MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aminobacterium colombiense DSM 12261 chromosome

Total Repeats: 1199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014011	CTTTT	2	10	1349	1358	0 %	80 %	0 %	20 %	294101016
2	NC_014011	TTGAA	2	10	2178	2187	40 %	40 %	20 %	0 %	294101017
3	NC_014011	GGCTG	2	10	3697	3706	0 %	20 %	60 %	20 %	294101018
4	NC_014011	AAGTA	2	10	5572	5581	60 %	20 %	20 %	0 %	294101019
5	NC_014011	CTTTG	2	10	5990	5999	0 %	60 %	20 %	20 %	294101020
6	NC_014011	ATTTT	2	10	6948	6957	20 %	80 %	0 %	0 %	294101022
7	NC_014011	TTGGT	2	10	8372	8381	0 %	60 %	40 %	0 %	294101024
8	NC_014011	ATTTT	2	10	8564	8573	20 %	80 %	0 %	0 %	294101024
9	NC_014011	CCAGG	2	10	8660	8669	20 %	0 %	40 %	40 %	294101024
10	NC_014011	GATAT	2	10	13689	13698	40 %	40 %	20 %	0 %	294101029
11	NC_014011	CTTAC	2	10	13723	13732	20 %	40 %	0 %	40 %	294101029
12	NC_014011	TCACC	2	10	14469	14478	20 %	20 %	0 %	60 %	294101031
13	NC_014011	TCTCC	2	10	14644	14653	0 %	40 %	0 %	60 %	294101031
14	NC_014011	TCCTG	2	10	18536	18545	0 %	40 %	20 %	40 %	294101037
15	NC_014011	ACGAA	2	10	22159	22168	60 %	0 %	20 %	20 %	294101041
16	NC_014011	AAGGG	2	10	24445	24454	40 %	0 %	60 %	0 %	294101043
17	NC_014011	GCCTT	2	10	26352	26361	0 %	40 %	20 %	40 %	294101046
18	NC_014011	ACGTA	2	10	26573	26582	40 %	20 %	20 %	20 %	294101046
19	NC_014011	CTTTT	2	10	26784	26793	0 %	80 %	0 %	20 %	294101046
20	NC_014011	ATAGC	2	10	28393	28402	40 %	20 %	20 %	20 %	294101047
21	NC_014011	CGATT	2	10	30286	30295	20 %	40 %	20 %	20 %	294101049
22	NC_014011	TCTAT	2	10	31125	31134	20 %	60 %	0 %	20 %	294101051
23	NC_014011	TTCCT	2	10	34209	34218	0 %	60 %	0 %	40 %	294101054
24	NC_014011	CCTGA	2	10	34925	34934	20 %	20 %	20 %	40 %	294101054
25	NC_014011	GAAAG	2	10	36432	36441	60 %	0 %	40 %	0 %	294101055
26	NC_014011	CTCCA	2	10	38681	38690	20 %	20 %	0 %	60 %	294101058
27	NC_014011	ATTTT	2	10	42079	42088	20 %	80 %	0 %	0 %	294101062
28	NC_014011	TGCAG	2	10	43156	43165	20 %	20 %	40 %	20 %	294101063
29	NC_014011	AAGCG	2	10	45998	46007	40 %	0 %	40 %	20 %	294101066
30	NC_014011	AAATG	2	10	46384	46393	60 %	20 %	20 %	0 %	294101067
31	NC_014011	GAAAA	2	10	46619	46628	80 %	0 %	20 %	0 %	294101067
32	NC_014011	AATGA	2	10	47454	47463	60 %	20 %	20 %	0 %	294101067
33	NC_014011	CAGGG	2	10	48156	48165	20 %	0 %	60 %	20 %	294101068
34	NC_014011	TCGTT	2	10	49199	49208	0 %	60 %	20 %	20 %	294101069
35	NC_014011	GCATC	2	10	49538	49547	20 %	20 %	20 %	40 %	294101070
36	NC_014011	CTTTT	2	10	50390	50399	0 %	80 %	0 %	20 %	294101071
37	NC_014011	ATTTT	2	10	51234	51243	20 %	80 %	0 %	0 %	294101071
38	NC_014011	TGTGC	2	10	52457	52466	0 %	40 %	40 %	20 %	294101073
39	NC_014011	CAGTT	2	10	54030	54039	20 %	40 %	20 %	20 %	294101073
40	NC_014011	GGGAA	2	10	54211	54220	40 %	0 %	60 %	0 %	294101074
41	NC_014011	AAAAG	2	10	55212	55221	80 %	0 %	20 %	0 %	294101074
42	NC_014011	TTTTC	2	10	60576	60585	0 %	80 %	0 %	20 %	294101083
43	NC_014011	CCAGG	2	10	61803	61812	20 %	0 %	40 %	40 %	294101083
44	NC_014011	TGAAA	2	10	64246	64255	60 %	20 %	20 %	0 %	294101085
45	NC_014011	GGCAG	2	10	64936	64945	20 %	0 %	60 %	20 %	294101086
46	NC_014011	GGGAA	2	10	65149	65158	40 %	0 %	60 %	0 %	294101086
47	NC_014011	AAAGA	2	10	65397	65406	80 %	0 %	20 %	0 %	294101086
48	NC_014011	CTATA	2	10	68787	68796	40 %	40 %	0 %	20 %	294101090
49	NC_014011	CCAAG	2	10	68999	69008	40 %	0 %	20 %	40 %	294101090
50	NC_014011	GGAGT	2	10	71080	71089	20 %	20 %	60 %	0 %	294101094
51	NC_014011	AGTAC	2	10	72403	72412	40 %	20 %	20 %	20 %	294101094
52	NC_014011	TCCTC	2	10	72456	72465	0 %	40 %	0 %	60 %	294101094
53	NC_014011	AAGAG	2	10	73034	73043	60 %	0 %	40 %	0 %	294101095
54	NC_014011	TTTCT	2	10	74217	74226	0 %	80 %	0 %	20 %	294101097
55	NC_014011	ATCGT	2	10	76147	76156	20 %	40 %	20 %	20 %	294101099
56	NC_014011	GAGAA	2	10	78040	78049	60 %	0 %	40 %	0 %	294101101
57	NC_014011	TTTGC	2	10	78672	78681	0 %	60 %	20 %	20 %	294101102
58	NC_014011	GCAAA	2	10	79376	79385	60 %	0 %	20 %	20 %	294101102
59	NC_014011	TTCCT	2	10	80353	80362	0 %	60 %	0 %	40 %	294101104
60	NC_014011	TCCAC	2	10	83851	83860	20 %	20 %	0 %	60 %	294101108
61	NC_014011	TTCCA	2	10	84691	84700	20 %	40 %	0 %	40 %	294101109
62	NC_014011	GGTGG	2	10	86474	86483	0 %	20 %	80 %	0 %	294101111
63	NC_014011	CATGA	2	10	86651	86660	40 %	20 %	20 %	20 %	294101111
64	NC_014011	TGGTC	2	10	89461	89470	0 %	40 %	40 %	20 %	294101114
65	NC_014011	TTTCT	2	10	90581	90590	0 %	80 %	0 %	20 %	294101115
66	NC_014011	GTGTC	2	10	91649	91658	0 %	40 %	40 %	20 %	294101115
67	NC_014011	AAAAG	2	10	92536	92545	80 %	0 %	20 %	0 %	294101117
68	NC_014011	ATGTC	2	10	94573	94582	20 %	40 %	20 %	20 %	294101119
69	NC_014011	AGATA	2	10	94835	94844	60 %	20 %	20 %	0 %	294101119
70	NC_014011	GGGGA	2	10	96982	96991	20 %	0 %	80 %	0 %	294101121
71	NC_014011	TAGTG	2	10	97499	97508	20 %	40 %	40 %	0 %	294101122
72	NC_014011	CAGCC	2	10	97634	97643	20 %	0 %	20 %	60 %	294101122
73	NC_014011	CGTGA	2	10	98935	98944	20 %	20 %	40 %	20 %	294101124
74	NC_014011	CTTTT	2	10	100598	100607	0 %	80 %	0 %	20 %	294101127
75	NC_014011	TAACA	2	10	102506	102515	60 %	20 %	0 %	20 %	294101128
76	NC_014011	GTAGC	2	10	108035	108044	20 %	20 %	40 %	20 %	294101132
77	NC_014011	GTTCT	2	10	116658	116667	0 %	60 %	20 %	20 %	294101137
78	NC_014011	GTATC	2	10	118068	118077	20 %	40 %	20 %	20 %	294101139
79	NC_014011	ACGTC	2	10	118422	118431	20 %	20 %	20 %	40 %	294101139
80	NC_014011	ATCGC	2	10	121417	121426	20 %	20 %	20 %	40 %	294101141
81	NC_014011	ATCTA	2	10	121502	121511	40 %	40 %	0 %	20 %	294101141
82	NC_014011	AGAAT	2	10	125508	125517	60 %	20 %	20 %	0 %	294101143
83	NC_014011	GAACC	2	10	128457	128466	40 %	0 %	20 %	40 %	294101146
84	NC_014011	AGAAA	2	10	129934	129943	80 %	0 %	20 %	0 %	294101147
85	NC_014011	ACAGG	2	10	130327	130336	40 %	0 %	40 %	20 %	294101148
86	NC_014011	GCTGT	2	10	130358	130367	0 %	40 %	40 %	20 %	294101148
87	NC_014011	CTCTT	2	10	132364	132373	0 %	60 %	0 %	40 %	294101150
88	NC_014011	TCTTT	2	10	133549	133558	0 %	80 %	0 %	20 %	294101151
89	NC_014011	TCTCT	2	10	134153	134162	0 %	60 %	0 %	40 %	294101151
90	NC_014011	ATTTT	2	10	134977	134986	20 %	80 %	0 %	0 %	294101152
91	NC_014011	AGAAA	2	10	140044	140053	80 %	0 %	20 %	0 %	294101157
92	NC_014011	CTTTA	2	10	146511	146520	20 %	60 %	0 %	20 %	294101162
93	NC_014011	TTCCA	2	10	147139	147148	20 %	40 %	0 %	40 %	294101164
94	NC_014011	TCCTC	2	10	149545	149554	0 %	40 %	0 %	60 %	294101165
95	NC_014011	CAAGG	2	10	150592	150601	40 %	0 %	40 %	20 %	294101165
96	NC_014011	TGGCC	2	10	151043	151052	0 %	20 %	40 %	40 %	294101166
97	NC_014011	GGAAA	2	10	154364	154373	60 %	0 %	40 %	0 %	294101168
98	NC_014011	TCCTT	2	10	155330	155339	0 %	60 %	0 %	40 %	294101169
99	NC_014011	ACGCA	2	10	164136	164145	40 %	0 %	20 %	40 %	294101180
100	NC_014011	GAGAG	2	10	165420	165429	40 %	0 %	60 %	0 %	294101181
101	NC_014011	AAGGA	2	10	166967	166976	60 %	0 %	40 %	0 %	294101182
102	NC_014011	GCTTT	2	10	167250	167259	0 %	60 %	20 %	20 %	294101183
103	NC_014011	TGCTC	2	10	168447	168456	0 %	40 %	20 %	40 %	294101183
104	NC_014011	ACGAA	2	10	170426	170435	60 %	0 %	20 %	20 %	294101184
105	NC_014011	GGAAG	2	10	171043	171052	40 %	0 %	60 %	0 %	294101184
106	NC_014011	GCCTT	2	10	171178	171187	0 %	40 %	20 %	40 %	294101184
107	NC_014011	ATTTC	2	10	171743	171752	20 %	60 %	0 %	20 %	294101184
108	NC_014011	CCGTC	2	10	173119	173128	0 %	20 %	20 %	60 %	294101184
109	NC_014011	CCGGG	2	10	175058	175067	0 %	0 %	60 %	40 %	294101185
110	NC_014011	TGAAG	2	10	184394	184403	40 %	20 %	40 %	0 %	294101192
111	NC_014011	TTTGG	2	10	186790	186799	0 %	60 %	40 %	0 %	294101193
112	NC_014011	ATGGC	2	10	188007	188016	20 %	20 %	40 %	20 %	294101195
113	NC_014011	ATCTC	2	10	189260	189269	20 %	40 %	0 %	40 %	294101197
114	NC_014011	TTTCT	2	10	192530	192539	0 %	80 %	0 %	20 %	294101201
115	NC_014011	ATGGA	2	10	193982	193991	40 %	20 %	40 %	0 %	294101202
116	NC_014011	GCTTG	2	10	195485	195494	0 %	40 %	40 %	20 %	294101203
117	NC_014011	GTTCT	2	10	196179	196188	0 %	60 %	20 %	20 %	294101205
118	NC_014011	CATGT	2	10	197134	197143	20 %	40 %	20 %	20 %	294101206
119	NC_014011	AAGAA	2	10	198300	198309	80 %	0 %	20 %	0 %	294101207
120	NC_014011	ATCTT	2	10	199077	199086	20 %	60 %	0 %	20 %	294101207
121	NC_014011	GGAAA	2	10	200272	200281	60 %	0 %	40 %	0 %	294101208
122	NC_014011	CATTC	2	10	202447	202456	20 %	40 %	0 %	40 %	294101210
123	NC_014011	GGGTT	2	10	204787	204796	0 %	40 %	60 %	0 %	294101212
124	NC_014011	AGTGG	2	10	208277	208286	20 %	20 %	60 %	0 %	294101215
125	NC_014011	TGGAG	2	10	209569	209578	20 %	20 %	60 %	0 %	294101216
126	NC_014011	TTGTC	2	10	218357	218366	0 %	60 %	20 %	20 %	294101222
127	NC_014011	ACGCT	2	10	218707	218716	20 %	20 %	20 %	40 %	294101222
128	NC_014011	TCCCA	2	10	220569	220578	20 %	20 %	0 %	60 %	294101223
129	NC_014011	CCTTT	2	10	222604	222613	0 %	60 %	0 %	40 %	294101225
130	NC_014011	GAAAA	2	10	222776	222785	80 %	0 %	20 %	0 %	294101225
131	NC_014011	GTTCA	2	10	225538	225547	20 %	40 %	20 %	20 %	294101228
132	NC_014011	ATTCT	2	10	226206	226215	20 %	60 %	0 %	20 %	294101228
133	NC_014011	GAGGC	2	10	226853	226862	20 %	0 %	60 %	20 %	294101229
134	NC_014011	TGGAA	2	10	230519	230528	40 %	20 %	40 %	0 %	294101233
135	NC_014011	GTCTT	2	10	231331	231340	0 %	60 %	20 %	20 %	294101235
136	NC_014011	CTTTT	2	10	236118	236127	0 %	80 %	0 %	20 %	294101239
137	NC_014011	GTTTT	2	10	237363	237372	0 %	80 %	20 %	0 %	294101240
138	NC_014011	TCGGT	2	10	239055	239064	0 %	40 %	40 %	20 %	294101241
139	NC_014011	GGGAG	2	10	239845	239854	20 %	0 %	80 %	0 %	294101242
140	NC_014011	GAAAA	2	10	240045	240054	80 %	0 %	20 %	0 %	294101242
141	NC_014011	TGAAA	2	10	242675	242684	60 %	20 %	20 %	0 %	294101243
142	NC_014011	GGCAA	2	10	243357	243366	40 %	0 %	40 %	20 %	294101243
143	NC_014011	CCAGG	2	10	245401	245410	20 %	0 %	40 %	40 %	294101244
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149	NC_014011	TTTTC	2	10	252518	252527	0 %	80 %	0 %	20 %	294101248
150	NC_014011	TAATG	2	10	257212	257221	40 %	40 %	20 %	0 %	294101252
151	NC_014011	TGGCA	2	10	261521	261530	20 %	20 %	40 %	20 %	294101256
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153	NC_014011	CTCAT	2	10	263545	263554	20 %	40 %	0 %	40 %	294101259
154	NC_014011	TTTTG	2	10	263816	263825	0 %	80 %	20 %	0 %	294101259
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156	NC_014011	TGGAT	2	10	265296	265305	20 %	40 %	40 %	0 %	294101260
157	NC_014011	TTTTC	2	10	265737	265746	0 %	80 %	0 %	20 %	294101260
158	NC_014011	CTATG	2	10	268019	268028	20 %	40 %	20 %	20 %	294101263
159	NC_014011	TCCAT	2	10	277055	277064	20 %	40 %	0 %	40 %	294101272
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162	NC_014011	GAACA	2	10	283488	283497	60 %	0 %	20 %	20 %	294101281
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164	NC_014011	ACCCA	2	10	285084	285093	40 %	0 %	0 %	60 %	294101283
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167	NC_014011	CAGAT	2	10	289543	289552	40 %	20 %	20 %	20 %	294101287
168	NC_014011	TAACA	2	10	293395	293404	60 %	20 %	0 %	20 %	294101290
169	NC_014011	AAGAG	2	10	294709	294718	60 %	0 %	40 %	0 %	294101290
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175	NC_014011	TGCTT	2	10	306654	306663	0 %	60 %	20 %	20 %	294101298
176	NC_014011	TCAGG	2	10	307401	307410	20 %	20 %	40 %	20 %	294101299
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249	NC_014011	GCGGT	2	10	416885	416894	0 %	20 %	60 %	20 %	294101403
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251	NC_014011	ATTCA	2	10	426763	426772	40 %	40 %	0 %	20 %	294101407
252	NC_014011	ACGTG	2	10	426781	426790	20 %	20 %	40 %	20 %	294101407
253	NC_014011	TGGCT	2	10	429692	429701	0 %	40 %	40 %	20 %	294101407
254	NC_014011	GATCA	2	10	430377	430386	40 %	20 %	20 %	20 %	294101409
255	NC_014011	CCATG	2	10	430499	430508	20 %	20 %	20 %	40 %	294101409
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258	NC_014011	TTTCT	2	10	433070	433079	0 %	80 %	0 %	20 %	294101412
259	NC_014011	CGTGC	2	10	436654	436663	0 %	20 %	40 %	40 %	294101415
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262	NC_014011	TTTTC	2	10	441786	441795	0 %	80 %	0 %	20 %	294101419
263	NC_014011	TGGCT	2	10	446637	446646	0 %	40 %	40 %	20 %	294101424
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392	NC_014011	GTTTT	2	10	631687	631696	0 %	80 %	20 %	0 %	294101603
393	NC_014011	TGGTG	2	10	632094	632103	0 %	40 %	60 %	0 %	294101603
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