MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	GC	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	293980645
2	NC_014005	GC	3	6	694	699	0 %	0 %	50 %	50 %	293980645
3	NC_014005	TG	3	6	1239	1244	0 %	50 %	50 %	0 %	293980646
4	NC_014005	GC	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	293980647
5	NC_014005	CG	4	8	1782	1789	0 %	0 %	50 %	50 %	293980647
6	NC_014005	GA	3	6	2030	2035	50 %	0 %	50 %	0 %	293980647
7	NC_014005	GC	3	6	2276	2281	0 %	0 %	50 %	50 %	293980648
8	NC_014005	GC	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	293980648
9	NC_014005	GA	3	6	2968	2973	50 %	0 %	50 %	0 %	293980649
10	NC_014005	GC	3	6	3920	3925	0 %	0 %	50 %	50 %	293980652
11	NC_014005	CG	4	8	3984	3991	0 %	0 %	50 %	50 %	293980652
12	NC_014005	GC	3	6	4346	4351	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
13	NC_014005	CG	3	6	4438	4443	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
14	NC_014005	GC	3	6	4502	4507	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
15	NC_014005	CG	5	10	4708	4717	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
16	NC_014005	CG	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	293980655
17	NC_014005	GC	3	6	5537	5542	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
18	NC_014005	GC	3	6	6423	6428	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
19	NC_014005	GC	3	6	6927	6932	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
20	NC_014005	GA	3	6	8483	8488	50 %	0 %	50 %	0 %	293980657
21	NC_014005	CG	3	6	8872	8877	0 %	0 %	50 %	50 %	293980658
22	NC_014005	GC	3	6	9213	9218	0 %	0 %	50 %	50 %	293980658
23	NC_014005	CT	3	6	9447	9452	0 %	50 %	0 %	50 %	293980658
24	NC_014005	CG	3	6	9989	9994	0 %	0 %	50 %	50 %	293980659
25	NC_014005	GC	3	6	10380	10385	0 %	0 %	50 %	50 %	293980659
26	NC_014005	TC	3	6	11287	11292	0 %	50 %	0 %	50 %	293980659
27	NC_014005	TA	3	6	11408	11413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014005	GC	3	6	11449	11454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014005	GC	3	6	12132	12137	0 %	0 %	50 %	50 %	293980662
30	NC_014005	GC	5	10	12281	12290	0 %	0 %	50 %	50 %	293980662
31	NC_014005	CG	3	6	12380	12385	0 %	0 %	50 %	50 %	293980662
32	NC_014005	CG	3	6	12534	12539	0 %	0 %	50 %	50 %	293980663
33	NC_014005	GC	3	6	12774	12779	0 %	0 %	50 %	50 %	293980663
34	NC_014005	CG	3	6	12793	12798	0 %	0 %	50 %	50 %	293980663
35	NC_014005	GA	3	6	12818	12823	50 %	0 %	50 %	0 %	293980663
36	NC_014005	CG	4	8	12899	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
37	NC_014005	GC	4	8	12968	12975	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
38	NC_014005	CG	3	6	13005	13010	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
39	NC_014005	GC	3	6	13083	13088	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
40	NC_014005	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
41	NC_014005	CG	3	6	13324	13329	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
42	NC_014005	GC	4	8	13486	13493	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
43	NC_014005	CG	4	8	13522	13529	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
44	NC_014005	CG	3	6	13592	13597	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
45	NC_014005	CG	3	6	13640	13645	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
46	NC_014005	CT	3	6	13949	13954	0 %	50 %	0 %	50 %	293980665
47	NC_014005	CA	3	6	14226	14231	50 %	0 %	0 %	50 %	293980665
48	NC_014005	GC	3	6	15809	15814	0 %	0 %	50 %	50 %	293980667
49	NC_014005	CG	3	6	16539	16544	0 %	0 %	50 %	50 %	293980668
50	NC_014005	TG	3	6	16772	16777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014005	GC	3	6	17300	17305	0 %	0 %	50 %	50 %	293980669
52	NC_014005	CT	3	6	18174	18179	0 %	50 %	0 %	50 %	293980670
53	NC_014005	GC	3	6	19128	19133	0 %	0 %	50 %	50 %	293980671
54	NC_014005	GC	3	6	19151	19156	0 %	0 %	50 %	50 %	293980671
55	NC_014005	CG	4	8	19174	19181	0 %	0 %	50 %	50 %	293980671
56	NC_014005	CG	3	6	19667	19672	0 %	0 %	50 %	50 %	293980672
57	NC_014005	GC	4	8	20022	20029	0 %	0 %	50 %	50 %	293980672
58	NC_014005	CG	3	6	20934	20939	0 %	0 %	50 %	50 %	293980674
59	NC_014005	GC	3	6	21388	21393	0 %	0 %	50 %	50 %	293980676
60	NC_014005	CT	3	6	21555	21560	0 %	50 %	0 %	50 %	293980676
61	NC_014005	CG	3	6	21836	21841	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
62	NC_014005	CG	4	8	21963	21970	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
63	NC_014005	GC	3	6	21988	21993	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
64	NC_014005	GC	3	6	22021	22026	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
65	NC_014005	CG	4	8	22182	22189	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
66	NC_014005	GC	3	6	22211	22216	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
67	NC_014005	CG	3	6	22262	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
68	NC_014005	GC	3	6	22387	22392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014005	CT	3	6	22415	22420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014005	GC	3	6	22743	22748	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
71	NC_014005	CG	3	6	22867	22872	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
72	NC_014005	CG	3	6	22907	22912	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
73	NC_014005	CG	3	6	23003	23008	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
74	NC_014005	CG	3	6	23449	23454	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
75	NC_014005	CG	4	8	23806	23813	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
76	NC_014005	CG	4	8	23872	23879	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
77	NC_014005	CG	3	6	23995	24000	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
78	NC_014005	CG	3	6	24301	24306	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
79	NC_014005	GC	3	6	24438	24443	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
80	NC_014005	CG	3	6	24454	24459	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
81	NC_014005	GA	3	6	24618	24623	50 %	0 %	50 %	0 %	293980678
82	NC_014005	CG	3	6	24691	24696	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
83	NC_014005	CG	4	8	24907	24914	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
84	NC_014005	CG	3	6	25041	25046	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
85	NC_014005	CG	3	6	25321	25326	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
86	NC_014005	CG	3	6	25403	25408	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
87	NC_014005	GC	3	6	25653	25658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014005	GA	3	6	25771	25776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014005	CG	3	6	25790	25795	0 %	0 %	50 %	50 %	293980679
90	NC_014005	CG	3	6	26249	26254	0 %	0 %	50 %	50 %	293980680
91	NC_014005	CG	3	6	26512	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	293980681
92	NC_014005	CG	3	6	26628	26633	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
93	NC_014005	CG	3	6	26666	26671	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
94	NC_014005	GC	3	6	26800	26805	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
95	NC_014005	CG	4	8	27069	27076	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
96	NC_014005	TC	3	6	27222	27227	0 %	50 %	0 %	50 %	293980683
97	NC_014005	CG	4	8	27279	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
98	NC_014005	CG	3	6	27479	27484	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
99	NC_014005	CG	3	6	27632	27637	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
100	NC_014005	CG	3	6	27643	27648	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
101	NC_014005	GC	3	6	27675	27680	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
102	NC_014005	GC	3	6	27953	27958	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
103	NC_014005	TC	3	6	28265	28270	0 %	50 %	0 %	50 %	293980684
104	NC_014005	CG	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
105	NC_014005	CG	3	6	28375	28380	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
106	NC_014005	CG	3	6	28584	28589	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
107	NC_014005	CG	4	8	28610	28617	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
108	NC_014005	GC	3	6	28832	28837	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
109	NC_014005	CG	3	6	29120	29125	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
110	NC_014005	GC	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
111	NC_014005	CG	5	10	29729	29738	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
112	NC_014005	GC	3	6	29813	29818	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
113	NC_014005	CG	3	6	29883	29888	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
114	NC_014005	CG	3	6	30024	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
115	NC_014005	GC	3	6	31004	31009	0 %	0 %	50 %	50 %	293980687
116	NC_014005	AT	3	6	31549	31554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.