MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	ATCCCG	2	12	110	121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	293980645
2	NC_014005	CACGCG	2	12	2705	2716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	293980648
3	NC_014005	AGCTTG	2	12	3307	3318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293980650
4	NC_014005	GGCCAA	2	12	8636	8647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014005	CTGCGC	2	12	9683	9694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	293980658
6	NC_014005	CCGGTG	2	12	9753	9764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293980658
7	NC_014005	GATGCC	2	12	11819	11830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	293980661
8	NC_014005	AGAAGG	2	12	17052	17063	50 %	0 %	50 %	0 %	293980669
9	NC_014005	CTGCGC	2	12	19538	19549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	293980672
10	NC_014005	GTCGCG	2	12	19832	19843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293980672
11	NC_014005	GCCAGC	2	12	21810	21821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	293980677
12	NC_014005	CGCGCC	2	12	22540	22551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
13	NC_014005	CGGCGT	2	12	23060	23071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293980678
14	NC_014005	GCGTGG	2	12	23258	23269	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	293980678
15	NC_014005	TGCCGG	2	12	24481	24492	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293980678
16	NC_014005	CGGAAG	2	12	26313	26324	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	293980680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.