MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri DMIN chromosome

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014004	TTAAA	2	10	12315	12324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014004	ATTAA	2	10	16833	16842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014004	TTACA	2	10	23326	23335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014004	ATTTT	2	10	60601	60610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014004	CGAGC	2	10	62218	62227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014004	TAAAT	2	10	63675	63684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014004	ATATT	2	10	71825	71834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014004	TTATG	2	10	71867	71876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014004	GGTAA	2	10	72243	72252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014004	TGGAG	2	10	73577	73586	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014004	GTTGC	2	10	74044	74053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014004	GTTGC	2	10	74076	74085	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014004	GTTGC	2	10	74108	74117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014004	AGTAA	2	10	74297	74306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014004	TAGTT	2	10	75163	75172	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014004	ATAGT	2	10	75436	75445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014004	GATAA	2	10	76764	76773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014004	TTATA	2	10	76910	76919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014004	AGGTA	2	10	83121	83130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014004	AATTA	2	10	84676	84685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014004	AAATA	2	10	114496	114505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014004	ATTAT	2	10	137097	137106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014004	TAACT	2	10	137119	137128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014004	ATATA	2	10	137135	137144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014004	ACATT	2	10	144823	144832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014004	TAAAG	2	10	146114	146123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014004	ATAGT	2	10	155013	155022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014004	ATTTT	3	15	165532	165546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014004	ATTAA	2	10	165547	165556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014004	GATAA	2	10	168225	168234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014004	TATAA	2	10	171661	171670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014004	ATATT	3	15	184231	184245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014004	ATGTT	2	10	184248	184257	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014004	CAAAG	2	10	184694	184703	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014004	AAGCA	2	10	184722	184731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014004	GTATA	2	10	184742	184751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014004	GTATG	2	10	184764	184773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014004	TTAAT	2	10	184776	184785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014004	AATAG	2	10	186904	186913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014004	AAATT	2	10	202268	202277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014004	AAATC	2	10	208575	208584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014004	TAAAG	2	10	239197	239206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014004	TAAAT	2	10	239238	239247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.