MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014006	ACCGGC	2	12	13466	13477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014006	CGGTTT	2	12	68148	68159	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014006	CAAGTT	2	12	69858	69869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014006	CGGCGC	2	12	69918	69929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014006	CCGGTG	2	12	78011	78022	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014006	CAGGAA	2	12	118860	118871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014006	GCCGAC	2	12	157586	157597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014006	GGTCGC	2	12	280386	280397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014006	GGCGGG	2	12	288440	288451	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014006	CACGAT	2	12	415627	415638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014006	GCGACC	2	12	516938	516949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014006	AAAAAG	2	12	589618	589629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014006	CATGTT	2	12	617056	617067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014006	ATTGGC	2	12	618764	618775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014006	GATGAA	2	12	626568	626579	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014006	TGGTCC	2	12	643443	643454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014006	CCGGAA	2	12	747591	747602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014006	GGCCGG	2	12	790552	790563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014006	GGGGTG	2	12	809591	809602	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014006	AAGGCA	2	12	881324	881335	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014006	TTCCTG	2	12	912152	912163	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014006	CAGCAT	2	12	973915	973926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014006	TTTACG	2	12	976368	976379	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014006	TTTAGG	2	12	980461	980472	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014006	GGAACC	2	12	982186	982197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014006	TTTCGA	2	12	985613	985624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014006	TTCGAG	2	12	1005328	1005339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014006	CCTATC	2	12	1042405	1042416	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014006	ATAAAG	2	12	1066117	1066128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014006	CTGCTT	2	12	1144088	1144099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014006	CCCGCC	2	12	1167746	1167757	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_014006	GGTGAC	2	12	1173309	1173320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014006	GGTTCT	2	12	1214978	1214989	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014006	GCTGTC	2	12	1371208	1371219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014006	GGAGAC	2	12	1386137	1386148	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014006	CGGCCT	2	12	1430643	1430654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014006	TCCTGC	2	12	1483310	1483321	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014006	GAACAG	2	12	1812275	1812286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014006	CCCGGT	2	12	1827235	1827246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014006	TGGAAG	2	12	1840833	1840844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014006	CCCCTC	2	12	1855780	1855791	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_014006	GAAAGG	2	12	1949177	1949188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014006	GATATT	2	12	1953790	1953801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014006	TGCGAT	2	12	1953872	1953883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014006	TCAGGC	2	12	1964229	1964240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014006	ACAGCT	2	12	1970215	1970226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014006	CCCTCT	2	12	2017464	2017475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014006	GGGCCG	2	12	2055452	2055463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014006	TGCGCG	2	12	2132606	2132617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014006	CCATTG	2	12	2192228	2192239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014006	TTGCTC	2	12	2273737	2273748	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014006	ATTTTT	2	12	2274030	2274041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014006	CGCGGC	2	12	2287409	2287420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014006	CGGCCC	2	12	2313040	2313051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014006	TCCTGC	2	12	2365450	2365461	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014006	AACATT	2	12	2504839	2504850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014006	CCCCCA	2	12	2577850	2577861	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_014006	TGACCA	2	12	2645303	2645314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014006	CCCGCT	2	12	2661465	2661476	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014006	CCCCGC	3	18	2718951	2718968	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_014006	CCCCCG	2	12	2728905	2728916	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_014006	CATGGC	2	12	2929447	2929458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014006	CGGCCG	2	12	2931351	2931362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014006	CCAAAA	2	12	2982621	2982632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014006	CCTGCT	2	12	2996092	2996103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014006	ATTGAA	2	12	3008032	3008043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014006	GCATTT	2	12	3146845	3146856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014006	CGTCCC	2	12	3218351	3218362	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014006	AGCCTT	2	12	3226437	3226448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014006	AATGAA	2	12	3303728	3303739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014006	CCTTCC	2	12	3338905	3338916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014006	CATGGC	2	12	3373603	3373614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014006	GGGGTG	2	12	3384257	3384268	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014006	TTTTTG	2	12	3431637	3431648	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014006	CCTTTT	2	12	3509321	3509332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.