MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Puniceispirillum marinum IMCC1322 chromosome

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014010	AATTAA	2	12	71346	71357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014010	AATTTT	2	12	74861	74872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014010	TGGACA	2	12	93347	93358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014010	TGTGAG	2	12	384117	384128	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014010	TGCCTT	2	12	413360	413371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014010	AGGCGT	2	12	422878	422889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014010	TGCCAT	2	12	422942	422953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014010	TTCATA	2	12	509918	509929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014010	GTTTAA	2	12	521209	521220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014010	ACAATT	2	12	599442	599453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014010	ATCATG	2	12	610655	610666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014010	AAATTT	2	12	628790	628801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014010	TTATCA	2	12	631772	631783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014010	AATTAA	2	12	642009	642020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014010	ATTGGC	2	12	701641	701652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014010	TGACTT	2	12	741938	741949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014010	TAGATG	2	12	754660	754671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014010	ATCAAA	2	12	819898	819909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014010	AATTTT	2	12	880178	880189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014010	TCATAT	2	12	1055162	1055173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014010	TGGATT	2	12	1068744	1068755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014010	GAACAT	2	12	1069190	1069201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014010	AATTAA	2	12	1097442	1097453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014010	GCCTCT	2	12	1115142	1115153	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014010	CCCTAG	2	12	1242614	1242625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014010	CATACA	6	36	1274075	1274110	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014010	TAAGCC	2	12	1306356	1306367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014010	AAGATA	2	12	1309504	1309515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014010	GATAAG	2	12	1309754	1309765	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014010	ACCATT	2	12	1322860	1322871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014010	TGATGG	2	12	1323165	1323176	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014010	CGGTCA	2	12	1324002	1324013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014010	GGTGAA	3	18	1324195	1324212	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014010	TTATCA	2	12	1324691	1324702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014010	CGGATG	2	12	1324757	1324768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014010	CAGCGG	2	12	1326789	1326800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014010	ATTCCC	2	12	1327308	1327319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014010	CAAGGT	2	12	1329373	1329384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014010	TCACCC	2	12	1330346	1330357	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014010	GATCGT	2	12	1332181	1332192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014010	CCGTGA	2	12	1334565	1334576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014010	TCACCG	2	12	1336578	1336589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014010	GATGGT	2	12	1340794	1340805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014010	GGTAAT	2	12	1340911	1340922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014010	ACCCTG	2	12	1342627	1342638	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014010	TTCGGA	2	12	1343323	1343334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014010	GAGTTT	2	12	1344821	1344832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014010	AAAGCA	2	12	1391630	1391641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014010	TTGCGA	2	12	1402903	1402914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014010	ATCAAA	2	12	1415050	1415061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014010	TTTAAT	2	12	1428913	1428924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014010	TTTTGT	2	12	1477727	1477738	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014010	GTGTTG	2	12	1497670	1497681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014010	TGAAGA	2	12	1507864	1507875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014010	CTGAAA	2	12	1612027	1612038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014010	TACTAA	2	12	1626711	1626722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014010	GCATTC	2	12	1644658	1644669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014010	TAGTGA	2	12	1653830	1653841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014010	CATCTG	2	12	1658365	1658376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014010	CCAATA	2	12	1677458	1677469	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014010	ATATGG	2	12	1721007	1721018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014010	AAGGTG	2	12	1741142	1741153	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014010	TTAAGT	2	12	1785909	1785920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014010	GGCTTT	2	12	1840475	1840486	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014010	GTTTGG	2	12	1849743	1849754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014010	TATTTT	2	12	1862187	1862198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014010	ACTCTA	2	12	1909981	1909992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014010	AGAATT	2	12	1910192	1910203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014010	TAGTAT	2	12	1929635	1929646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014010	GATTAA	2	12	1961555	1961566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014010	AGAGGG	2	12	1965328	1965339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014010	ATCTGT	2	12	1970745	1970756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014010	CCTGAT	2	12	2052987	2052998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014010	ATTTAT	2	12	2075490	2075501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014010	CAATCA	2	12	2092513	2092524	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014010	GTAAAA	2	12	2172136	2172147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014010	AAGATG	2	12	2196676	2196687	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014010	CCTGCC	2	12	2248742	2248753	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014010	GAAACG	2	12	2272547	2272558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014010	TATTTG	2	12	2276853	2276864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014010	CCACGT	2	12	2278129	2278140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014010	AAACAG	2	12	2391316	2391327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014010	AATTAT	2	12	2412729	2412740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014010	AGTCAG	2	12	2433212	2433223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014010	ATCATG	2	12	2452593	2452604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014010	AGCAAA	2	12	2522448	2522459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014010	ATCCTG	2	12	2569599	2569610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014010	GAAAAC	2	12	2581509	2581520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014010	GGCACA	2	12	2595085	2595096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014010	TGGGAA	2	12	2634375	2634386	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014010	AAACAA	2	12	2636571	2636582	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014010	CAATTT	2	12	2677949	2677960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014010	ACAAAA	2	12	2684139	2684150	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014010	TGCCTT	2	12	2698811	2698822	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014010	AATGTT	2	12	2728804	2728815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014010	TAATTT	2	12	2741446	2741457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.