MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	GCGCG	2	10	3863	3872	0 %	0 %	60 %	40 %	293386428
2	NC_013973	CCCGC	2	10	4227	4236	0 %	0 %	20 %	80 %	293386428
3	NC_013973	GTAAT	2	10	5954	5963	40 %	40 %	20 %	0 %	293386431
4	NC_013973	GTACG	2	10	11808	11817	20 %	20 %	40 %	20 %	293386440
5	NC_013973	TGGAG	2	10	12041	12050	20 %	20 %	60 %	0 %	293386440
6	NC_013973	CTGTG	2	10	12229	12238	0 %	40 %	40 %	20 %	293386441
7	NC_013973	AAATG	2	10	17273	17282	60 %	20 %	20 %	0 %	293386451
8	NC_013973	GCGTG	2	10	18570	18579	0 %	20 %	60 %	20 %	293386452
9	NC_013973	GAACG	2	10	18618	18627	40 %	0 %	40 %	20 %	293386452
10	NC_013973	AGGGA	2	10	20887	20896	40 %	0 %	60 %	0 %	293386455
11	NC_013973	GGTAA	2	10	21129	21138	40 %	20 %	40 %	0 %	293386456
12	NC_013973	GCTAT	2	10	21149	21158	20 %	40 %	20 %	20 %	293386456
13	NC_013973	CGCGG	2	10	25263	25272	0 %	0 %	60 %	40 %	293386461
14	NC_013973	CGCCA	2	10	27598	27607	20 %	0 %	20 %	60 %	293386463
15	NC_013973	GCGCA	2	10	28428	28437	20 %	0 %	40 %	40 %	293386465
16	NC_013973	TCATC	2	10	28780	28789	20 %	40 %	0 %	40 %	293386466
17	NC_013973	CGTTC	2	10	32132	32141	0 %	40 %	20 %	40 %	293386468
18	NC_013973	GCTGA	2	10	33043	33052	20 %	20 %	40 %	20 %	293386469
19	NC_013973	CGACC	2	10	35197	35206	20 %	0 %	20 %	60 %	293386471
20	NC_013973	CGGCG	2	10	36276	36285	0 %	0 %	60 %	40 %	293386472
21	NC_013973	CGGCG	2	10	38695	38704	0 %	0 %	60 %	40 %	293386475
22	NC_013973	TTATT	2	10	40415	40424	20 %	80 %	0 %	0 %	293386476
23	NC_013973	ATTTC	2	10	43411	43420	20 %	60 %	0 %	20 %	293386482
24	NC_013973	GGGCT	2	10	43909	43918	0 %	20 %	60 %	20 %	293386482
25	NC_013973	CGCTG	2	10	44231	44240	0 %	20 %	40 %	40 %	293386483
26	NC_013973	GCCTT	2	10	44645	44654	0 %	40 %	20 %	40 %	293386483
27	NC_013973	GTTTC	2	10	45443	45452	0 %	60 %	20 %	20 %	293386484
28	NC_013973	TGATG	2	10	47657	47666	20 %	40 %	40 %	0 %	293386485
29	NC_013973	ATACC	2	10	47758	47767	40 %	20 %	0 %	40 %	293386485
30	NC_013973	TTCAG	2	10	48842	48851	20 %	40 %	20 %	20 %	293386485
31	NC_013973	GGGCA	2	10	50049	50058	20 %	0 %	60 %	20 %	293386485
32	NC_013973	TCCTG	2	10	50977	50986	0 %	40 %	20 %	40 %	293386487
33	NC_013973	CACAG	2	10	51904	51913	40 %	0 %	20 %	40 %	293386488
34	NC_013973	TTCCG	2	10	52144	52153	0 %	40 %	20 %	40 %	293386488
35	NC_013973	AGCGC	2	10	55886	55895	20 %	0 %	40 %	40 %	293386493
36	NC_013973	ACCTT	2	10	56260	56269	20 %	40 %	0 %	40 %	293386493
37	NC_013973	GGCGT	2	10	56849	56858	0 %	20 %	60 %	20 %	293386494
38	NC_013973	GGCGG	2	10	57063	57072	0 %	0 %	80 %	20 %	293386494
39	NC_013973	TGCTG	2	10	57411	57420	0 %	40 %	40 %	20 %	293386494
40	NC_013973	TCGCT	2	10	59049	59058	0 %	40 %	20 %	40 %	293386494
41	NC_013973	ACACC	2	10	59189	59198	40 %	0 %	0 %	60 %	293386494
42	NC_013973	CTTCA	2	10	61079	61088	20 %	40 %	0 %	40 %	293386496
43	NC_013973	CATTG	2	10	62131	62140	20 %	40 %	20 %	20 %	293386498
44	NC_013973	CGAGG	2	10	62253	62262	20 %	0 %	60 %	20 %	293386498
45	NC_013973	TTGCG	2	10	62786	62795	0 %	40 %	40 %	20 %	293386499
46	NC_013973	ATCCG	2	10	64144	64153	20 %	20 %	20 %	40 %	293386500
47	NC_013973	ATTTT	2	10	64444	64453	20 %	80 %	0 %	0 %	293386500
48	NC_013973	GACAC	2	10	68564	68573	40 %	0 %	20 %	40 %	293386504
49	NC_013973	GAAAA	2	10	69795	69804	80 %	0 %	20 %	0 %	293386504

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.