MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 incision element

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014000	GAATT	2	10	6	15	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014000	TTGTT	2	10	2193	2202	0 %	80 %	20 %	0 %	292905256
3	NC_014000	TTATT	2	10	2368	2377	20 %	80 %	0 %	0 %	292905256
4	NC_014000	TAAAG	2	10	6519	6528	60 %	20 %	20 %	0 %	292905261
5	NC_014000	CTTGG	2	10	7065	7074	0 %	40 %	40 %	20 %	292905262
6	NC_014000	GGGGA	2	10	7971	7980	20 %	0 %	80 %	0 %	292905264
7	NC_014000	GTTAG	2	10	10335	10344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014000	GTTCG	2	10	12338	12347	0 %	40 %	40 %	20 %	292905267
9	NC_014000	TCGCC	2	10	13888	13897	0 %	20 %	20 %	60 %	292905270
10	NC_014000	CTTTG	2	10	13919	13928	0 %	60 %	20 %	20 %	292905270
11	NC_014000	TGGGC	2	10	14518	14527	0 %	20 %	60 %	20 %	292905271
12	NC_014000	AGATG	2	10	14593	14602	40 %	20 %	40 %	0 %	292905271
13	NC_014000	CAAGG	2	10	15378	15387	40 %	0 %	40 %	20 %	292905272
14	NC_014000	TAAAT	2	10	18384	18393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014000	CTTGA	2	10	18939	18948	20 %	40 %	20 %	20 %	292905278
16	NC_014000	ACCAA	2	10	20927	20936	60 %	0 %	0 %	40 %	292905282
17	NC_014000	ACCTG	2	10	22112	22121	20 %	20 %	20 %	40 %	292905284
18	NC_014000	CAAAC	2	10	23439	23448	60 %	0 %	0 %	40 %	292905285
19	NC_014000	AAAGG	2	10	25075	25084	60 %	0 %	40 %	0 %	292905286
20	NC_014000	AGCCA	2	10	27365	27374	40 %	0 %	20 %	40 %	292905290
21	NC_014000	GAGGT	2	10	27684	27693	20 %	20 %	60 %	0 %	292905290
22	NC_014000	ACATC	2	10	29334	29343	40 %	20 %	0 %	40 %	292905293
23	NC_014000	GGCAA	2	10	30312	30321	40 %	0 %	40 %	20 %	292905295
24	NC_014000	CGTTG	2	10	32017	32026	0 %	40 %	40 %	20 %	292905296
25	NC_014000	GATCC	2	10	32134	32143	20 %	20 %	20 %	40 %	292905296
26	NC_014000	GCAAC	2	10	32167	32176	40 %	0 %	20 %	40 %	292905296
27	NC_014000	TATTT	2	10	32755	32764	20 %	80 %	0 %	0 %	292905296
28	NC_014000	TGCTT	2	10	34066	34075	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.