MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	TCGC	2	8	193	200	0 %	25 %	25 %	50 %	293980645
2	NC_014005	TCCG	2	8	1361	1368	0 %	25 %	25 %	50 %	293980646
3	NC_014005	ATCT	2	8	3420	3427	25 %	50 %	0 %	25 %	293980650
4	NC_014005	AAAG	2	8	3491	3498	75 %	0 %	25 %	0 %	293980650
5	NC_014005	CGCT	2	8	3579	3586	0 %	25 %	25 %	50 %	293980651
6	NC_014005	ATGG	2	8	6136	6143	25 %	25 %	50 %	0 %	293980656
7	NC_014005	CGGT	2	8	6191	6198	0 %	25 %	50 %	25 %	293980656
8	NC_014005	GGCA	2	8	6610	6617	25 %	0 %	50 %	25 %	293980656
9	NC_014005	TCGC	2	8	6700	6707	0 %	25 %	25 %	50 %	293980656
10	NC_014005	CGAG	2	8	6810	6817	25 %	0 %	50 %	25 %	293980656
11	NC_014005	AGGG	2	8	7030	7037	25 %	0 %	75 %	0 %	293980656
12	NC_014005	GGAC	2	8	7785	7792	25 %	0 %	50 %	25 %	293980657
13	NC_014005	ACCT	2	8	8060	8067	25 %	25 %	0 %	50 %	293980657
14	NC_014005	CGAT	2	8	8097	8104	25 %	25 %	25 %	25 %	293980657
15	NC_014005	TCGC	2	8	9710	9717	0 %	25 %	25 %	50 %	293980658
16	NC_014005	GCTG	2	8	9808	9815	0 %	25 %	50 %	25 %	293980658
17	NC_014005	TCGG	2	8	10051	10058	0 %	25 %	50 %	25 %	293980659
18	NC_014005	CTGC	2	8	10212	10219	0 %	25 %	25 %	50 %	293980659
19	NC_014005	GCTG	2	8	10718	10725	0 %	25 %	50 %	25 %	293980659
20	NC_014005	TCCA	2	8	10859	10866	25 %	25 %	0 %	50 %	293980659
21	NC_014005	AGCG	2	8	11146	11153	25 %	0 %	50 %	25 %	293980659
22	NC_014005	CCAT	2	8	11811	11818	25 %	25 %	0 %	50 %	293980661
23	NC_014005	CGAC	2	8	12063	12070	25 %	0 %	25 %	50 %	293980661
24	NC_014005	GGCC	2	8	12424	12431	0 %	0 %	50 %	50 %	293980662
25	NC_014005	GCGT	2	8	13113	13120	0 %	25 %	50 %	25 %	293980664
26	NC_014005	CTGG	2	8	13132	13139	0 %	25 %	50 %	25 %	293980664
27	NC_014005	GTGG	2	8	13265	13272	0 %	25 %	75 %	0 %	293980664
28	NC_014005	TTCG	2	8	13318	13325	0 %	50 %	25 %	25 %	293980664
29	NC_014005	GACT	2	8	14082	14089	25 %	25 %	25 %	25 %	293980665
30	NC_014005	ATCA	2	8	14729	14736	50 %	25 %	0 %	25 %	293980665
31	NC_014005	TGCT	2	8	15242	15249	0 %	50 %	25 %	25 %	293980666
32	NC_014005	CTGT	2	8	15505	15512	0 %	50 %	25 %	25 %	293980667
33	NC_014005	GCAG	2	8	16929	16936	25 %	0 %	50 %	25 %	293980669
34	NC_014005	GCAG	2	8	17193	17200	25 %	0 %	50 %	25 %	293980669
35	NC_014005	CCTT	2	8	17211	17218	0 %	50 %	0 %	50 %	293980669
36	NC_014005	ACAT	2	8	17681	17688	50 %	25 %	0 %	25 %	293980669
37	NC_014005	GCTC	2	8	17859	17866	0 %	25 %	25 %	50 %	293980669
38	NC_014005	ATCG	2	8	18559	18566	25 %	25 %	25 %	25 %	293980670
39	NC_014005	AGGT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	50 %	0 %	293980670
40	NC_014005	TCCG	2	8	18868	18875	0 %	25 %	25 %	50 %	293980670
41	NC_014005	GAGC	2	8	19079	19086	25 %	0 %	50 %	25 %	293980671
42	NC_014005	GAGC	2	8	19893	19900	25 %	0 %	50 %	25 %	293980672
43	NC_014005	AAGC	2	8	20854	20861	50 %	0 %	25 %	25 %	293980674
44	NC_014005	GATA	2	8	21450	21457	50 %	25 %	25 %	0 %	293980676
45	NC_014005	TGGT	2	8	21575	21582	0 %	50 %	50 %	0 %	293980676
46	NC_014005	CAGC	2	8	21907	21914	25 %	0 %	25 %	50 %	293980677
47	NC_014005	CATC	2	8	22789	22796	25 %	25 %	0 %	50 %	293980678
48	NC_014005	GCCC	2	8	22945	22952	0 %	0 %	25 %	75 %	293980678
49	NC_014005	CTTC	2	8	23050	23057	0 %	50 %	0 %	50 %	293980678
50	NC_014005	CCCG	2	8	24630	24637	0 %	0 %	25 %	75 %	293980678
51	NC_014005	GGAA	2	8	26338	26345	50 %	0 %	50 %	0 %	293980680
52	NC_014005	TGAC	2	8	26353	26360	25 %	25 %	25 %	25 %	293980680
53	NC_014005	GCTC	2	8	27587	27594	0 %	25 %	25 %	50 %	293980683
54	NC_014005	CGCC	2	8	28601	28608	0 %	0 %	25 %	75 %	293980685
55	NC_014005	CCGC	2	8	29482	29489	0 %	0 %	25 %	75 %	293980685
56	NC_014005	CGAT	2	8	30288	30295	25 %	25 %	25 %	25 %	293980686

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.