MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	TGGA	2	8	164	171	25 %	25 %	50 %	0 %	294494691
2	NC_014002	ATAA	2	8	290	297	75 %	25 %	0 %	0 %	294494691
3	NC_014002	CAGG	2	8	1006	1013	25 %	0 %	50 %	25 %	294494691
4	NC_014002	GCTC	2	8	1078	1085	0 %	25 %	25 %	50 %	294494691
5	NC_014002	GGTA	2	8	1268	1275	25 %	25 %	50 %	0 %	294494691
6	NC_014002	GCTG	2	8	1357	1364	0 %	25 %	50 %	25 %	294494691
7	NC_014002	CCCA	2	8	1956	1963	25 %	0 %	0 %	75 %	294494692
8	NC_014002	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	294494693
9	NC_014002	TGAG	2	8	2488	2495	25 %	25 %	50 %	0 %	294494693
10	NC_014002	ATGA	2	8	2670	2677	50 %	25 %	25 %	0 %	294494693
11	NC_014002	GGTA	2	8	2996	3003	25 %	25 %	50 %	0 %	294494693
12	NC_014002	GATC	2	8	3410	3417	25 %	25 %	25 %	25 %	294494693
13	NC_014002	ATTA	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	294494694
14	NC_014002	AGGA	2	8	3766	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	294494694
15	NC_014002	AGTA	2	8	4100	4107	50 %	25 %	25 %	0 %	294494694
16	NC_014002	TTAC	2	8	5149	5156	25 %	50 %	0 %	25 %	294494695
17	NC_014002	CAGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	294494696
18	NC_014002	GCAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	50 %	25 %	294494696
19	NC_014002	CAAG	2	8	7099	7106	50 %	0 %	25 %	25 %	294494696
20	NC_014002	AGGA	2	8	7334	7341	50 %	0 %	50 %	0 %	294494696
21	NC_014002	CTAT	2	8	7475	7482	25 %	50 %	0 %	25 %	294494696
22	NC_014002	GGGA	2	8	7483	7490	25 %	0 %	75 %	0 %	294494696
23	NC_014002	ATTT	2	8	7916	7923	25 %	75 %	0 %	0 %	294494697
24	NC_014002	CTCC	2	8	8042	8049	0 %	25 %	0 %	75 %	294494698
25	NC_014002	CCAC	2	8	10396	10403	25 %	0 %	0 %	75 %	294494700
26	NC_014002	TCTA	2	8	11242	11249	25 %	50 %	0 %	25 %	294494701
27	NC_014002	TACT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	294494701
28	NC_014002	CCTC	2	8	11532	11539	0 %	25 %	0 %	75 %	294494701
29	NC_014002	GACA	2	8	13786	13793	50 %	0 %	25 %	25 %	294494703
30	NC_014002	TTAT	2	8	13902	13909	25 %	75 %	0 %	0 %	294494703
31	NC_014002	CTTT	2	8	14662	14669	0 %	75 %	0 %	25 %	294494704
32	NC_014002	TCCT	2	8	15030	15037	0 %	50 %	0 %	50 %	294494705
33	NC_014002	TGGG	2	8	15193	15200	0 %	25 %	75 %	0 %	294494705
34	NC_014002	CATT	2	8	15815	15822	25 %	50 %	0 %	25 %	294494705
35	NC_014002	TTGT	2	8	15848	15855	0 %	75 %	25 %	0 %	294494706
36	NC_014002	CTGG	2	8	17072	17079	0 %	25 %	50 %	25 %	294494707
37	NC_014002	CTTT	2	8	17171	17178	0 %	75 %	0 %	25 %	294494707
38	NC_014002	GAAA	2	8	18381	18388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014002	AAAT	2	8	18422	18429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014002	TCCT	2	8	18631	18638	0 %	50 %	0 %	50 %	294494709
41	NC_014002	TCAT	2	8	19013	19020	25 %	50 %	0 %	25 %	294494709
42	NC_014002	TCAG	2	8	20153	20160	25 %	25 %	25 %	25 %	294494710
43	NC_014002	TTGT	2	8	20413	20420	0 %	75 %	25 %	0 %	294494710
44	NC_014002	AAAG	2	8	20737	20744	75 %	0 %	25 %	0 %	294494710
45	NC_014002	TCAA	2	8	20974	20981	50 %	25 %	0 %	25 %	294494711
46	NC_014002	TGCC	2	8	21383	21390	0 %	25 %	25 %	50 %	294494711
47	NC_014002	AATG	2	8	21630	21637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014002	CCTG	2	8	22573	22580	0 %	25 %	25 %	50 %	294494712
49	NC_014002	TAGT	2	8	22886	22893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014002	GGCA	2	8	23207	23214	25 %	0 %	50 %	25 %	294494713
51	NC_014002	GTCA	2	8	23358	23365	25 %	25 %	25 %	25 %	294494713
52	NC_014002	CCAG	2	8	23437	23444	25 %	0 %	25 %	50 %	294494713
53	NC_014002	AGTT	2	8	24000	24007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014002	CATT	2	8	24212	24219	25 %	50 %	0 %	25 %	294494714
55	NC_014002	TTCC	2	8	24400	24407	0 %	50 %	0 %	50 %	294494714
56	NC_014002	CGTG	2	8	24623	24630	0 %	25 %	50 %	25 %	294494714
57	NC_014002	TCGA	2	8	25707	25714	25 %	25 %	25 %	25 %	294494715
58	NC_014002	TGAC	2	8	25867	25874	25 %	25 %	25 %	25 %	294494715
59	NC_014002	TCAA	2	8	25891	25898	50 %	25 %	0 %	25 %	294494715
60	NC_014002	TCCT	2	8	26413	26420	0 %	50 %	0 %	50 %	294494716
61	NC_014002	CAGA	2	8	26530	26537	50 %	0 %	25 %	25 %	294494716
62	NC_014002	TAGG	2	8	26657	26664	25 %	25 %	50 %	0 %	294494716
63	NC_014002	AGGT	2	8	27069	27076	25 %	25 %	50 %	0 %	294494716
64	NC_014002	CGAT	2	8	27835	27842	25 %	25 %	25 %	25 %	294494717
65	NC_014002	TCCT	2	8	28359	28366	0 %	50 %	0 %	50 %	294494718
66	NC_014002	CTGG	2	8	28827	28834	0 %	25 %	50 %	25 %	294494718
67	NC_014002	AAAT	2	8	29534	29541	75 %	25 %	0 %	0 %	294494719
68	NC_014002	GGAT	2	8	29800	29807	25 %	25 %	50 %	0 %	294494720
69	NC_014002	GTTG	2	8	30235	30242	0 %	50 %	50 %	0 %	294494720
70	NC_014002	GCCT	2	8	30664	30671	0 %	25 %	25 %	50 %	294494721
71	NC_014002	TGGA	2	8	30958	30965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014002	AATT	4	16	31051	31066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014002	AATA	2	8	31253	31260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014002	ATCA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	0 %	25 %	294494722
75	NC_014002	TGAC	2	8	31729	31736	25 %	25 %	25 %	25 %	294494722
76	NC_014002	AAAG	2	8	32780	32787	75 %	0 %	25 %	0 %	294494722
77	NC_014002	CATC	2	8	33183	33190	25 %	25 %	0 %	50 %	294494723
78	NC_014002	GAAG	2	8	33569	33576	50 %	0 %	50 %	0 %	294494724
79	NC_014002	CCTG	2	8	33807	33814	0 %	25 %	25 %	50 %	294494724
80	NC_014002	CTGC	2	8	35062	35069	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
81	NC_014002	CCTG	2	8	35095	35102	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
82	NC_014002	TTGT	2	8	35556	35563	0 %	75 %	25 %	0 %	294494725
83	NC_014002	TGAG	2	8	35646	35653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014002	AGCA	2	8	35777	35784	50 %	0 %	25 %	25 %	294494726
85	NC_014002	CCCT	2	8	35852	35859	0 %	25 %	0 %	75 %	294494726
86	NC_014002	ATAC	2	8	35873	35880	50 %	25 %	0 %	25 %	294494726
87	NC_014002	AAAC	2	8	36162	36169	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
88	NC_014002	AATT	2	8	36279	36286	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
89	NC_014002	AACA	2	8	36387	36394	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
90	NC_014002	ATCT	2	8	36409	36416	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
91	NC_014002	TATT	2	8	36438	36445	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
92	NC_014002	GGTA	2	8	36487	36494	25 %	25 %	50 %	0 %	294494726
93	NC_014002	GGAA	2	8	36798	36805	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
94	NC_014002	ATCT	2	8	37270	37277	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
95	NC_014002	CATT	2	8	37298	37305	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
96	NC_014002	AACA	2	8	37632	37639	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
97	NC_014002	ATCT	2	8	37867	37874	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
98	NC_014002	TATT	2	8	37896	37903	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
99	NC_014002	ATTT	2	8	37933	37940	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
100	NC_014002	AGAA	2	8	38444	38451	75 %	0 %	25 %	0 %	294494726
101	NC_014002	ACTA	2	8	38539	38546	50 %	25 %	0 %	25 %	294494726
102	NC_014002	GAAA	2	8	38839	38846	75 %	0 %	25 %	0 %	294494726
103	NC_014002	ATTA	2	8	38907	38914	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
104	NC_014002	GAAA	2	8	40417	40424	75 %	0 %	25 %	0 %	294494726
105	NC_014002	GAAT	2	8	40490	40497	50 %	25 %	25 %	0 %	294494726
106	NC_014002	CCAA	2	8	40999	41006	50 %	0 %	0 %	50 %	294494726
107	NC_014002	AGGA	2	8	41641	41648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014002	GAAA	2	8	42018	42025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014002	ATCA	2	8	42232	42239	50 %	25 %	0 %	25 %	294494728
110	NC_014002	TGGA	2	8	42995	43002	25 %	25 %	50 %	0 %	294494729
111	NC_014002	GATG	2	8	43133	43140	25 %	25 %	50 %	0 %	294494729
112	NC_014002	CGAT	2	8	43360	43367	25 %	25 %	25 %	25 %	294494729
113	NC_014002	TCAA	2	8	43496	43503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014002	ATTT	2	8	44219	44226	25 %	75 %	0 %	0 %	294494730
115	NC_014002	TTCA	2	8	44784	44791	25 %	50 %	0 %	25 %	294494731
116	NC_014002	AGGA	2	8	45821	45828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014002	ATCA	2	8	45836	45843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014002	AAAG	2	8	45954	45961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014002	CAAA	2	8	46098	46105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014002	ATGT	2	8	46957	46964	25 %	50 %	25 %	0 %	294494732
121	NC_014002	GTGG	2	8	47062	47069	0 %	25 %	75 %	0 %	294494732
122	NC_014002	CCCT	2	8	47092	47099	0 %	25 %	0 %	75 %	294494732
123	NC_014002	CAGG	2	8	47173	47180	25 %	0 %	50 %	25 %	294494732
124	NC_014002	CTGA	2	8	47686	47693	25 %	25 %	25 %	25 %	294494732
125	NC_014002	CAGG	2	8	47880	47887	25 %	0 %	50 %	25 %	294494733
126	NC_014002	GTAA	2	8	48062	48069	50 %	25 %	25 %	0 %	294494733
127	NC_014002	TCAA	2	8	48273	48280	50 %	25 %	0 %	25 %	294494733
128	NC_014002	CATA	2	8	48579	48586	50 %	25 %	0 %	25 %	294494734
129	NC_014002	ATTG	2	8	48840	48847	25 %	50 %	25 %	0 %	294494734
130	NC_014002	CTGC	2	8	49042	49049	0 %	25 %	25 %	50 %	294494734
131	NC_014002	CTTG	2	8	50002	50009	0 %	50 %	25 %	25 %	294494735
132	NC_014002	GGAT	2	8	50206	50213	25 %	25 %	50 %	0 %	294494735
133	NC_014002	CCAA	2	8	50786	50793	50 %	0 %	0 %	50 %	294494736
134	NC_014002	TCCA	2	8	51084	51091	25 %	25 %	0 %	50 %	294494736
135	NC_014002	AGAT	2	8	51144	51151	50 %	25 %	25 %	0 %	294494736
136	NC_014002	GGAA	2	8	51386	51393	50 %	0 %	50 %	0 %	294494737
137	NC_014002	CACC	2	8	52532	52539	25 %	0 %	0 %	75 %	294494738
138	NC_014002	AAAT	2	8	52625	52632	75 %	25 %	0 %	0 %	294494738
139	NC_014002	CTTT	2	8	52924	52931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014002	AATA	2	8	52969	52976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_014002	GATA	2	8	53627	53634	50 %	25 %	25 %	0 %	294494739
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