MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Sulcia muelleri DMIN chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014004	AAATGA	2	12	2823	2834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977748
2	NC_014004	ATAATT	2	12	3567	3578	50 %	50 %	0 %	0 %	293977749
3	NC_014004	ATTTTT	2	12	3773	3784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	293977749
4	NC_014004	AATTTA	2	12	3816	3827	50 %	50 %	0 %	0 %	293977749
5	NC_014004	TGTAGG	2	12	4099	4110	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	293977749
6	NC_014004	TAAAGT	2	12	4555	4566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977749
7	NC_014004	ATAACA	2	12	4727	4738	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	293977749
8	NC_014004	TAAAAA	2	12	5303	5314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	293977750
9	NC_014004	TATCTA	2	12	6251	6262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	293977750
10	NC_014004	TAAAGA	2	12	6297	6308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977750
11	NC_014004	ATATAC	2	12	6816	6827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	293977751
12	NC_014004	TTAAAT	2	12	7025	7036	50 %	50 %	0 %	0 %	293977751
13	NC_014004	TTAATT	2	12	7625	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977751
14	NC_014004	TATAAA	2	12	9190	9201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977752
15	NC_014004	AATTAA	2	12	10882	10893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977753
16	NC_014004	TAGGAG	2	12	11179	11190	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	293977753
17	NC_014004	AATTAA	2	12	11534	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977753
18	NC_014004	GTAAGA	2	12	11955	11966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	293977753
19	NC_014004	GATTTT	2	12	12878	12889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	293977754
20	NC_014004	CTAAAA	2	12	13389	13400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	293977754
21	NC_014004	AATCCA	2	12	13617	13628	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
22	NC_014004	AATCCA	2	12	13641	13652	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
23	NC_014004	AATCCA	2	12	13665	13676	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
24	NC_014004	AATCCA	2	12	13689	13700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
25	NC_014004	AATCCA	2	12	13713	13724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
26	NC_014004	AATCCA	2	12	13737	13748	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
27	NC_014004	AATCCA	2	12	13761	13772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
28	NC_014004	AATCCA	2	12	13785	13796	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977754
29	NC_014004	AAATTA	6	36	13820	13855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977754
30	NC_014004	TTTTAA	2	12	14251	14262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977754
31	NC_014004	AAGAAA	2	12	14599	14610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	293977755
32	NC_014004	TAAAAT	2	12	15132	15143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977755
33	NC_014004	ATTAGA	2	12	17144	17155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977757
34	NC_014004	CTATAG	2	12	18305	18316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	293977759
35	NC_014004	ATTTGG	2	12	18432	18443	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	293977759
36	NC_014004	TAATAT	2	12	18752	18763	50 %	50 %	0 %	0 %	293977760
37	NC_014004	ATCTCT	2	12	19065	19076	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	293977760
38	NC_014004	CAGAAG	2	12	20234	20245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	293977762
39	NC_014004	TATATT	2	12	22613	22624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014004	TTAATT	2	12	22741	22752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977765
41	NC_014004	TAGAAA	2	12	22956	22967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977765
42	NC_014004	TTGAAA	2	12	23434	23445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977766
43	NC_014004	TTAGAC	2	12	24243	24254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	293977766
44	NC_014004	TATTGA	2	12	25128	25139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977767
45	NC_014004	ATTTTT	3	18	25437	25454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	293977767
46	NC_014004	AAGGTA	2	12	27928	27939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	293977769
47	NC_014004	AGTCTT	2	12	30942	30953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	293977773
48	NC_014004	ATTTAA	2	12	33087	33098	50 %	50 %	0 %	0 %	293977775
49	NC_014004	AAAATA	2	12	34057	34068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	293977778
50	NC_014004	TGATAA	2	12	34326	34337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977778
51	NC_014004	GTTTTA	2	12	34522	34533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	293977778
52	NC_014004	TTAAAT	2	12	35967	35978	50 %	50 %	0 %	0 %	293977779
53	NC_014004	TTCTTT	2	12	39410	39421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	293977783
54	NC_014004	TAATGC	2	12	41070	41081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	293977784
55	NC_014004	TATTTT	2	12	41241	41252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	293977784
56	NC_014004	AAAATT	2	12	42243	42254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977785
57	NC_014004	AATTAA	2	12	42512	42523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977785
58	NC_014004	TTTTAA	2	12	44034	44045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977786
59	NC_014004	CCAATT	2	12	44089	44100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293977786
60	NC_014004	TCTTTT	2	12	45046	45057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	293977786
61	NC_014004	GGAGAT	2	12	45840	45851	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	293977787
62	NC_014004	GGAGCT	2	12	46047	46058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	293977787
63	NC_014004	ATATAA	2	12	46081	46092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977787
64	NC_014004	TTCTTT	2	12	46557	46568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	293977788
65	NC_014004	AATTTA	2	12	47798	47809	50 %	50 %	0 %	0 %	293977789
66	NC_014004	TAGGAA	2	12	49917	49928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	293977793
67	NC_014004	CATAAT	4	24	50734	50757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	293977794
68	NC_014004	TATAAT	2	12	50758	50769	50 %	50 %	0 %	0 %	293977794
69	NC_014004	TATCAT	2	12	50770	50781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	293977794
70	NC_014004	GAATAA	2	12	50808	50819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977794
71	NC_014004	ATCATT	2	12	50822	50833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	293977794
72	NC_014004	ATCATA	2	12	50945	50956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	293977794
73	NC_014004	CACCTA	2	12	51124	51135	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	293977794
74	NC_014004	TTAAAA	2	12	51207	51218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977794
75	NC_014004	CTTTAT	2	12	51385	51396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	293977794
76	NC_014004	ATTAGT	2	12	52259	52270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977794
77	NC_014004	ACTTTT	2	12	52653	52664	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	293977794
78	NC_014004	TAATTT	2	12	53234	53245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977794
79	NC_014004	CTTTTA	2	12	54130	54141	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	293977794
80	NC_014004	ATTTGA	2	12	54435	54446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977794
81	NC_014004	TGCTTA	2	12	54480	54491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	293977794
82	NC_014004	TTACTT	2	12	54531	54542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	293977795
83	NC_014004	TGTTCT	2	12	54546	54557	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	293977795
84	NC_014004	TTTTTC	2	12	56369	56380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	293977795
85	NC_014004	TTTTTC	2	12	58141	58152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	293977795
86	NC_014004	TTCAAT	2	12	58520	58531	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	293977796
87	NC_014004	TCTGTT	2	12	58758	58769	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	293977796
88	NC_014004	TAGCTG	4	24	58891	58914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293977796
89	NC_014004	ATTTTA	2	12	59263	59274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977796
90	NC_014004	TTATAT	2	12	59368	59379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977796
91	NC_014004	TTCTAC	2	12	60821	60832	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	293977799
92	NC_014004	GAGCCA	2	12	61951	61962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014004	TAAATA	2	12	62300	62311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014004	TGTAAT	2	12	62436	62447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977800
95	NC_014004	TTATAA	2	12	62824	62835	50 %	50 %	0 %	0 %	293977800
96	NC_014004	AAAATA	2	12	65758	65769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	293977801
97	NC_014004	TTAATT	2	12	66280	66291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977801
98	NC_014004	TAGGTA	2	12	68146	68157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293977803
99	NC_014004	AGATAT	2	12	68972	68983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977804
100	NC_014004	TAATTT	2	12	69423	69434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977805
101	NC_014004	TTTAAT	2	12	69815	69826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977805
102	NC_014004	TTAATT	2	12	70097	70108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977805
103	NC_014004	TAAAGT	2	12	71888	71899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014004	TATAAA	2	12	78649	78660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014004	TAGTTC	2	12	78740	78751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	293977810
106	NC_014004	AAAACA	2	12	80415	80426	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	293977812
107	NC_014004	TAGATA	2	12	82873	82884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977812
108	NC_014004	TAGCTG	2	12	84600	84611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293977815
109	NC_014004	TATATT	2	12	84664	84675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014004	TGCACC	2	12	86097	86108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	293977816
111	NC_014004	ATTAAG	2	12	86912	86923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	293977817
112	NC_014004	ATAAAG	2	12	87037	87048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977817
113	NC_014004	TAAAAA	2	12	87526	87537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	293977819
114	NC_014004	AAAATA	2	12	87830	87841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	293977820
115	NC_014004	TGATAT	2	12	90796	90807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977824
116	NC_014004	TTTTAA	2	12	90850	90861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977824
117	NC_014004	ATTAAA	2	12	90929	90940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293977824
118	NC_014004	TCCTTT	2	12	93299	93310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293977826
119	NC_014004	AAATCC	2	12	93902	93913	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	293977826
120	NC_014004	TAAAAG	2	12	93928	93939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	293977826
121	NC_014004	CTATTT	2	12	95161	95172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	293977828
122	NC_014004	GATTTA	2	12	95430	95441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	293977828
123	NC_014004	AGCTAA	2	12	96867	96878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	293977829
124	NC_014004	CTATTC	2	12	97124	97135	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	293977829
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243	NC_014004	ATTAAT	2	12	196799	196810	50 %	50 %	0 %	0 %	293977912
244	NC_014004	TTAATT	2	12	196971	196982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293977912
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.