MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980645
2	NC_014005	CGA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980645
3	NC_014005	CAC	2	6	474	479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980645
4	NC_014005	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980645
5	NC_014005	GCG	2	6	707	712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980645
6	NC_014005	TGC	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980645
7	NC_014005	TCG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980645
8	NC_014005	ATC	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980645
9	NC_014005	ACG	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980645
10	NC_014005	TGG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980645
11	NC_014005	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980645
12	NC_014005	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980645
13	NC_014005	CTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980646
14	NC_014005	GTC	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980646
15	NC_014005	GTC	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980646
16	NC_014005	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293980646
17	NC_014005	CGG	2	6	1298	1303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980646
18	NC_014005	CGC	2	6	1420	1425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980647
19	NC_014005	TCG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980647
20	NC_014005	CCG	2	6	1791	1796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980647
21	NC_014005	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980647
22	NC_014005	GAT	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980647
23	NC_014005	CGT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980647
24	NC_014005	CAT	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980648
25	NC_014005	TCC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293980648
26	NC_014005	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980648
27	NC_014005	GCG	2	6	2248	2253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980648
28	NC_014005	CTT	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980648
29	NC_014005	GTG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980648
30	NC_014005	GGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980648
31	NC_014005	CTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980648
32	NC_014005	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980648
33	NC_014005	CGG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980649
34	NC_014005	GAC	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980649
35	NC_014005	GTC	2	6	3074	3079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980649
36	NC_014005	CGA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980650
37	NC_014005	CGA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980650
38	NC_014005	AGG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980651
39	NC_014005	GGT	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980651
40	NC_014005	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980651
41	NC_014005	AAG	2	6	3813	3818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980651
42	NC_014005	GGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980652
43	NC_014005	ATG	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980652
44	NC_014005	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980653
45	NC_014005	CGA	2	6	4193	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980653
46	NC_014005	GAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980654
47	NC_014005	CGA	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980654
48	NC_014005	ATT	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293980654
49	NC_014005	CGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980654
50	NC_014005	TCG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980654
51	NC_014005	GCC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980654
52	NC_014005	GCC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
53	NC_014005	TCG	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980655
54	NC_014005	TTG	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980655
55	NC_014005	GCC	2	6	5161	5166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
56	NC_014005	GCC	2	6	5212	5217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
57	NC_014005	GCG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980655
58	NC_014005	CGC	2	6	5306	5311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
59	NC_014005	CCG	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
60	NC_014005	TGA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980656
61	NC_014005	CGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
62	NC_014005	TCG	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
63	NC_014005	CTG	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
64	NC_014005	CTG	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
65	NC_014005	CTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980656
66	NC_014005	GAG	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980656
67	NC_014005	TCG	2	6	6042	6047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
68	NC_014005	CGC	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
69	NC_014005	GAG	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980656
70	NC_014005	GCG	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
71	NC_014005	TGG	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980656
72	NC_014005	CCG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
73	NC_014005	GGC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
74	NC_014005	GCC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
75	NC_014005	GCA	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
76	NC_014005	GGC	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
77	NC_014005	ACA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980656
78	NC_014005	TCG	2	6	6653	6658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
79	NC_014005	CAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980656
80	NC_014005	GCA	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
81	NC_014005	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
82	NC_014005	AGC	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
83	NC_014005	ACG	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
84	NC_014005	GAT	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980656
85	NC_014005	CCG	2	6	7286	7291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
86	NC_014005	TGC	2	6	7297	7302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
87	NC_014005	CGC	2	6	7441	7446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
88	NC_014005	ACG	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980657
89	NC_014005	GGC	2	6	7995	8000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980657
90	NC_014005	ACC	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980657
91	NC_014005	GCA	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980657
92	NC_014005	GCC	2	6	8555	8560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980657
93	NC_014005	GAG	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980658
94	NC_014005	GAG	2	6	8699	8704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980658
95	NC_014005	CTT	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980658
96	NC_014005	CGG	2	6	8812	8817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980658
97	NC_014005	GGA	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980658
98	NC_014005	CGG	2	6	8842	8847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980658
99	NC_014005	GCT	2	6	8884	8889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980658
100	NC_014005	GCC	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980658
101	NC_014005	AGC	2	6	9219	9224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980658
102	NC_014005	GAG	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980658
103	NC_014005	CAG	2	6	9377	9382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980658
104	NC_014005	CGG	2	6	9385	9390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980658
105	NC_014005	TGC	2	6	9402	9407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980658
106	NC_014005	TTG	2	6	9423	9428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980658
107	NC_014005	TGC	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980658
108	NC_014005	TGA	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980658
109	NC_014005	CCG	2	6	9543	9548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980658
110	NC_014005	CAT	2	6	9568	9573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980658
111	NC_014005	ATC	2	6	9578	9583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980658
112	NC_014005	GCC	2	6	9590	9595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980658
113	NC_014005	TCG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980658
114	NC_014005	AAG	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980658
115	NC_014005	CGG	2	6	9799	9804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980658
116	NC_014005	TTC	2	6	9833	9838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980658
117	NC_014005	CGC	2	6	9863	9868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980658
118	NC_014005	AAG	2	6	9878	9883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980658
119	NC_014005	CTG	2	6	9888	9893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980658
120	NC_014005	CCT	2	6	10027	10032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293980659
121	NC_014005	TTC	2	6	10086	10091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980659
122	NC_014005	AGG	2	6	10171	10176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980659
123	NC_014005	CGA	2	6	10478	10483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980659
124	NC_014005	GCC	2	6	10749	10754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980659
125	NC_014005	GGC	2	6	10796	10801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980659
126	NC_014005	AGA	2	6	10802	10807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980659
127	NC_014005	TGC	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980659
128	NC_014005	CTT	2	6	10853	10858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980659
129	NC_014005	GTA	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980659
130	NC_014005	CGC	2	6	11117	11122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980659
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254	NC_014005	CTA	2	6	20285	20290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980673
255	NC_014005	GCC	2	6	20343	20348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980673
256	NC_014005	CTG	2	6	20378	20383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980673
257	NC_014005	CGC	2	6	20447	20452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980673
258	NC_014005	CAG	2	6	20533	20538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980673
259	NC_014005	TGG	2	6	20548	20553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980673
260	NC_014005	GCT	2	6	20785	20790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980674
261	NC_014005	GCG	2	6	20825	20830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980674
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377	NC_014005	CGC	2	6	29783	29788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
378	NC_014005	GCC	2	6	29794	29799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
379	NC_014005	GCA	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980685
380	NC_014005	GCC	2	6	30076	30081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980685
381	NC_014005	TCG	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980685
382	NC_014005	CGA	2	6	30375	30380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980686
383	NC_014005	ATC	2	6	30472	30477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980686
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.