MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	ACCGCG	2	12	1061	1072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	293386421
2	NC_013973	GGCGCT	2	12	3891	3902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293386428
3	NC_013973	ATCTGC	2	12	14307	14318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	293386445
4	NC_013973	TTGCCG	2	12	17750	17761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386452
5	NC_013973	GAAAGC	2	12	18589	18600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	293386452
6	NC_013973	AACGTC	2	12	20172	20183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	293386454
7	NC_013973	CTGAAG	2	12	24284	24295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	293386460
8	NC_013973	TCAGTG	2	12	26383	26394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293386461
9	NC_013973	CAGCCT	2	12	28555	28566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	293386465
10	NC_013973	GCTGAT	3	18	33691	33708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293386470
11	NC_013973	CCGGCG	2	12	35103	35114	0 %	0 %	50 %	50 %	293386471
12	NC_013973	CATCGA	2	12	43190	43201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	293386481
13	NC_013973	AGGCGC	2	12	46192	46203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	293386485
14	NC_013973	TTCCGG	2	12	46864	46875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386485
15	NC_013973	TCCTGC	2	12	48707	48718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	293386485
16	NC_013973	GGCGGG	2	12	59822	59833	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	293386495
17	NC_013973	CGGTAA	2	12	63553	63564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	293386500
18	NC_013973	CGGCGC	2	12	67093	67104	0 %	0 %	50 %	50 %	293386502
19	NC_013973	GCGCCG	2	12	67417	67428	0 %	0 %	50 %	50 %	293386503
20	NC_013973	AGTGTC	2	12	67480	67491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293386503

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.