MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri DMIN chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014004	AATT	3	12	12290	12301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014004	TTGT	2	8	16846	16853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014004	AAAT	2	8	28021	28028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014004	TAAA	2	8	35045	35052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014004	ATTT	2	8	38752	38759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014004	TAAT	2	8	41360	41367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014004	AAAT	2	8	48331	48338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014004	TTAA	2	8	49294	49301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014004	AAGA	2	8	61998	62005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014004	ATAA	2	8	71764	71771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014004	ATTT	3	12	71930	71941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014004	TACG	2	8	72106	72113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014004	AAAG	2	8	72182	72189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014004	TTAG	2	8	72233	72240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014004	AGTT	2	8	72642	72649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014004	ACTA	2	8	72813	72820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014004	AAAT	2	8	73885	73892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014004	GTTG	2	8	73899	73906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014004	GCGA	2	8	74267	74274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014004	GATT	2	8	74326	74333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014004	ATTA	2	8	74394	74401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014004	TTTA	2	8	76221	76228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014004	TCTA	2	8	76643	76650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014004	TTAA	2	8	78438	78445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014004	TAAA	2	8	79369	79376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014004	ATTA	2	8	88711	88718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014004	TAAA	2	8	94764	94771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014004	AATT	2	8	94781	94788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014004	CTGG	2	8	114385	114392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014004	TAAA	2	8	125274	125281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014004	TTTA	2	8	125282	125289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014004	ATAA	2	8	125307	125314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014004	CTTA	2	8	136505	136512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014004	CTTA	2	8	136541	136548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014004	CTTA	2	8	136598	136605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014004	CTTA	2	8	136627	136634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014004	CTTA	2	8	136656	136663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014004	CTTA	2	8	136699	136706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014004	CTTA	2	8	136728	136735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014004	CTTA	2	8	136757	136764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014004	CTTA	2	8	136786	136793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014004	CTTA	2	8	136815	136822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014004	CTTA	2	8	136844	136851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014004	CTTA	2	8	136873	136880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014004	CTTA	2	8	136902	136909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014004	CTTA	2	8	136931	136938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014004	TAAA	2	8	136949	136956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014004	CTTA	2	8	137008	137015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014004	TAAA	2	8	137026	137033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014004	GTAT	2	8	143328	143335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014004	AGCA	2	8	146124	146131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014004	ATTT	2	8	146248	146255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014004	AAAT	2	8	146280	146287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014004	GAAC	2	8	151038	151045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014004	ATTA	2	8	153417	153424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014004	TTAT	2	8	153425	153432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014004	TAAA	2	8	165573	165580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014004	ATAA	2	8	165611	165618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014004	ATAA	2	8	165641	165648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014004	ATTA	2	8	167239	167246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014004	TACA	2	8	167900	167907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014004	TAAA	2	8	168060	168067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014004	TCTT	2	8	168089	168096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014004	TAAG	2	8	168118	168125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014004	AATT	2	8	168210	168217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014004	TAAA	2	8	168649	168656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014004	ATTT	2	8	178733	178740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014004	TAAA	2	8	184263	184270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014004	TACT	2	8	184734	184741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014004	TTTA	2	8	186712	186719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014004	TAAT	2	8	186720	186727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014004	TATT	2	8	193096	193103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014004	TAAA	3	12	202293	202304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014004	ATTA	2	8	203503	203510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014004	TACT	2	8	205252	205259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014004	TAAA	2	8	209917	209924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014004	TAAA	2	8	224054	224061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014004	AATT	2	8	226939	226946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014004	TTTA	2	8	227132	227139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014004	ATAA	2	8	227144	227151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014004	ATTA	2	8	231543	231550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014004	TTAA	2	8	234515	234522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014004	ATTA	2	8	236127	236134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014004	TATT	2	8	236158	236165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014004	TTAT	2	8	239182	239189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014004	TTTA	2	8	239221	239228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.