MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014008	CGCTTT	2	12	210	221	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014008	AGTGAG	4	24	4998	5021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014008	GGGGAG	2	12	81522	81533	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014008	TGGTTG	2	12	104746	104757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014008	AAAGAT	2	12	146555	146566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014008	CTGATT	2	12	160019	160030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014008	ACTCTC	2	12	185381	185392	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014008	GCGGAT	2	12	201576	201587	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014008	TTCCTG	2	12	202464	202475	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014008	TCGTGG	2	12	202627	202638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014008	CGCTGA	2	12	202807	202818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014008	GGTATG	2	12	203815	203826	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014008	CGAAGC	2	12	203856	203867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014008	GTGAAA	2	12	208905	208916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014008	AAGTGA	2	12	212345	212356	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014008	TCTGAT	2	12	231527	231538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014008	AGTGAG	2	12	339779	339790	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014008	AGTGAG	2	12	339862	339873	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014008	AGTGAA	4	24	339874	339897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014008	GGTGTT	2	12	380240	380251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014008	ATGAGC	2	12	381646	381657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014008	TCGAAA	2	12	392561	392572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014008	GCATCG	2	12	404454	404465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014008	GCGATC	2	12	410262	410273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014008	AAGGGG	2	12	461252	461263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014008	AGTTGT	2	12	462909	462920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014008	AGTGAG	5	30	465871	465900	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014008	GAGAGT	2	12	465904	465915	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014008	CGCTGC	2	12	542379	542390	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014008	GGGGAC	2	12	543751	543762	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014008	AAGCGT	2	12	589356	589367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014008	TTGGAG	2	12	602871	602882	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014008	GACTGA	2	12	604074	604085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014008	TAATCC	2	12	732782	732793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014008	GTTTTG	2	12	861234	861245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014008	CGGAGG	2	12	872017	872028	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014008	ATTTCG	2	12	907249	907260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014008	ATCCAA	2	12	907516	907527	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014008	CATCGA	2	12	1017926	1017937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014008	ACTCGC	2	12	1033465	1033476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014008	AGTGTG	2	12	1078428	1078439	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014008	TTTCTT	2	12	1115406	1115417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014008	TCACCC	4	24	1165457	1165480	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014008	TACAAA	2	12	1170910	1170921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014008	AAATCG	2	12	1171887	1171898	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014008	CGATTG	2	12	1171931	1171942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014008	ATATAC	2	12	1218474	1218485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014008	TAGCAA	2	12	1230611	1230622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014008	ACCAAC	2	12	1234451	1234462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014008	GAGCCC	2	12	1249689	1249700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014008	TAACTT	2	12	1276654	1276665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014008	GGGGTT	2	12	1301526	1301537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014008	AAGACA	2	12	1311826	1311837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014008	ATCGGG	2	12	1407182	1407193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014008	GAGATA	2	12	1470916	1470927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014008	AGGTTC	2	12	1471246	1471257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014008	CAAAAA	2	12	1508364	1508375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014008	AATCCA	2	12	1601197	1601208	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014008	TCGATT	2	12	1601233	1601244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014008	ACGATT	3	18	1601245	1601262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014008	AAATCC	2	12	1611334	1611345	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014008	TCGATT	2	12	1611371	1611382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014008	GCGATT	3	18	1611383	1611400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014008	GTGCAG	2	12	1671858	1671869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014008	AGTTAA	2	12	1809739	1809750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014008	ACTCTC	2	12	1841005	1841016	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014008	TTCACT	2	12	1841865	1841876	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014008	GTAGGC	2	12	1875969	1875980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014008	TTCACT	2	12	1876225	1876236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014008	CTCACT	3	18	1876237	1876254	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014008	CACTTT	2	12	1876276	1876287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014008	ACTCTC	4	24	1913011	1913034	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014008	TTCACT	2	12	1913146	1913157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014008	ACCCTC	5	30	1920817	1920846	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014008	TTCACT	2	12	1920940	1920951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014008	CACCTG	2	12	1923174	1923185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014008	AACCGA	2	12	1924968	1924979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014008	GTCGGT	2	12	1974995	1975006	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014008	CCCCTC	2	12	2008416	2008427	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_014008	ACTCTC	16	96	2008428	2008523	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014008	CACTTT	2	12	2008614	2008625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014008	CACAGC	2	12	2043059	2043070	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014008	TTCACT	2	12	2044838	2044849	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014008	GGATTT	2	12	2059953	2059964	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014008	CTACAA	2	12	2066219	2066230	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014008	GATTAG	2	12	2086888	2086899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014008	AAGCCA	2	12	2089528	2089539	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014008	CTTCGA	2	12	2315651	2315662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014008	AGCATC	2	12	2322055	2322066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014008	GCTTGC	2	12	2338881	2338892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014008	ACTCTC	3	18	2376090	2376107	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014008	TCACTT	2	12	2376130	2376141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014008	CGGCAT	2	12	2379785	2379796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014008	CAGGCA	2	12	2445957	2445968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014008	CACTTT	3	18	2552867	2552884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014008	TCAAAT	2	12	2557807	2557818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014008	CTGCAA	2	12	2698868	2698879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014008	TGCGTT	2	12	2709728	2709739	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014008	GTGCTT	2	12	2747638	2747649	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014008	TCGAAA	2	12	2761314	2761325	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014008	CGATGC	4	24	2779096	2779119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014008	AAAGTG	2	12	2781683	2781694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014008	GAAGTG	2	12	2782854	2782865	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014008	TTCGAA	2	12	2823955	2823966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014008	TTGGAT	2	12	2828976	2828987	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014008	GCGCTT	2	12	2882585	2882596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014008	ACTTTC	2	12	2882617	2882628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014008	GCCGGA	2	12	2892984	2892995	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014008	GCTAGT	2	12	2980368	2980379	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014008	AACCCC	2	12	2998573	2998584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014008	AGTGAG	2	12	3048564	3048575	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014008	AAGTGA	2	12	3053119	3053130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014008	AGTGAG	2	12	3053138	3053149	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014008	AAGTGA	3	18	3053203	3053220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014008	TTCGAT	2	12	3053308	3053319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014008	GTACGA	2	12	3056622	3056633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014008	GCGACT	2	12	3057483	3057494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014008	TAAGCC	2	12	3068134	3068145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014008	TTCTCT	2	12	3079384	3079395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014008	GAAAGT	3	18	3097265	3097282	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014008	GAAGGT	2	12	3097283	3097294	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014008	CAGCGG	2	12	3153839	3153850	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014008	GCAATC	2	12	3169164	3169175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014008	TTTGGT	2	12	3231917	3231928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014008	TCGATT	2	12	3232179	3232190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014008	CGCAGA	2	12	3256873	3256884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014008	ATGGTT	2	12	3259162	3259173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014008	TTTTTG	2	12	3270878	3270889	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014008	GGCACC	2	12	3273829	3273840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014008	TCGTTG	2	12	3282091	3282102	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014008	ATTTCG	3	18	3293367	3293384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014008	AAATCG	2	12	3294462	3294473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014008	TCGATT	3	18	3294687	3294704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014008	AAATCG	3	18	3298640	3298657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014008	GAGTGA	3	18	3311498	3311515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014008	AAATCG	2	12	3315088	3315099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014008	GATCGG	2	12	3315114	3315125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_014008	TCGATT	4	24	3315394	3315417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014008	TCGAAA	4	24	3317018	3317041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014008	GATCGG	2	12	3317085	3317096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014008	TTTCGA	2	12	3317104	3317115	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014008	ATCGTA	2	12	3325545	3325556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_014008	ATCGAA	2	12	3325557	3325568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014008	GATCGG	2	12	3325581	3325592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014008	TCGATT	2	12	3325775	3325786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014008	AAATCG	2	12	3327043	3327054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_014008	TCGATT	2	12	3327123	3327134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_014008	CGATTT	2	12	3327136	3327147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014008	GGTTTT	2	12	3328383	3328394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014008	AAATCG	2	12	3328443	3328454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014008	ATCGGA	2	12	3328496	3328507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014008	GATTTG	2	12	3328561	3328572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014008	AGAGTG	2	12	3331305	3331316	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014008	AGTGAG	2	12	3335128	3335139	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014008	AATCGA	2	12	3336851	3336862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014008	AATCGT	2	12	3336863	3336874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014008	ATCGGA	2	12	3336889	3336900	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_014008	GGAGTC	2	12	3414306	3414317	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_014008	GTCGAA	2	12	3418224	3418235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_014008	TAGAAT	2	12	3425965	3425976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014008	AGTGAG	3	18	3440167	3440184	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014008	TGAATA	2	12	3445714	3445725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014008	AGTGAA	4	24	3479252	3479275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014008	AGTGAG	8	48	3479276	3479323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014008	AATACT	2	12	3490284	3490295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_014008	CATTCA	2	12	3506271	3506282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_014008	CAGTTT	2	12	3515101	3515112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_014008	AGGGTG	2	12	3517092	3517103	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014008	TCGAAA	2	12	3521663	3521674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_014008	TCGCAA	3	18	3521675	3521692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_014008	GATTTG	2	12	3521717	3521728	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014008	ATCGAA	2	12	3530100	3530111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_014008	GATTTC	2	12	3530149	3530160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_014008	TCGTAC	2	12	3544036	3544047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014008	TCGAAA	4	24	3553217	3553240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_014008	GATTTG	2	12	3553290	3553301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014008	TTAGTT	2	12	3577671	3577682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014008	ATTTGC	2	12	3600661	3600672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_014008	CTTTTT	2	12	3609691	3609702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
180	NC_014008	ATTCAC	2	12	3668680	3668691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.