MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 4386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014002	GGAT	2	8	448766	448773	25 %	25 %	50 %	0 %	294495111
1002	NC_014002	GAAA	2	8	449841	449848	75 %	0 %	25 %	0 %	294495112
1003	NC_014002	TAAA	2	8	451994	452001	75 %	25 %	0 %	0 %	294495114
1004	NC_014002	GACA	2	8	452165	452172	50 %	0 %	25 %	25 %	294495114
1005	NC_014002	ATGA	2	8	452833	452840	50 %	25 %	25 %	0 %	294495114
1006	NC_014002	TACA	2	8	452874	452881	50 %	25 %	0 %	25 %	294495114
1007	NC_014002	CTGG	2	8	453060	453067	0 %	25 %	50 %	25 %	294495114
1008	NC_014002	TTGA	2	8	453223	453230	25 %	50 %	25 %	0 %	294495114
1009	NC_014002	GAAA	2	8	453341	453348	75 %	0 %	25 %	0 %	294495114
1010	NC_014002	CCGG	2	8	453430	453437	0 %	0 %	50 %	50 %	294495114
1011	NC_014002	CCAG	2	8	453506	453513	25 %	0 %	25 %	50 %	294495114
1012	NC_014002	ACGC	2	8	454017	454024	25 %	0 %	25 %	50 %	294495114
1013	NC_014002	GAAA	2	8	454062	454069	75 %	0 %	25 %	0 %	294495114
1014	NC_014002	CTTG	2	8	454195	454202	0 %	50 %	25 %	25 %	294495114
1015	NC_014002	AGGT	2	8	454613	454620	25 %	25 %	50 %	0 %	294495114
1016	NC_014002	TTCT	2	8	454892	454899	0 %	75 %	0 %	25 %	294495115
1017	NC_014002	TTCT	2	8	455060	455067	0 %	75 %	0 %	25 %	294495115
1018	NC_014002	CATC	2	8	455985	455992	25 %	25 %	0 %	50 %	294495116
1019	NC_014002	CTGT	2	8	456017	456024	0 %	50 %	25 %	25 %	294495116
1020	NC_014002	CCAT	2	8	456640	456647	25 %	25 %	0 %	50 %	294495117
1021	NC_014002	TATC	2	8	456701	456708	25 %	50 %	0 %	25 %	294495117
1022	NC_014002	TATC	2	8	457573	457580	25 %	50 %	0 %	25 %	294495118
1023	NC_014002	GGAT	2	8	458182	458189	25 %	25 %	50 %	0 %	294495120
1024	NC_014002	CCTG	2	8	458987	458994	0 %	25 %	25 %	50 %	294495120
1025	NC_014002	TCCT	2	8	459347	459354	0 %	50 %	0 %	50 %	294495120
1026	NC_014002	GTAC	2	8	459873	459880	25 %	25 %	25 %	25 %	294495121
1027	NC_014002	GCAG	2	8	461521	461528	25 %	0 %	50 %	25 %	294495123
1028	NC_014002	AGGG	2	8	462101	462108	25 %	0 %	75 %	0 %	294495123
1029	NC_014002	AGGA	2	8	462201	462208	50 %	0 %	50 %	0 %	294495123
1030	NC_014002	ATGG	2	8	462747	462754	25 %	25 %	50 %	0 %	294495124
1031	NC_014002	TGCC	2	8	463171	463178	0 %	25 %	25 %	50 %	294495124
1032	NC_014002	GCCA	2	8	463281	463288	25 %	0 %	25 %	50 %	294495124
1033	NC_014002	ATGT	2	8	463399	463406	25 %	50 %	25 %	0 %	294495124
1034	NC_014002	ATTT	2	8	463560	463567	25 %	75 %	0 %	0 %	294495125
1035	NC_014002	ATGT	2	8	464446	464453	25 %	50 %	25 %	0 %	294495126
1036	NC_014002	CATG	2	8	465568	465575	25 %	25 %	25 %	25 %	294495127
1037	NC_014002	GGAT	2	8	466267	466274	25 %	25 %	50 %	0 %	294495128
1038	NC_014002	TCTT	2	8	466336	466343	0 %	75 %	0 %	25 %	294495128
1039	NC_014002	GCAA	2	8	466595	466602	50 %	0 %	25 %	25 %	294495128
1040	NC_014002	AGGC	2	8	467447	467454	25 %	0 %	50 %	25 %	294495130
1041	NC_014002	TGCT	2	8	467644	467651	0 %	50 %	25 %	25 %	294495130
1042	NC_014002	TTCC	2	8	467995	468002	0 %	50 %	0 %	50 %	294495130
1043	NC_014002	CTTC	2	8	468178	468185	0 %	50 %	0 %	50 %	294495130
1044	NC_014002	CTTT	2	8	468317	468324	0 %	75 %	0 %	25 %	294495130
1045	NC_014002	CATC	2	8	468610	468617	25 %	25 %	0 %	50 %	294495130
1046	NC_014002	CCAT	2	8	469785	469792	25 %	25 %	0 %	50 %	294495131
1047	NC_014002	TTGA	2	8	470277	470284	25 %	50 %	25 %	0 %	294495131
1048	NC_014002	GTAT	2	8	471755	471762	25 %	50 %	25 %	0 %	294495132
1049	NC_014002	TGAA	2	8	472291	472298	50 %	25 %	25 %	0 %	294495134
1050	NC_014002	CGAT	2	8	472561	472568	25 %	25 %	25 %	25 %	294495135
1051	NC_014002	AGAT	2	8	472855	472862	50 %	25 %	25 %	0 %	294495135
1052	NC_014002	ATCA	2	8	473664	473671	50 %	25 %	0 %	25 %	294495135
1053	NC_014002	AGAT	2	8	473797	473804	50 %	25 %	25 %	0 %	294495135
1054	NC_014002	AAGG	2	8	474078	474085	50 %	0 %	50 %	0 %	294495135
1055	NC_014002	TGAG	2	8	474199	474206	25 %	25 %	50 %	0 %	294495135
1056	NC_014002	GGCT	2	8	475116	475123	0 %	25 %	50 %	25 %	294495136
1057	NC_014002	GCCG	2	8	475500	475507	0 %	0 %	50 %	50 %	294495137
1058	NC_014002	CCCT	2	8	475905	475912	0 %	25 %	0 %	75 %	294495137
1059	NC_014002	TTTG	2	8	476516	476523	0 %	75 %	25 %	0 %	294495138
1060	NC_014002	TAAT	2	8	476583	476590	50 %	50 %	0 %	0 %	294495138
1061	NC_014002	ATGC	2	8	477282	477289	25 %	25 %	25 %	25 %	294495139
1062	NC_014002	TCTT	2	8	478890	478897	0 %	75 %	0 %	25 %	294495140
1063	NC_014002	CAAT	2	8	479261	479268	50 %	25 %	0 %	25 %	294495140
1064	NC_014002	ATTT	2	8	479297	479304	25 %	75 %	0 %	0 %	294495140
1065	NC_014002	ATGA	2	8	479488	479495	50 %	25 %	25 %	0 %	294495141
1066	NC_014002	CTTT	2	8	479548	479555	0 %	75 %	0 %	25 %	294495141
1067	NC_014002	AATA	2	8	479784	479791	75 %	25 %	0 %	0 %	294495141
1068	NC_014002	CAAT	2	8	479860	479867	50 %	25 %	0 %	25 %	294495141
1069	NC_014002	AAAT	2	8	479882	479889	75 %	25 %	0 %	0 %	294495141
1070	NC_014002	TAAC	2	8	481066	481073	50 %	25 %	0 %	25 %	294495143
1071	NC_014002	AATG	2	8	481681	481688	50 %	25 %	25 %	0 %	294495144
1072	NC_014002	AATG	2	8	483617	483624	50 %	25 %	25 %	0 %	294495144
1073	NC_014002	TCAA	2	8	484292	484299	50 %	25 %	0 %	25 %	294495145
1074	NC_014002	GTAA	2	8	484803	484810	50 %	25 %	25 %	0 %	294495145
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1076	NC_014002	AAAT	2	8	485442	485449	75 %	25 %	0 %	0 %	294495146
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1079	NC_014002	TATT	2	8	486824	486831	25 %	75 %	0 %	0 %	294495147
1080	NC_014002	ACAG	2	8	487682	487689	50 %	0 %	25 %	25 %	294495148
1081	NC_014002	CATT	2	8	487919	487926	25 %	50 %	0 %	25 %	294495148
1082	NC_014002	ATGA	2	8	488367	488374	50 %	25 %	25 %	0 %	294495149
1083	NC_014002	TGCA	2	8	488432	488439	25 %	25 %	25 %	25 %	294495149
1084	NC_014002	TCAG	2	8	488488	488495	25 %	25 %	25 %	25 %	294495149
1085	NC_014002	CTTC	2	8	488647	488654	0 %	50 %	0 %	50 %	294495149
1086	NC_014002	GATC	2	8	489852	489859	25 %	25 %	25 %	25 %	294495151
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1088	NC_014002	GATC	2	8	491050	491057	25 %	25 %	25 %	25 %	294495152
1089	NC_014002	CTGC	2	8	491114	491121	0 %	25 %	25 %	50 %	294495152
1090	NC_014002	CTGC	2	8	491283	491290	0 %	25 %	25 %	50 %	294495152
1091	NC_014002	TGAA	2	8	491363	491370	50 %	25 %	25 %	0 %	294495153
1092	NC_014002	TGAA	2	8	491598	491605	50 %	25 %	25 %	0 %	294495153
1093	NC_014002	ATGA	2	8	491633	491640	50 %	25 %	25 %	0 %	294495153
1094	NC_014002	CTCC	2	8	492285	492292	0 %	25 %	0 %	75 %	294495154
1095	NC_014002	ATGT	2	8	492832	492839	25 %	50 %	25 %	0 %	294495154
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1099	NC_014002	TTGC	2	8	495881	495888	0 %	50 %	25 %	25 %	294495157
1100	NC_014002	TCAG	2	8	496411	496418	25 %	25 %	25 %	25 %	294495158
1101	NC_014002	CTTT	2	8	496975	496982	0 %	75 %	0 %	25 %	294495159
1102	NC_014002	CCTT	2	8	497239	497246	0 %	50 %	0 %	50 %	294495159
1103	NC_014002	GTTT	2	8	497258	497265	0 %	75 %	25 %	0 %	294495159
1104	NC_014002	CCTG	2	8	497373	497380	0 %	25 %	25 %	50 %	294495159
1105	NC_014002	TGTA	2	8	497524	497531	25 %	50 %	25 %	0 %	294495159
1106	NC_014002	TGCC	2	8	497762	497769	0 %	25 %	25 %	50 %	294495159
1107	NC_014002	AGGG	2	8	498412	498419	25 %	0 %	75 %	0 %	294495159
1108	NC_014002	CAGG	2	8	498641	498648	25 %	0 %	50 %	25 %	294495159
1109	NC_014002	TCCA	2	8	501147	501154	25 %	25 %	0 %	50 %	294495160
1110	NC_014002	ATGG	2	8	502648	502655	25 %	25 %	50 %	0 %	294495162
1111	NC_014002	AATT	2	8	503061	503068	50 %	50 %	0 %	0 %	294495163
1112	NC_014002	CTGA	2	8	503098	503105	25 %	25 %	25 %	25 %	294495163
1113	NC_014002	GAAA	2	8	503271	503278	75 %	0 %	25 %	0 %	294495163
1114	NC_014002	ATGT	2	8	503968	503975	25 %	50 %	25 %	0 %	294495163
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1116	NC_014002	CGAT	2	8	505373	505380	25 %	25 %	25 %	25 %	294495165
1117	NC_014002	CGGT	2	8	506332	506339	0 %	25 %	50 %	25 %	294495165
1118	NC_014002	CAGA	2	8	506434	506441	50 %	0 %	25 %	25 %	294495165
1119	NC_014002	TGCC	2	8	506468	506475	0 %	25 %	25 %	50 %	294495165
1120	NC_014002	TCAG	2	8	506588	506595	25 %	25 %	25 %	25 %	294495165
1121	NC_014002	GATT	2	8	507896	507903	25 %	50 %	25 %	0 %	294495166
1122	NC_014002	TTCC	2	8	508017	508024	0 %	50 %	0 %	50 %	294495166
1123	NC_014002	CTAC	2	8	508105	508112	25 %	25 %	0 %	50 %	294495166
1124	NC_014002	ATAG	2	8	508407	508414	50 %	25 %	25 %	0 %	294495166
1125	NC_014002	AAAT	2	8	508468	508475	75 %	25 %	0 %	0 %	294495166
1126	NC_014002	GCTG	2	8	509296	509303	0 %	25 %	50 %	25 %	294495167
1127	NC_014002	AGGA	2	8	509310	509317	50 %	0 %	50 %	0 %	294495167
1128	NC_014002	AAAG	2	8	510057	510064	75 %	0 %	25 %	0 %	294495168
1129	NC_014002	ATGG	2	8	510172	510179	25 %	25 %	50 %	0 %	294495168
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