MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	GGCCT	2	10	1516	1525	0 %	20 %	40 %	40 %	293980647
2	NC_014005	ATCGC	2	10	1607	1616	20 %	20 %	20 %	40 %	293980647
3	NC_014005	GCCCA	2	10	2471	2480	20 %	0 %	20 %	60 %	293980648
4	NC_014005	GCCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	20 %	40 %	293980649
5	NC_014005	CGCAG	2	10	2925	2934	20 %	0 %	40 %	40 %	293980649
6	NC_014005	GCGCC	2	10	3901	3910	0 %	0 %	40 %	60 %	293980652
7	NC_014005	GCGGA	2	10	4526	4535	20 %	0 %	60 %	20 %	293980654
8	NC_014005	CCCAA	2	10	5463	5472	40 %	0 %	0 %	60 %	293980656
9	NC_014005	GCCGA	2	10	5641	5650	20 %	0 %	40 %	40 %	293980656
10	NC_014005	CGGTG	2	10	5853	5862	0 %	20 %	60 %	20 %	293980656
11	NC_014005	TGCCG	2	10	6151	6160	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
12	NC_014005	GCCCG	2	10	6265	6274	0 %	0 %	40 %	60 %	293980656
13	NC_014005	TCGGC	2	10	6336	6345	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
14	NC_014005	GCGCG	2	10	6774	6783	0 %	0 %	60 %	40 %	293980656
15	NC_014005	TCGCG	2	10	7077	7086	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
16	NC_014005	GACGC	2	10	7661	7670	20 %	0 %	40 %	40 %	293980656
17	NC_014005	GTGAT	2	10	7830	7839	20 %	40 %	40 %	0 %	293980657
18	NC_014005	GAATG	2	10	8650	8659	40 %	20 %	40 %	0 %	293980658
19	NC_014005	AACGG	2	10	10734	10743	40 %	0 %	40 %	20 %	293980659
20	NC_014005	CGTCG	2	10	12780	12789	0 %	20 %	40 %	40 %	293980663
21	NC_014005	CGCGC	2	10	12954	12963	0 %	0 %	40 %	60 %	293980664
22	NC_014005	CGGCG	2	10	13333	13342	0 %	0 %	60 %	40 %	293980664
23	NC_014005	TGACG	2	10	13753	13762	20 %	20 %	40 %	20 %	293980664
24	NC_014005	AGCCG	2	10	17838	17847	20 %	0 %	40 %	40 %	293980669
25	NC_014005	ATCAC	2	10	18824	18833	40 %	20 %	0 %	40 %	293980670
26	NC_014005	TGTCG	2	10	18998	19007	0 %	40 %	40 %	20 %	293980671
27	NC_014005	GCCCC	2	10	21756	21765	0 %	0 %	20 %	80 %	293980677
28	NC_014005	CCGCG	2	10	21929	21938	0 %	0 %	40 %	60 %	293980677
29	NC_014005	GCCGC	2	10	23192	23201	0 %	0 %	40 %	60 %	293980678
30	NC_014005	CCATG	2	10	24016	24025	20 %	20 %	20 %	40 %	293980678
31	NC_014005	TCGCC	2	10	24043	24052	0 %	20 %	20 %	60 %	293980678
32	NC_014005	GCCGC	2	10	24414	24423	0 %	0 %	40 %	60 %	293980678
33	NC_014005	CTCGC	2	10	26436	26445	0 %	20 %	20 %	60 %	293980681
34	NC_014005	ACGCC	2	10	27384	27393	20 %	0 %	20 %	60 %	293980683
35	NC_014005	CTGGC	2	10	27730	27739	0 %	20 %	40 %	40 %	293980683
36	NC_014005	CCCGG	2	10	29082	29091	0 %	0 %	40 %	60 %	293980685
37	NC_014005	GCGCC	2	10	29897	29906	0 %	0 %	40 %	60 %	293980685

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.