MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 chromosome

Total Repeats: 2276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014008	CCGCC	2	10	1290	1299	0 %	0 %	20 %	80 %	294053542
2	NC_014008	AGTCC	2	10	4755	4764	20 %	20 %	20 %	40 %	294053546
3	NC_014008	CATTT	2	10	5917	5926	20 %	60 %	0 %	20 %	294053547
4	NC_014008	ACGCC	2	10	6131	6140	20 %	0 %	20 %	60 %	294053547
5	NC_014008	ATTGC	2	10	8248	8257	20 %	40 %	20 %	20 %	294053549
6	NC_014008	CGCGG	2	10	8273	8282	0 %	0 %	60 %	40 %	294053549
7	NC_014008	TGCGC	2	10	8842	8851	0 %	20 %	40 %	40 %	294053550
8	NC_014008	GAAAT	2	10	9565	9574	60 %	20 %	20 %	0 %	294053552
9	NC_014008	TGCGT	2	10	10181	10190	0 %	40 %	40 %	20 %	294053552
10	NC_014008	CTTGG	2	10	14917	14926	0 %	40 %	40 %	20 %	294053556
11	NC_014008	TACGG	2	10	21044	21053	20 %	20 %	40 %	20 %	294053560
12	NC_014008	TCGTT	2	10	21309	21318	0 %	60 %	20 %	20 %	294053560
13	NC_014008	CGTGA	2	10	26029	26038	20 %	20 %	40 %	20 %	294053566
14	NC_014008	TCACT	2	10	26049	26058	20 %	40 %	0 %	40 %	294053566
15	NC_014008	GAGAC	2	10	28197	28206	40 %	0 %	40 %	20 %	294053569
16	NC_014008	GAGTC	2	10	28475	28484	20 %	20 %	40 %	20 %	294053569
17	NC_014008	GTTGT	2	10	28631	28640	0 %	60 %	40 %	0 %	294053569
18	NC_014008	CATTC	2	10	29993	30002	20 %	40 %	0 %	40 %	294053571
19	NC_014008	CAGGA	2	10	31613	31622	40 %	0 %	40 %	20 %	294053571
20	NC_014008	TTGAT	2	10	32021	32030	20 %	60 %	20 %	0 %	294053571
21	NC_014008	TTGGT	2	10	36331	36340	0 %	60 %	40 %	0 %	294053576
22	NC_014008	CTCGA	2	10	36775	36784	20 %	20 %	20 %	40 %	294053577
23	NC_014008	CATTT	2	10	36844	36853	20 %	60 %	0 %	20 %	294053577
24	NC_014008	GGATT	2	10	37978	37987	20 %	40 %	40 %	0 %	294053578
25	NC_014008	TCCGA	2	10	39389	39398	20 %	20 %	20 %	40 %	294053579
26	NC_014008	GTTTC	2	10	42470	42479	0 %	60 %	20 %	20 %	294053581
27	NC_014008	GTTCA	2	10	43890	43899	20 %	40 %	20 %	20 %	294053582
28	NC_014008	GGCTT	2	10	44849	44858	0 %	40 %	40 %	20 %	294053583
29	NC_014008	TGAAA	2	10	45314	45323	60 %	20 %	20 %	0 %	294053584
30	NC_014008	ATGAA	2	10	45921	45930	60 %	20 %	20 %	0 %	294053584
31	NC_014008	AAGCC	2	10	46312	46321	40 %	0 %	20 %	40 %	294053585
32	NC_014008	CTGCG	2	10	49375	49384	0 %	20 %	40 %	40 %	294053587
33	NC_014008	CAGAT	2	10	49557	49566	40 %	20 %	20 %	20 %	294053587
34	NC_014008	ACCTT	2	10	51473	51482	20 %	40 %	0 %	40 %	294053590
35	NC_014008	ATCCG	2	10	52519	52528	20 %	20 %	20 %	40 %	294053590
36	NC_014008	AACCA	2	10	54580	54589	60 %	0 %	0 %	40 %	294053592
37	NC_014008	GCGAT	2	10	56527	56536	20 %	20 %	40 %	20 %	294053595
38	NC_014008	ATGAT	2	10	59145	59154	40 %	40 %	20 %	0 %	294053597
39	NC_014008	GAATC	2	10	60710	60719	40 %	20 %	20 %	20 %	294053597
40	NC_014008	GTGAG	2	10	62386	62395	20 %	20 %	60 %	0 %	294053598
41	NC_014008	GGATC	2	10	62976	62985	20 %	20 %	40 %	20 %	294053598
42	NC_014008	GCAGT	2	10	63612	63621	20 %	20 %	40 %	20 %	294053598
43	NC_014008	AGGCT	2	10	64877	64886	20 %	20 %	40 %	20 %	294053599
44	NC_014008	CGCGA	2	10	65109	65118	20 %	0 %	40 %	40 %	294053599
45	NC_014008	TGACT	2	10	65783	65792	20 %	40 %	20 %	20 %	294053599
46	NC_014008	CCGTT	2	10	66782	66791	0 %	40 %	20 %	40 %	294053600
47	NC_014008	GATGG	2	10	68418	68427	20 %	20 %	60 %	0 %	294053604
48	NC_014008	GTTGA	2	10	71242	71251	20 %	40 %	40 %	0 %	294053606
49	NC_014008	CGATG	2	10	72009	72018	20 %	20 %	40 %	20 %	294053607
50	NC_014008	CTGCG	2	10	76296	76305	0 %	20 %	40 %	40 %	294053612
51	NC_014008	TGAGC	2	10	77511	77520	20 %	20 %	40 %	20 %	294053613
52	NC_014008	GCGCG	2	10	77670	77679	0 %	0 %	60 %	40 %	294053613
53	NC_014008	ACTCG	2	10	80305	80314	20 %	20 %	20 %	40 %	294053615
54	NC_014008	GTTTG	2	10	81351	81360	0 %	60 %	40 %	0 %	294053616
55	NC_014008	CGTGC	2	10	83626	83635	0 %	20 %	40 %	40 %	294053618
56	NC_014008	CAACC	2	10	83725	83734	40 %	0 %	0 %	60 %	294053618
57	NC_014008	GGGCA	2	10	85317	85326	20 %	0 %	60 %	20 %	294053619
58	NC_014008	GGACA	2	10	87904	87913	40 %	0 %	40 %	20 %	294053620
59	NC_014008	TCGTT	2	10	87993	88002	0 %	60 %	20 %	20 %	294053620
60	NC_014008	CAAAC	2	10	88324	88333	60 %	0 %	0 %	40 %	294053620
61	NC_014008	TTGGA	2	10	90485	90494	20 %	40 %	40 %	0 %	294053622
62	NC_014008	TCCGG	2	10	96314	96323	0 %	20 %	40 %	40 %	294053628
63	NC_014008	GGCCA	2	10	96439	96448	20 %	0 %	40 %	40 %	294053628
64	NC_014008	TTCCA	2	10	96891	96900	20 %	40 %	0 %	40 %	294053628
65	NC_014008	GTGAA	2	10	99600	99609	40 %	20 %	40 %	0 %	294053631
66	NC_014008	TCGAA	2	10	100691	100700	40 %	20 %	20 %	20 %	294053632
67	NC_014008	TTCGA	2	10	103459	103468	20 %	40 %	20 %	20 %	294053633
68	NC_014008	TGCGA	2	10	106073	106082	20 %	20 %	40 %	20 %	294053635
69	NC_014008	CAAGC	2	10	106337	106346	40 %	0 %	20 %	40 %	294053635
70	NC_014008	GGAGC	2	10	107092	107101	20 %	0 %	60 %	20 %	294053636
71	NC_014008	GAACT	2	10	107443	107452	40 %	20 %	20 %	20 %	294053636
72	NC_014008	TTCAG	2	10	108061	108070	20 %	40 %	20 %	20 %	294053637
73	NC_014008	ACCGG	2	10	110050	110059	20 %	0 %	40 %	40 %	294053638
74	NC_014008	GACGC	2	10	111512	111521	20 %	0 %	40 %	40 %	294053639
75	NC_014008	ACGGC	2	10	111696	111705	20 %	0 %	40 %	40 %	294053639
76	NC_014008	TCCGC	2	10	112334	112343	0 %	20 %	20 %	60 %	294053640
77	NC_014008	CGAAT	2	10	115111	115120	40 %	20 %	20 %	20 %	294053643
78	NC_014008	TGAGA	2	10	116263	116272	40 %	20 %	40 %	0 %	294053643
79	NC_014008	TGCTG	2	10	123278	123287	0 %	40 %	40 %	20 %	294053647
80	NC_014008	AGCGG	2	10	124090	124099	20 %	0 %	60 %	20 %	294053647
81	NC_014008	CAAGC	2	10	124632	124641	40 %	0 %	20 %	40 %	294053647
82	NC_014008	GATTG	2	10	125965	125974	20 %	40 %	40 %	0 %	294053648
83	NC_014008	TTCGA	2	10	126874	126883	20 %	40 %	20 %	20 %	294053648
84	NC_014008	TTGGA	2	10	127935	127944	20 %	40 %	40 %	0 %	294053648
85	NC_014008	CGTGG	2	10	129658	129667	0 %	20 %	60 %	20 %	294053650
86	NC_014008	TACTT	2	10	131374	131383	20 %	60 %	0 %	20 %	294053652
87	NC_014008	TGATG	2	10	132678	132687	20 %	40 %	40 %	0 %	294053652
88	NC_014008	TCGAG	2	10	132812	132821	20 %	20 %	40 %	20 %	294053652
89	NC_014008	GCTTC	2	10	135567	135576	0 %	40 %	20 %	40 %	294053653
90	NC_014008	GCGAT	2	10	135620	135629	20 %	20 %	40 %	20 %	294053653
91	NC_014008	GTTTC	2	10	135649	135658	0 %	60 %	20 %	20 %	294053653
92	NC_014008	GGATT	2	10	135782	135791	20 %	40 %	40 %	0 %	294053653
93	NC_014008	AAAGA	2	10	139191	139200	80 %	0 %	20 %	0 %	294053658
94	NC_014008	TTTCA	2	10	140166	140175	20 %	60 %	0 %	20 %	294053659
95	NC_014008	TAGCA	2	10	140230	140239	40 %	20 %	20 %	20 %	294053659
96	NC_014008	CACGG	2	10	141317	141326	20 %	0 %	40 %	40 %	294053660
97	NC_014008	GGTCA	2	10	142217	142226	20 %	20 %	40 %	20 %	294053660
98	NC_014008	TGCTG	2	10	145121	145130	0 %	40 %	40 %	20 %	294053661
99	NC_014008	CGGGT	2	10	145584	145593	0 %	20 %	60 %	20 %	294053661
100	NC_014008	GATCA	2	10	151139	151148	40 %	20 %	20 %	20 %	294053663
101	NC_014008	GTTGG	2	10	151779	151788	0 %	40 %	60 %	0 %	294053664
102	NC_014008	ATGCC	2	10	153548	153557	20 %	20 %	20 %	40 %	294053666
103	NC_014008	AGCGG	2	10	155063	155072	20 %	0 %	60 %	20 %	294053668
104	NC_014008	ATCAA	2	10	157634	157643	60 %	20 %	0 %	20 %	294053669
105	NC_014008	GCCGA	2	10	157991	158000	20 %	0 %	40 %	40 %	294053669
106	NC_014008	GGATT	2	10	158400	158409	20 %	40 %	40 %	0 %	294053669
107	NC_014008	GTTGA	2	10	163131	163140	20 %	40 %	40 %	0 %	294053672
108	NC_014008	CGGTG	2	10	163656	163665	0 %	20 %	60 %	20 %	294053673
109	NC_014008	CGGAG	2	10	163881	163890	20 %	0 %	60 %	20 %	294053673
110	NC_014008	GCGTA	2	10	164403	164412	20 %	20 %	40 %	20 %	294053674
111	NC_014008	AGTGG	2	10	165788	165797	20 %	20 %	60 %	0 %	294053675
112	NC_014008	TTGGT	2	10	167160	167169	0 %	60 %	40 %	0 %	294053676
113	NC_014008	CCATT	2	10	167603	167612	20 %	40 %	0 %	40 %	294053676
114	NC_014008	CGATC	2	10	171988	171997	20 %	20 %	20 %	40 %	294053678
115	NC_014008	CGCTG	2	10	174125	174134	0 %	20 %	40 %	40 %	294053679
116	NC_014008	CCTCG	2	10	174677	174686	0 %	20 %	20 %	60 %	294053679
117	NC_014008	GTGAT	2	10	175985	175994	20 %	40 %	40 %	0 %	294053680
118	NC_014008	AACCA	2	10	178107	178116	60 %	0 %	0 %	40 %	294053681
119	NC_014008	GGCTT	2	10	179235	179244	0 %	40 %	40 %	20 %	294053682
120	NC_014008	GGCAA	2	10	181299	181308	40 %	0 %	40 %	20 %	294053684
121	NC_014008	GAGCA	2	10	183891	183900	40 %	0 %	40 %	20 %	294053685
122	NC_014008	TCAAA	2	10	185144	185153	60 %	20 %	0 %	20 %	294053685
123	NC_014008	TAAAT	2	10	185907	185916	60 %	40 %	0 %	0 %	294053687
124	NC_014008	CGGCT	2	10	192134	192143	0 %	20 %	40 %	40 %	294053689
125	NC_014008	AAGCC	2	10	192390	192399	40 %	0 %	20 %	40 %	294053689
126	NC_014008	AAGCA	2	10	200159	200168	60 %	0 %	20 %	20 %	294053695
127	NC_014008	CCGAT	2	10	200835	200844	20 %	20 %	20 %	40 %	294053696
128	NC_014008	GCTGA	2	10	205177	205186	20 %	20 %	40 %	20 %	294053697
129	NC_014008	GTCCG	2	10	208213	208222	0 %	20 %	40 %	40 %	294053700
130	NC_014008	TCGCG	2	10	209811	209820	0 %	20 %	40 %	40 %	294053701
131	NC_014008	TCGGC	2	10	215316	215325	0 %	20 %	40 %	40 %	294053708
132	NC_014008	CGTGA	2	10	217355	217364	20 %	20 %	40 %	20 %	294053710
133	NC_014008	GAGAC	2	10	217995	218004	40 %	0 %	40 %	20 %	294053711
134	NC_014008	CGACC	2	10	219387	219396	20 %	0 %	20 %	60 %	294053712
135	NC_014008	TGCTT	2	10	220026	220035	0 %	60 %	20 %	20 %	294053712
136	NC_014008	CGCTG	2	10	220635	220644	0 %	20 %	40 %	40 %	294053713
137	NC_014008	TCGTT	2	10	226629	226638	0 %	60 %	20 %	20 %	294053719
138	NC_014008	ATCGC	2	10	227210	227219	20 %	20 %	20 %	40 %	294053719
139	NC_014008	TTAGA	2	10	227529	227538	40 %	40 %	20 %	0 %	294053719
140	NC_014008	GCGGT	2	10	227936	227945	0 %	20 %	60 %	20 %	294053719
141	NC_014008	AATTG	2	10	228112	228121	40 %	40 %	20 %	0 %	294053719
142	NC_014008	CGGTT	2	10	228919	228928	0 %	40 %	40 %	20 %	294053720
143	NC_014008	CGCTT	2	10	230954	230963	0 %	40 %	20 %	40 %	294053722
144	NC_014008	AGATC	2	10	231312	231321	40 %	20 %	20 %	20 %	294053722
145	NC_014008	CGGCG	2	10	234129	234138	0 %	0 %	60 %	40 %	294053724
146	NC_014008	TTAGG	2	10	235212	235221	20 %	40 %	40 %	0 %	294053725
147	NC_014008	AATCG	2	10	235530	235539	40 %	20 %	20 %	20 %	294053725
148	NC_014008	AAGGG	2	10	237983	237992	40 %	0 %	60 %	0 %	294053728
149	NC_014008	CATTG	2	10	239018	239027	20 %	40 %	20 %	20 %	294053729
150	NC_014008	TGCGT	2	10	239120	239129	0 %	40 %	40 %	20 %	294053729
151	NC_014008	GGTGC	2	10	241162	241171	0 %	20 %	60 %	20 %	294053731
152	NC_014008	GGGCG	2	10	241284	241293	0 %	0 %	80 %	20 %	294053731
153	NC_014008	CTTGG	2	10	243476	243485	0 %	40 %	40 %	20 %	294053734
154	NC_014008	AGTTG	2	10	244662	244671	20 %	40 %	40 %	0 %	294053734
155	NC_014008	TGCGT	2	10	248101	248110	0 %	40 %	40 %	20 %	294053735
156	NC_014008	ATCTG	2	10	248333	248342	20 %	40 %	20 %	20 %	294053735
157	NC_014008	TGCGA	2	10	250335	250344	20 %	20 %	40 %	20 %	294053736
158	NC_014008	TGCCT	2	10	250943	250952	0 %	40 %	20 %	40 %	294053736
159	NC_014008	GGTGA	2	10	252959	252968	20 %	20 %	60 %	0 %	294053737
160	NC_014008	GATCG	2	10	253232	253241	20 %	20 %	40 %	20 %	294053737
161	NC_014008	CGGTG	2	10	255418	255427	0 %	20 %	60 %	20 %	294053739
162	NC_014008	GCTGG	2	10	262074	262083	0 %	20 %	60 %	20 %	294053742
163	NC_014008	GGATT	2	10	265619	265628	20 %	40 %	40 %	0 %	294053744
164	NC_014008	GTAGG	2	10	267479	267488	20 %	20 %	60 %	0 %	294053745
165	NC_014008	GGTTT	2	10	269641	269650	0 %	60 %	40 %	0 %	294053746
166	NC_014008	CGTGA	2	10	269831	269840	20 %	20 %	40 %	20 %	294053746
167	NC_014008	TCATC	2	10	269927	269936	20 %	40 %	0 %	40 %	294053746
168	NC_014008	TGGTG	2	10	272641	272650	0 %	40 %	60 %	0 %	294053748
169	NC_014008	GTTTT	2	10	273586	273595	0 %	80 %	20 %	0 %	294053749
170	NC_014008	GCCAT	2	10	275254	275263	20 %	20 %	20 %	40 %	294053750
171	NC_014008	GCATT	2	10	280091	280100	20 %	40 %	20 %	20 %	294053756
172	NC_014008	ATCCG	2	10	280256	280265	20 %	20 %	20 %	40 %	294053756
173	NC_014008	GTGAT	2	10	280376	280385	20 %	40 %	40 %	0 %	294053756
174	NC_014008	ACGCT	2	10	280644	280653	20 %	20 %	20 %	40 %	294053756
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176	NC_014008	CGCTG	2	10	281321	281330	0 %	20 %	40 %	40 %	294053757
177	NC_014008	TCCAA	2	10	283879	283888	40 %	20 %	0 %	40 %	294053760
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180	NC_014008	AGGCG	2	10	286059	286068	20 %	0 %	60 %	20 %	294053761
181	NC_014008	GTCGC	2	10	290780	290789	0 %	20 %	40 %	40 %	294053766
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185	NC_014008	TGCGG	2	10	299117	299126	0 %	20 %	60 %	20 %	294053770
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191	NC_014008	GGCAT	2	10	309693	309702	20 %	20 %	40 %	20 %	294053782
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194	NC_014008	CGGAT	2	10	315594	315603	20 %	20 %	40 %	20 %	294053787
195	NC_014008	TCGGA	2	10	316961	316970	20 %	20 %	40 %	20 %	294053789
196	NC_014008	ATGGT	2	10	317252	317261	20 %	40 %	40 %	0 %	294053789
197	NC_014008	GCCAA	2	10	317706	317715	40 %	0 %	20 %	40 %	294053789
198	NC_014008	GTGGC	2	10	319926	319935	0 %	20 %	60 %	20 %	294053790
199	NC_014008	GGGCA	2	10	320369	320378	20 %	0 %	60 %	20 %	294053790
200	NC_014008	CCAGT	2	10	327509	327518	20 %	20 %	20 %	40 %	294053794
201	NC_014008	ATCGT	2	10	332202	332211	20 %	40 %	20 %	20 %	294053794
202	NC_014008	ACGAA	2	10	334470	334479	60 %	0 %	20 %	20 %	294053795
203	NC_014008	GCCTG	2	10	335851	335860	0 %	20 %	40 %	40 %	294053796
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209	NC_014008	AAAGC	2	10	342606	342615	60 %	0 %	20 %	20 %	294053803
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211	NC_014008	TGGGG	2	10	343837	343846	0 %	20 %	80 %	0 %	294053805
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215	NC_014008	GCCTT	2	10	350625	350634	0 %	40 %	20 %	40 %	294053811
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223	NC_014008	CTTGC	2	10	363598	363607	0 %	40 %	20 %	40 %	294053827
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230	NC_014008	TTTTG	2	10	369742	369751	0 %	80 %	20 %	0 %	294053838
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235	NC_014008	ATTCT	2	10	372372	372381	20 %	60 %	0 %	20 %	294053842
236	NC_014008	ACTGA	2	10	372980	372989	40 %	20 %	20 %	20 %	294053843
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240	NC_014008	TTTTC	2	10	376706	376715	0 %	80 %	0 %	20 %	294053850
241	NC_014008	TGTAG	2	10	376764	376773	20 %	40 %	40 %	0 %	294053850
242	NC_014008	ATTTC	2	10	377947	377956	20 %	60 %	0 %	20 %	294053852
243	NC_014008	GCTAC	2	10	379191	379200	20 %	20 %	20 %	40 %	294053854
244	NC_014008	TTTCC	2	10	379350	379359	0 %	60 %	0 %	40 %	294053854
245	NC_014008	CTTTT	2	10	381276	381285	0 %	80 %	0 %	20 %	294053858
246	NC_014008	TTTTC	2	10	381448	381457	0 %	80 %	0 %	20 %	294053858
247	NC_014008	CGATC	2	10	381963	381972	20 %	20 %	20 %	40 %	294053859
248	NC_014008	ACTGA	2	10	382261	382270	40 %	20 %	20 %	20 %	294053860
249	NC_014008	CCATT	2	10	384031	384040	20 %	40 %	0 %	40 %	294053862
250	NC_014008	CTGTG	2	10	384079	384088	0 %	40 %	40 %	20 %	294053862
251	NC_014008	GTGGG	2	10	384525	384534	0 %	20 %	80 %	0 %	294053864
252	NC_014008	TTCTT	2	10	384811	384820	0 %	80 %	0 %	20 %	294053864
253	NC_014008	TTGAT	2	10	388062	388071	20 %	60 %	20 %	0 %	294053870
254	NC_014008	GCTTG	2	10	389213	389222	0 %	40 %	40 %	20 %	294053872
255	NC_014008	GAGCT	2	10	390548	390557	20 %	20 %	40 %	20 %	294053873
256	NC_014008	TGACC	2	10	400610	400619	20 %	20 %	20 %	40 %	294053881
257	NC_014008	GTGCG	2	10	401047	401056	0 %	20 %	60 %	20 %	294053881
258	NC_014008	CTTGG	2	10	401577	401586	0 %	40 %	40 %	20 %	294053881
259	NC_014008	AGGGC	2	10	405384	405393	20 %	0 %	60 %	20 %	294053883
260	NC_014008	CAGCA	2	10	406501	406510	40 %	0 %	20 %	40 %	294053884
261	NC_014008	GGTAA	2	10	411455	411464	40 %	20 %	40 %	0 %	294053886
262	NC_014008	GAATT	2	10	412258	412267	40 %	40 %	20 %	0 %	294053887
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