MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 incision element

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014000	TGGA	2	8	1009	1016	25 %	25 %	50 %	0 %	292905254
2	NC_014000	TCCA	2	8	1714	1721	25 %	25 %	0 %	50 %	292905256
3	NC_014000	AAGA	2	8	2353	2360	75 %	0 %	25 %	0 %	292905256
4	NC_014000	TGTT	2	8	2800	2807	0 %	75 %	25 %	0 %	292905256
5	NC_014000	TGTT	2	8	2846	2853	0 %	75 %	25 %	0 %	292905256
6	NC_014000	GTAG	2	8	3719	3726	25 %	25 %	50 %	0 %	292905257
7	NC_014000	GTGA	2	8	3845	3852	25 %	25 %	50 %	0 %	292905257
8	NC_014000	TTGA	2	8	4727	4734	25 %	50 %	25 %	0 %	292905259
9	NC_014000	CTTC	2	8	4759	4766	0 %	50 %	0 %	50 %	292905259
10	NC_014000	ATTA	2	8	4829	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	292905259
11	NC_014000	GTGA	2	8	5569	5576	25 %	25 %	50 %	0 %	292905261
12	NC_014000	TTGG	2	8	5898	5905	0 %	50 %	50 %	0 %	292905261
13	NC_014000	AGAA	2	8	5990	5997	75 %	0 %	25 %	0 %	292905261
14	NC_014000	GTAA	2	8	6204	6211	50 %	25 %	25 %	0 %	292905261
15	NC_014000	TATC	2	8	6550	6557	25 %	50 %	0 %	25 %	292905261
16	NC_014000	GCGG	2	8	7017	7024	0 %	0 %	75 %	25 %	292905262
17	NC_014000	GTTC	2	8	7040	7047	0 %	50 %	25 %	25 %	292905262
18	NC_014000	AGGA	2	8	7181	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	292905262
19	NC_014000	CTGG	2	8	7280	7287	0 %	25 %	50 %	25 %	292905263
20	NC_014000	CCAG	2	8	7768	7775	25 %	0 %	25 %	50 %	292905263
21	NC_014000	CTGT	2	8	7829	7836	0 %	50 %	25 %	25 %	292905264
22	NC_014000	AAAG	2	8	8450	8457	75 %	0 %	25 %	0 %	292905264
23	NC_014000	ACTG	2	8	9092	9099	25 %	25 %	25 %	25 %	292905264
24	NC_014000	ATCC	2	8	9729	9736	25 %	25 %	0 %	50 %	292905264
25	NC_014000	TTTC	2	8	9765	9772	0 %	75 %	0 %	25 %	292905264
26	NC_014000	ATTA	2	8	9922	9929	50 %	50 %	0 %	0 %	292905264
27	NC_014000	AAAC	2	8	11169	11176	75 %	0 %	0 %	25 %	292905266
28	NC_014000	ACTT	2	8	11395	11402	25 %	50 %	0 %	25 %	292905266
29	NC_014000	ATAA	2	8	11866	11873	75 %	25 %	0 %	0 %	292905266
30	NC_014000	CCAC	2	8	11907	11914	25 %	0 %	0 %	75 %	292905266
31	NC_014000	AAGC	2	8	12255	12262	50 %	0 %	25 %	25 %	292905267
32	NC_014000	CCCT	2	8	12709	12716	0 %	25 %	0 %	75 %	292905268
33	NC_014000	GAGC	2	8	12991	12998	25 %	0 %	50 %	25 %	292905268
34	NC_014000	TTTC	2	8	13276	13283	0 %	75 %	0 %	25 %	292905269
35	NC_014000	GTTT	2	8	14473	14480	0 %	75 %	25 %	0 %	292905271
36	NC_014000	CGGG	2	8	14987	14994	0 %	0 %	75 %	25 %	292905272
37	NC_014000	AACC	2	8	15091	15098	50 %	0 %	0 %	50 %	292905272
38	NC_014000	ATGA	2	8	15872	15879	50 %	25 %	25 %	0 %	292905273
39	NC_014000	ATAA	2	8	16154	16161	75 %	25 %	0 %	0 %	292905273
40	NC_014000	TTGC	2	8	16676	16683	0 %	50 %	25 %	25 %	292905274
41	NC_014000	AGTA	2	8	16941	16948	50 %	25 %	25 %	0 %	292905274
42	NC_014000	CCTG	2	8	17223	17230	0 %	25 %	25 %	50 %	292905275
43	NC_014000	TCGG	2	8	17813	17820	0 %	25 %	50 %	25 %	292905276
44	NC_014000	ACCC	2	8	17839	17846	25 %	0 %	0 %	75 %	292905276
45	NC_014000	TGGA	2	8	18016	18023	25 %	25 %	50 %	0 %	292905276
46	NC_014000	GCTG	2	8	18674	18681	0 %	25 %	50 %	25 %	292905278
47	NC_014000	TTAA	2	8	20392	20399	50 %	50 %	0 %	0 %	292905280
48	NC_014000	TGGC	2	8	20943	20950	0 %	25 %	50 %	25 %	292905282
49	NC_014000	CCAC	2	8	22146	22153	25 %	0 %	0 %	75 %	292905284
50	NC_014000	AGAA	2	8	22537	22544	75 %	0 %	25 %	0 %	292905285
51	NC_014000	CAAG	2	8	22887	22894	50 %	0 %	25 %	25 %	292905285
52	NC_014000	GTAA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	25 %	0 %	292905285
53	NC_014000	TGAT	2	8	23612	23619	25 %	50 %	25 %	0 %	292905285
54	NC_014000	GTCG	2	8	23686	23693	0 %	25 %	50 %	25 %	292905285
55	NC_014000	TCTG	2	8	25664	25671	0 %	50 %	25 %	25 %	292905287
56	NC_014000	GATT	2	8	26434	26441	25 %	50 %	25 %	0 %	292905288
57	NC_014000	ACTG	2	8	26944	26951	25 %	25 %	25 %	25 %	292905289
58	NC_014000	CAAT	2	8	28496	28503	50 %	25 %	0 %	25 %	292905291
59	NC_014000	CTAT	2	8	29058	29065	25 %	50 %	0 %	25 %	292905292
60	NC_014000	GAGT	2	8	29473	29480	25 %	25 %	50 %	0 %	292905293
61	NC_014000	AGAC	2	8	30386	30393	50 %	0 %	25 %	25 %	292905295
62	NC_014000	TGAG	2	8	30610	30617	25 %	25 %	50 %	0 %	292905295
63	NC_014000	ACTG	2	8	30705	30712	25 %	25 %	25 %	25 %	292905295
64	NC_014000	GTCA	2	8	31138	31145	25 %	25 %	25 %	25 %	292905295
65	NC_014000	AGTC	2	8	31811	31818	25 %	25 %	25 %	25 %	292905296
66	NC_014000	CCTT	2	8	32637	32644	0 %	50 %	0 %	50 %	292905296
67	NC_014000	GTCA	2	8	32769	32776	25 %	25 %	25 %	25 %	292905296
68	NC_014000	GAAG	2	8	33185	33192	50 %	0 %	50 %	0 %	292905296
69	NC_014000	GATT	2	8	33755	33762	25 %	50 %	25 %	0 %	292905297
70	NC_014000	GGAA	2	8	33772	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	292905297
71	NC_014000	GCTG	2	8	34237	34244	0 %	25 %	50 %	25 %	292905298
72	NC_014000	TAAT	2	8	34536	34543	50 %	50 %	0 %	0 %	292905298
73	NC_014000	TGAT	2	8	34581	34588	25 %	50 %	25 %	0 %	292905299
74	NC_014000	GATT	2	8	34626	34633	25 %	50 %	25 %	0 %	292905299
75	NC_014000	AACG	2	8	35236	35243	50 %	0 %	25 %	25 %	292905299

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.