MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014009	CCA	2	6	26	31	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294057976
2	NC_014009	TAC	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294057976
3	NC_014009	ATA	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294057976
4	NC_014009	TGT	2	6	162	167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294057976
5	NC_014009	GTT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294057976
6	NC_014009	GTC	3	9	373	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294057976
7	NC_014009	CGC	2	6	433	438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057976
8	NC_014009	CCT	2	6	487	492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294057976
9	NC_014009	CAG	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294057976
10	NC_014009	CAT	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294057977
11	NC_014009	CCG	2	6	775	780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057977
12	NC_014009	GCA	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294057977
13	NC_014009	GAA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294057977
14	NC_014009	GCC	2	6	1054	1059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057977
15	NC_014009	GAA	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294057978
16	NC_014009	ATT	2	6	1263	1268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294057978
17	NC_014009	CAA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294057978
18	NC_014009	CAT	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294057978
19	NC_014009	CGG	2	6	1487	1492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057978
20	NC_014009	CAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294057978
21	NC_014009	TGT	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294057978
22	NC_014009	GAT	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294057978
23	NC_014009	CAC	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294057978
24	NC_014009	CGG	2	6	1748	1753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057978
25	NC_014009	CCG	2	6	1900	1905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057978
26	NC_014009	CTG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294057979
27	NC_014009	CGG	2	6	2455	2460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057979
28	NC_014009	GCC	2	6	2499	2504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
29	NC_014009	CGA	2	6	2635	2640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294057979
30	NC_014009	CCG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
31	NC_014009	CGC	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
32	NC_014009	CGC	2	6	2875	2880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
33	NC_014009	GGC	2	6	2932	2937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057979
34	NC_014009	CGT	3	9	2939	2947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294057979
35	NC_014009	TCG	2	6	3072	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294057979
36	NC_014009	GCC	2	6	3180	3185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
37	NC_014009	GCC	3	9	3303	3311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057979
38	NC_014009	CGG	2	6	3325	3330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057979
39	NC_014009	ATC	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294057980
40	NC_014009	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057980
41	NC_014009	CTC	2	6	3682	3687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294057980
42	NC_014009	GGC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057980
43	NC_014009	CCG	2	6	3800	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057980
44	NC_014009	GCA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294057981
45	NC_014009	CGG	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294057981
46	NC_014009	GAT	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294057981
47	NC_014009	TGG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294057981
48	NC_014009	GCC	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057981
49	NC_014009	CGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057981
50	NC_014009	CGA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294057982
51	NC_014009	GCC	2	6	4319	4324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057982
52	NC_014009	CCA	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294057982
53	NC_014009	GCC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057983
54	NC_014009	CCG	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057983
55	NC_014009	CGC	2	6	4733	4738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294057983

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.