828134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294102758
534	NC_014011	CAATCT	2	12	1828600	1828611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294102759
535	NC_014011	CTGGAA	2	12	1829153	1829164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294102759
536	NC_014011	AAAGAA	2	12	1837622	1837633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014011	TTCTGT	2	12	1848172	1848183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294102778
538	NC_014011	CCCTTT	2	12	1850893	1850904	0 %	50 %	0 %	50 %	294102780
539	NC_014011	TATCTC	2	12	1851013	1851024	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294102780
540	NC_014011	CATCGA	2	12	1851052	1851063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294102780
541	NC_014011	CATACC	2	12	1855210	1855221	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294102783
542	NC_014011	AGCTTG	2	12	1855610	1855621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294102783
543	NC_014011	GGAAGC	2	12	1855777	1855788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294102783
544	NC_014011	TATGAA	2	12	1856020	1856031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294102783
545	NC_014011	TTCTCT	2	12	1861677	1861688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294102787
546	NC_014011	TGGATT	2	12	1865068	1865079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294102789
547	NC_014011	TTTTCA	2	12	1874807	1874818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294102799
548	NC_014011	GAAAAG	2	12	1875100	1875111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294102799
549	NC_014011	TTATTT	2	12	1878719	1878730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014011	ATCAAC	2	12	1881187	1881198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294102806
551	NC_014011	AAGCTG	2	12	1886403	1886414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294102811
552	NC_014011	ACATGG	2	12	1888568	1888579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294102813
553	NC_014011	GATAGA	2	12	1891385	1891396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294102816
554	NC_014011	TAACAG	2	12	1899362	1899373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294102822
555	NC_014011	TAGGCG	2	12	1901290	1901301	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294102824
556	NC_014011	TTTTAT	2	12	1904724	1904735	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	294102827
557	NC_014011	ACAAAT	2	12	1905284	1905295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_014011	GTAAAT	2	12	1905329	1905340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014011	AAGAGC	2	12	1905888	1905899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294102830
560	NC_014011	CTTTTT	2	12	1908098	1908109	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294102833
561	NC_014011	CTATCT	2	12	1921915	1921926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294102844
562	NC_014011	TTTTTC	2	12	1922717	1922728	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294102845
563	NC_014011	TAATCG	2	12	1923428	1923439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294102845
564	NC_014011	GCTGGT	2	12	1928483	1928494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294102850
565	NC_014011	AAAATT	2	12	1929940	1929951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014011	TTATAT	2	12	1936621	1936632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294102857
567	NC_014011	GGGAAA	2	12	1939920	1939931	50 %	0 %	50 %	0 %	294102859
568	NC_014011	CTCACA	2	12	1943510	1943521	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294102864
569	NC_014011	TATGAA	2	12	1944303	1944314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294102864
570	NC_014011	CTCCTT	2	12	1956176	1956187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_014011	CTTCCG	2	12	1956620	1956631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
572	NC_014011	ACGGCA	2	12	1957500	1957511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014011	CGGTGG	2	12	1959494	1959505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294102872
574	NC_014011	AGAGGG	2	12	1967418	1967429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294102879
575	NC_014011	GCTTCT	2	12	1967960	1967971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294102880
576	NC_014011	GATATA	2	12	1973986	1973997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294102885
577	NC_014011	ATCTTC	2	12	1976121	1976132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294102888
578	NC_014011	CTGAAT	2	12	1977717	1977728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294102889
579	NC_014011	AAAAAG	2	12	1978978	1978989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294102890
580	NC_014011	CCGCTG	2	12	1980283	1980294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294102891

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