MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014006	TCCT	2	8	13532	13539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014006	CCTG	2	8	34587	34594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014006	CGTC	2	8	35602	35609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014006	CGGG	2	8	36976	36983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014006	GGAT	2	8	37043	37050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014006	GTTC	2	8	38263	38270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014006	GCAG	2	8	40980	40987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014006	CCTG	2	8	41036	41043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014006	GCGA	2	8	51566	51573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014006	CCGG	2	8	51583	51590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014006	GCCG	2	8	51602	51609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014006	GCGG	2	8	64994	65001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014006	GACG	2	8	67923	67930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014006	GGAT	2	8	68060	68067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014006	GTAA	2	8	68110	68117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014006	GAAC	2	8	68219	68226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014006	GTGA	2	8	68564	68571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014006	GGTG	2	8	68801	68808	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014006	TGTT	2	8	70132	70139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014006	GCGA	2	8	70808	70815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014006	TTAG	2	8	70842	70849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014006	CAGA	2	8	71488	71495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014006	AAAG	2	8	71632	71639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014006	ACCG	2	8	71779	71786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014006	CAGG	2	8	72009	72016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014006	CCTC	2	8	73197	73204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_014006	ACCC	2	8	73478	73485	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014006	ATCA	2	8	73922	73929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014006	CGCA	2	8	77972	77979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014006	CCAG	2	8	79399	79406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014006	ATTC	2	8	79449	79456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014006	GGGC	2	8	82758	82765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014006	AACG	2	8	93305	93312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014006	TCCT	2	8	100907	100914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014006	CATC	2	8	103184	103191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014006	TTCG	2	8	103247	103254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014006	CCGG	2	8	104037	104044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014006	GCAG	2	8	105290	105297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014006	GGGC	2	8	105346	105353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014006	CGAG	2	8	131458	131465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014006	TTGA	2	8	134233	134240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014006	TCGA	2	8	134289	134296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014006	AAAT	2	8	142986	142993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014006	AGGG	2	8	161992	161999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014006	GCGA	2	8	162012	162019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014006	GCCA	2	8	163565	163572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014006	AATC	2	8	163701	163708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014006	CCTG	2	8	163811	163818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014006	AACC	2	8	163885	163892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014006	CGAG	2	8	167631	167638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014006	ATGC	2	8	172384	172391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014006	CTTT	2	8	174377	174384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014006	TCAG	2	8	174473	174480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014006	CCCT	2	8	182328	182335	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014006	CGAT	2	8	188113	188120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014006	TGGG	2	8	188200	188207	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014006	GGCG	2	8	189981	189988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014006	CTGA	2	8	196389	196396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014006	GGCG	2	8	197855	197862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014006	GCCC	2	8	197875	197882	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_014006	CCCT	2	8	199839	199846	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014006	GATG	2	8	199954	199961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014006	CCCG	2	8	204036	204043	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_014006	GCCC	2	8	206798	206805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014006	GCGT	2	8	207922	207929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014006	TGTT	2	8	213455	213462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014006	CCGC	2	8	213475	213482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_014006	CAGG	2	8	226144	226151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014006	TCAC	2	8	227761	227768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014006	GAGG	2	8	227937	227944	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014006	CGCC	2	8	231308	231315	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014006	CCGC	2	8	231350	231357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_014006	TCCT	2	8	237899	237906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014006	GACG	2	8	239559	239566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014006	AGGA	2	8	241567	241574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014006	ATTG	2	8	243157	243164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014006	GGCA	2	8	244635	244642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014006	GCGT	2	8	246457	246464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014006	GGAA	2	8	260415	260422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014006	GGCT	2	8	262418	262425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014006	CGGG	3	12	262460	262471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014006	CGGG	2	8	264035	264042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014006	CCGC	2	8	264044	264051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_014006	ATCC	2	8	264298	264305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014006	AAGT	2	8	269741	269748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014006	CGGG	2	8	272913	272920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014006	TAGA	2	8	272968	272975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014006	CGGT	2	8	273717	273724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014006	AAAG	2	8	282320	282327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014006	TGTC	2	8	293625	293632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014006	CGGG	2	8	293656	293663	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014006	GCGG	2	8	293678	293685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014006	GCAG	2	8	294785	294792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014006	CCTG	2	8	294822	294829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014006	CCGC	2	8	300159	300166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_014006	CCCG	2	8	312567	312574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014006	GCCC	2	8	312584	312591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014006	CGGA	2	8	316075	316082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014006	CTTT	2	8	316186	316193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014006	CCCG	2	8	318906	318913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_014006	AACG	2	8	318919	318926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014006	TGGC	2	8	341837	341844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014006	CGGA	2	8	345574	345581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014006	TCCT	2	8	350496	350503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014006	TGGG	2	8	352579	352586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014006	GGGT	2	8	353512	353519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014006	CCAA	2	8	354729	354736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014006	AAGC	2	8	356857	356864	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014006	CCGG	2	8	374170	374177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014006	AAAG	2	8	374412	374419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014006	TCGG	2	8	378319	378326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014006	TGCG	2	8	379777	379784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014006	GTTG	2	8	385504	385511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014006	CGGG	2	8	390456	390463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014006	GCCC	2	8	403315	403322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_014006	TCAA	2	8	403338	403345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014006	TCGG	2	8	410411	410418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014006	AGCC	2	8	412763	412770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014006	GTCG	2	8	414338	414345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014006	GCGA	2	8	416177	416184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014006	GGAA	2	8	417068	417075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014006	GCCG	2	8	431396	431403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014006	CCCG	2	8	431404	431411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_014006	GGGA	2	8	434498	434505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014006	GCCG	2	8	446044	446051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014006	GGCA	2	8	448199	448206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014006	CGCA	2	8	449448	449455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014006	CCGC	2	8	449806	449813	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_014006	GCCT	2	8	449833	449840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014006	GCCC	2	8	450418	450425	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014006	CGGG	2	8	452536	452543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014006	CTAT	2	8	454413	454420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014006	TCTA	2	8	457865	457872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014006	TCTA	2	8	457889	457896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014006	AGCG	2	8	459161	459168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014006	ATCG	2	8	459458	459465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014006	GATC	2	8	482946	482953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014006	AGGC	2	8	483073	483080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014006	GATC	2	8	487535	487542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014006	CGGC	2	8	497735	497742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014006	TCGG	2	8	498243	498250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014006	GCCG	2	8	498288	498295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014006	CGAT	2	8	500484	500491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014006	CGAG	2	8	502094	502101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014006	GAGC	2	8	507829	507836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014006	GTAG	2	8	508905	508912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014006	TAAG	2	8	516111	516118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014006	TTGG	2	8	523694	523701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014006	ATCG	2	8	524122	524129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014006	TGCG	2	8	524131	524138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014006	GCCG	2	8	530848	530855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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445	NC_014006	CCGG	2	8	1408101	1408108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
446	NC_014006	GAGG	2	8	1408111	1408118	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
447	NC_014006	CTAG	2	8	1410089	1410096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_014006	GATC	2	8	1425444	1425451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_014006	CGGC	2	8	1437505	1437512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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461	NC_014006	GCAG	2	8	1458109	1458116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_014006	CCTG	2	8	1458146	1458153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
463	NC_014006	TGGG	2	8	1460077	1460084	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
464	NC_014006	CCCT	2	8	1462202	1462209	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
465	NC_014006	GGCG	2	8	1468156	1468163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
466	NC_014006	GAAT	2	8	1469741	1469748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
467	NC_014006	ATGG	2	8	1469836	1469843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_014006	TTTG	2	8	1484875	1484882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_014006	TGGA	2	8	1486663	1486670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014006	CGGC	3	12	1490667	1490678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_014006	CCTA	2	8	1491966	1491973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_014006	AGGC	2	8	1508513	1508520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_014006	CCTG	2	8	1508566	1508573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_014006	GGGC	2	8	1511179	1511186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_014006	CTTT	2	8	1521109	1521116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_014006	TAAA	2	8	1521256	1521263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014006	GACG	2	8	1529037	1529044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014006	TAGG	2	8	1532304	1532311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_014006	GCGG	2	8	1555367	1555374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014006	GGAG	2	8	1555390	1555397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
487	NC_014006	GGAC	2	8	1555401	1555408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_014006	GCTT	2	8	1556166	1556173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_014006	GGCC	2	8	1558093	1558100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_014006	AGAA	2	8	1562364	1562371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_014006	GCCT	2	8	1566229	1566236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_014006	GAGG	2	8	1568589	1568596	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014006	GCAG	2	8	1570098	1570105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_014006	CCTG	2	8	1570135	1570142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_014006	GCCG	2	8	1570652	1570659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_014006	AATT	2	8	1576183	1576190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_014006	GATT	2	8	1581426	1581433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014006	TCGG	2	8	1581527	1581534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014006	AAGG	2	8	1581609	1581616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014006	CCTG	2	8	1582305	1582312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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