MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	TAATAT	2	12	46081	46092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014002	AAATGT	2	12	52825	52836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014002	GTTGGT	2	12	63762	63773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014002	ATCACT	2	12	73247	73258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014002	CAAACA	2	12	80863	80874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014002	CTATCC	2	12	85833	85844	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014002	TATTCA	2	12	90500	90511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014002	TTTGTT	2	12	176758	176769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014002	TTTTTC	2	12	233671	233682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014002	AAATAA	2	12	358416	358427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014002	TGTTTT	2	12	362841	362852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014002	TATTTA	2	12	390506	390517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014002	TAAAAA	2	12	429987	429998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014002	TAAAAA	2	12	431409	431420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014002	TATTAC	2	12	446617	446628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014002	AATATT	2	12	450126	450137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014002	TTAATC	2	12	451308	451319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014002	TTGCAT	2	12	451378	451389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014002	TTTATT	2	12	464526	464537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014002	TATTTT	2	12	464568	464579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014002	TATTTA	2	12	476670	476681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014002	CTCTGG	2	12	499858	499869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014002	TTACAA	2	12	502288	502299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014002	GAATAA	2	12	502521	502532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014002	ATGGGT	2	12	518675	518686	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014002	ATACAT	2	12	520857	520868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014002	TCCTTC	2	12	570545	570556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014002	TATATT	2	12	596063	596074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014002	TAATTA	2	12	615785	615796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014002	AAGAAA	2	12	627039	627050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014002	TCCCTT	2	12	682649	682660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014002	TATTTT	2	12	684173	684184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014002	TAAAAA	2	12	691753	691764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014002	TACTTA	2	12	743941	743952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014002	TTTTAT	2	12	747402	747413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014002	GGATAT	2	12	755126	755137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014002	GCAAAA	2	12	813426	813437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014002	CCAGTA	2	12	814485	814496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014002	TCCTTT	2	12	900337	900348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014002	CTTTAG	2	12	919992	920003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014002	GTCAGG	2	12	935432	935443	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014002	CATTGT	2	12	943832	943843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014002	ATCAAT	2	12	995014	995025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014002	TTATAT	2	12	995073	995084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014002	TTGCTA	2	12	1012351	1012362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014002	AAATAT	2	12	1018430	1018441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014002	ATCAAT	2	12	1066443	1066454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014002	CTAATA	2	12	1066567	1066578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014002	TTGCAT	2	12	1088093	1088104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014002	ATTAAT	2	12	1088800	1088811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014002	AAGATA	2	12	1090359	1090370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014002	ATAAGA	2	12	1094928	1094939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014002	AGCCGG	2	12	1095823	1095834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014002	GAACCA	2	12	1095852	1095863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014002	ATATAG	2	12	1114046	1114057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014002	GTAAAA	2	12	1125106	1125117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014002	CAAATT	2	12	1212355	1212366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014002	ATTCCA	2	12	1214279	1214290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014002	AAAATA	2	12	1262167	1262178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014002	CAAAAA	2	12	1266862	1266873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014002	ATATCA	2	12	1276902	1276913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014002	AAATAA	2	12	1386325	1386336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014002	AGGAAA	2	12	1390598	1390609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014002	CAGGTT	2	12	1407939	1407950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014002	ATTTAT	2	12	1461482	1461493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014002	AGTGTG	2	12	1464982	1464993	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014002	GCAACA	2	12	1470518	1470529	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014002	TTGAAT	2	12	1472670	1472681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014002	TTTCTT	2	12	1482582	1482593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014002	TATTTT	2	12	1502133	1502144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014002	TAAATA	2	12	1518832	1518843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014002	AATAAA	2	12	1518980	1518991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014002	ATAAAA	2	12	1527765	1527776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014002	TATGAT	2	12	1532395	1532406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014002	TAAAGA	2	12	1568514	1568525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014002	TATCAA	2	12	1658492	1658503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014002	ACCCAT	2	12	1665383	1665394	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014002	TGGTGT	2	12	1665481	1665492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014002	AACTAA	2	12	1697502	1697513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014002	TATAAA	2	12	1720258	1720269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014002	TCATAT	2	12	1781444	1781455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014002	ACTTCC	2	12	1845179	1845190	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014002	AAAAAG	2	12	1870415	1870426	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014002	AAAAGA	2	12	1874454	1874465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014002	TTTAAT	2	12	1885412	1885423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014002	ACTATA	2	12	1897762	1897773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014002	CGATAT	2	12	1901464	1901475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014002	ACCCGT	2	12	1906897	1906908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014002	TTTTTA	2	12	1942850	1942861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014002	TAAAGT	2	12	1957577	1957588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014002	AAAGTG	2	12	1976068	1976079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.