MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	CTGA	2	8	1111	1118	25 %	25 %	25 %	25 %	293386421
2	NC_013973	TGCG	2	8	1337	1344	0 %	25 %	50 %	25 %	293386421
3	NC_013973	AAAG	2	8	1902	1909	75 %	0 %	25 %	0 %	293386422
4	NC_013973	ATGA	2	8	2836	2843	50 %	25 %	25 %	0 %	293386424
5	NC_013973	GCAC	2	8	3643	3650	25 %	0 %	25 %	50 %	293386427
6	NC_013973	CGGT	2	8	3720	3727	0 %	25 %	50 %	25 %	293386427
7	NC_013973	CCGC	2	8	4689	4696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_013973	GCCT	2	8	4698	4705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013973	CTAC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013973	CTCC	2	8	4934	4941	0 %	25 %	0 %	75 %	293386429
11	NC_013973	GATG	2	8	5277	5284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013973	TAAG	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013973	CTGA	2	8	6130	6137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013973	TTCA	2	8	6672	6679	25 %	50 %	0 %	25 %	293386433
15	NC_013973	GACG	2	8	7525	7532	25 %	0 %	50 %	25 %	293386434
16	NC_013973	TCCT	2	8	7785	7792	0 %	50 %	0 %	50 %	293386434
17	NC_013973	CAGC	2	8	7940	7947	25 %	0 %	25 %	50 %	293386434
18	NC_013973	CTGG	2	8	8090	8097	0 %	25 %	50 %	25 %	293386434
19	NC_013973	CCGG	2	8	8573	8580	0 %	0 %	50 %	50 %	293386434
20	NC_013973	TTAA	2	8	9189	9196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013973	TATT	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013973	CAGC	2	8	9746	9753	25 %	0 %	25 %	50 %	293386436
23	NC_013973	GGCT	2	8	10317	10324	0 %	25 %	50 %	25 %	293386437
24	NC_013973	TAAA	2	8	10648	10655	75 %	25 %	0 %	0 %	293386437
25	NC_013973	AGCG	2	8	10681	10688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013973	CCGC	2	8	10956	10963	0 %	0 %	25 %	75 %	293386439
27	NC_013973	TATT	2	8	11231	11238	25 %	75 %	0 %	0 %	293386440
28	NC_013973	CCTG	2	8	11904	11911	0 %	25 %	25 %	50 %	293386440
29	NC_013973	CGGC	2	8	12062	12069	0 %	0 %	50 %	50 %	293386440
30	NC_013973	CTGG	2	8	12246	12253	0 %	25 %	50 %	25 %	293386441
31	NC_013973	CTGT	2	8	12977	12984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013973	TCAG	2	8	13601	13608	25 %	25 %	25 %	25 %	293386443
33	NC_013973	CCGT	2	8	14164	14171	0 %	25 %	25 %	50 %	293386444
34	NC_013973	CTGA	2	8	14540	14547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013973	CTGT	2	8	14930	14937	0 %	50 %	25 %	25 %	293386446
36	NC_013973	TTCC	2	8	15358	15365	0 %	50 %	0 %	50 %	293386447
37	NC_013973	CCTG	2	8	15474	15481	0 %	25 %	25 %	50 %	293386447
38	NC_013973	CCCG	2	8	16421	16428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013973	CAGG	2	8	16647	16654	25 %	0 %	50 %	25 %	293386450
40	NC_013973	AGAC	3	12	16871	16882	50 %	0 %	25 %	25 %	293386451
41	NC_013973	CAGG	2	8	17019	17026	25 %	0 %	50 %	25 %	293386451
42	NC_013973	GAAA	2	8	17200	17207	75 %	0 %	25 %	0 %	293386451
43	NC_013973	CTGC	2	8	17626	17633	0 %	25 %	25 %	50 %	293386452
44	NC_013973	AGGA	2	8	17837	17844	50 %	0 %	50 %	0 %	293386452
45	NC_013973	GCTG	2	8	19289	19296	0 %	25 %	50 %	25 %	293386452
46	NC_013973	CTGC	2	8	19446	19453	0 %	25 %	25 %	50 %	293386453
47	NC_013973	TGCC	2	8	19829	19836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013973	GCCA	2	8	20433	20440	25 %	0 %	25 %	50 %	293386454
49	NC_013973	CTGG	2	8	21101	21108	0 %	25 %	50 %	25 %	293386456
50	NC_013973	CTCC	2	8	21338	21345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_013973	TGCC	2	8	21575	21582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013973	CAGG	2	8	21975	21982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013973	AGCC	2	8	22476	22483	25 %	0 %	25 %	50 %	293386457
54	NC_013973	GCTG	2	8	22574	22581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013973	GGAC	2	8	23276	23283	25 %	0 %	50 %	25 %	293386458
56	NC_013973	AACT	2	8	24845	24852	50 %	25 %	0 %	25 %	293386461
57	NC_013973	AAAG	2	8	25296	25303	75 %	0 %	25 %	0 %	293386461
58	NC_013973	AGCA	2	8	25506	25513	50 %	0 %	25 %	25 %	293386461
59	NC_013973	CTGG	2	8	25714	25721	0 %	25 %	50 %	25 %	293386461
60	NC_013973	GTTA	2	8	26154	26161	25 %	50 %	25 %	0 %	293386461
61	NC_013973	TTCC	2	8	26692	26699	0 %	50 %	0 %	50 %	293386462
62	NC_013973	AACT	2	8	27213	27220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013973	CAGA	2	8	27497	27504	50 %	0 %	25 %	25 %	293386463
64	NC_013973	ATAC	2	8	27582	27589	50 %	25 %	0 %	25 %	293386463
65	NC_013973	ATCT	2	8	28210	28217	25 %	50 %	0 %	25 %	293386465
66	NC_013973	TAGT	2	8	29053	29060	25 %	50 %	25 %	0 %	293386466
67	NC_013973	CGAT	2	8	30436	30443	25 %	25 %	25 %	25 %	293386467
68	NC_013973	TTGT	2	8	30525	30532	0 %	75 %	25 %	0 %	293386467
69	NC_013973	GCTG	2	8	31666	31673	0 %	25 %	50 %	25 %	293386468
70	NC_013973	ATCA	2	8	32389	32396	50 %	25 %	0 %	25 %	293386469
71	NC_013973	TGCC	2	8	33386	33393	0 %	25 %	25 %	50 %	293386469
72	NC_013973	CGGT	2	8	33747	33754	0 %	25 %	50 %	25 %	293386470
73	NC_013973	ACGC	2	8	34635	34642	25 %	0 %	25 %	50 %	293386471
74	NC_013973	CGGG	2	8	34701	34708	0 %	0 %	75 %	25 %	293386471
75	NC_013973	CGAG	2	8	36912	36919	25 %	0 %	50 %	25 %	293386473
76	NC_013973	GACT	2	8	37326	37333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013973	GGCA	2	8	37714	37721	25 %	0 %	50 %	25 %	293386474
78	NC_013973	CCAT	2	8	37995	38002	25 %	25 %	0 %	50 %	293386474
79	NC_013973	GGAT	2	8	39404	39411	25 %	25 %	50 %	0 %	293386475
80	NC_013973	CATC	2	8	39515	39522	25 %	25 %	0 %	50 %	293386475
81	NC_013973	AATA	2	8	40730	40737	75 %	25 %	0 %	0 %	293386476
82	NC_013973	GGCA	2	8	41187	41194	25 %	0 %	50 %	25 %	293386477
83	NC_013973	CTGG	2	8	41566	41573	0 %	25 %	50 %	25 %	293386478
84	NC_013973	CTGG	2	8	42810	42817	0 %	25 %	50 %	25 %	293386480
85	NC_013973	TGGA	2	8	43020	43027	25 %	25 %	50 %	0 %	293386481
86	NC_013973	GCGT	2	8	43171	43178	0 %	25 %	50 %	25 %	293386481
87	NC_013973	AGCG	2	8	43581	43588	25 %	0 %	50 %	25 %	293386482
88	NC_013973	CCGC	2	8	43648	43655	0 %	0 %	25 %	75 %	293386482
89	NC_013973	CGGG	2	8	43848	43855	0 %	0 %	75 %	25 %	293386482
90	NC_013973	GGCA	2	8	43890	43897	25 %	0 %	50 %	25 %	293386482
91	NC_013973	CGGG	2	8	44117	44124	0 %	0 %	75 %	25 %	293386482
92	NC_013973	TGAC	2	8	44130	44137	25 %	25 %	25 %	25 %	293386482
93	NC_013973	TGGT	2	8	44306	44313	0 %	50 %	50 %	0 %	293386483
94	NC_013973	CGGC	2	8	44319	44326	0 %	0 %	50 %	50 %	293386483
95	NC_013973	GATG	2	8	44376	44383	25 %	25 %	50 %	0 %	293386483
96	NC_013973	GCTT	2	8	44691	44698	0 %	50 %	25 %	25 %	293386483
97	NC_013973	GGTG	2	8	44814	44821	0 %	25 %	75 %	0 %	293386483
98	NC_013973	CCGT	2	8	45116	45123	0 %	25 %	25 %	50 %	293386483
99	NC_013973	GAAA	2	8	45347	45354	75 %	0 %	25 %	0 %	293386484
100	NC_013973	GGCA	2	8	45380	45387	25 %	0 %	50 %	25 %	293386484
101	NC_013973	GCCC	2	8	45786	45793	0 %	0 %	25 %	75 %	293386485
102	NC_013973	ATGG	2	8	45924	45931	25 %	25 %	50 %	0 %	293386485
103	NC_013973	GGTT	2	8	46020	46027	0 %	50 %	50 %	0 %	293386485
104	NC_013973	CGCC	2	8	46103	46110	0 %	0 %	25 %	75 %	293386485
105	NC_013973	ATCA	2	8	46482	46489	50 %	25 %	0 %	25 %	293386485
106	NC_013973	GGCT	2	8	47485	47492	0 %	25 %	50 %	25 %	293386485
107	NC_013973	GAAA	2	8	47603	47610	75 %	0 %	25 %	0 %	293386485
108	NC_013973	GAAT	2	8	48050	48057	50 %	25 %	25 %	0 %	293386485
109	NC_013973	TGAA	2	8	48184	48191	50 %	25 %	25 %	0 %	293386485
110	NC_013973	CTCG	2	8	48299	48306	0 %	25 %	25 %	50 %	293386485
111	NC_013973	CAGA	2	8	48423	48430	50 %	0 %	25 %	25 %	293386485
112	NC_013973	ATCG	2	8	49140	49147	25 %	25 %	25 %	25 %	293386485
113	NC_013973	CAGC	2	8	49423	49430	25 %	0 %	25 %	50 %	293386485
114	NC_013973	ATGG	2	8	49769	49776	25 %	25 %	50 %	0 %	293386485
115	NC_013973	CAGC	2	8	49979	49986	25 %	0 %	25 %	50 %	293386485
116	NC_013973	GGCC	2	8	50542	50549	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
117	NC_013973	CCGG	2	8	51719	51726	0 %	0 %	50 %	50 %	293386488
118	NC_013973	CCTC	2	8	51940	51947	0 %	25 %	0 %	75 %	293386488
119	NC_013973	CCGC	2	8	52678	52685	0 %	0 %	25 %	75 %	293386489
120	NC_013973	CGCA	2	8	52933	52940	25 %	0 %	25 %	50 %	293386489
121	NC_013973	GGCT	2	8	53769	53776	0 %	25 %	50 %	25 %	293386489
122	NC_013973	GATT	2	8	54364	54371	25 %	50 %	25 %	0 %	293386490
123	NC_013973	AATG	2	8	54415	54422	50 %	25 %	25 %	0 %	293386490
124	NC_013973	GGCA	2	8	54457	54464	25 %	0 %	50 %	25 %	293386490
125	NC_013973	GTTC	2	8	55027	55034	0 %	50 %	25 %	25 %	293386491
126	NC_013973	CGTC	2	8	55216	55223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013973	TGCG	2	8	55343	55350	0 %	25 %	50 %	25 %	293386492
128	NC_013973	CATT	2	8	55367	55374	25 %	50 %	0 %	25 %	293386492
129	NC_013973	GCCC	2	8	56918	56925	0 %	0 %	25 %	75 %	293386494
130	NC_013973	CTTT	2	8	56988	56995	0 %	75 %	0 %	25 %	293386494
131	NC_013973	GCGT	2	8	57155	57162	0 %	25 %	50 %	25 %	293386494
132	NC_013973	CCTG	2	8	57683	57690	0 %	25 %	25 %	50 %	293386494
133	NC_013973	CGGA	2	8	57785	57792	25 %	0 %	50 %	25 %	293386494
134	NC_013973	TTTA	2	8	58852	58859	25 %	75 %	0 %	0 %	293386494
135	NC_013973	GAAG	2	8	59229	59236	50 %	0 %	50 %	0 %	293386494
136	NC_013973	GCTG	2	8	59452	59459	0 %	25 %	50 %	25 %	293386495
137	NC_013973	CGGG	2	8	59991	59998	0 %	0 %	75 %	25 %	293386495
138	NC_013973	CAGA	2	8	60074	60081	50 %	0 %	25 %	25 %	293386495
139	NC_013973	CTCA	2	8	60185	60192	25 %	25 %	0 %	50 %	293386495
140	NC_013973	GAGC	2	8	60361	60368	25 %	0 %	50 %	25 %	293386495
141	NC_013973	CTGG	2	8	60490	60497	0 %	25 %	50 %	25 %	293386495
142	NC_013973	GGCA	2	8	60794	60801	25 %	0 %	50 %	25 %	293386496
143	NC_013973	ACTC	2	8	60872	60879	25 %	25 %	0 %	50 %	293386496
144	NC_013973	GAAT	2	8	60918	60925	50 %	25 %	25 %	0 %	293386496
145	NC_013973	CTGC	2	8	60954	60961	0 %	25 %	25 %	50 %	293386496
146	NC_013973	GCTG	2	8	61005	61012	0 %	25 %	50 %	25 %	293386496
147	NC_013973	GCCG	2	8	61493	61500	0 %	0 %	50 %	50 %	293386497
148	NC_013973	GCTG	2	8	61678	61685	0 %	25 %	50 %	25 %	293386497
149	NC_013973	GGCT	2	8	61773	61780	0 %	25 %	50 %	25 %	293386497
150	NC_013973	TGGC	2	8	62361	62368	0 %	25 %	50 %	25 %	293386498
151	NC_013973	GCCG	2	8	63227	63234	0 %	0 %	50 %	50 %	293386500
152	NC_013973	CTTT	2	8	64203	64210	0 %	75 %	0 %	25 %	293386500
153	NC_013973	CGGT	2	8	64473	64480	0 %	25 %	50 %	25 %	293386500
154	NC_013973	TCTT	2	8	64494	64501	0 %	75 %	0 %	25 %	293386500
155	NC_013973	TGAT	2	8	64653	64660	25 %	50 %	25 %	0 %	293386500
156	NC_013973	TGGC	2	8	64719	64726	0 %	25 %	50 %	25 %	293386500
157	NC_013973	TTGG	2	8	64802	64809	0 %	50 %	50 %	0 %	293386500
158	NC_013973	GGCA	2	8	64918	64925	25 %	0 %	50 %	25 %	293386500
159	NC_013973	GCTG	2	8	66207	66214	0 %	25 %	50 %	25 %	293386502
160	NC_013973	CATT	2	8	66262	66269	25 %	50 %	0 %	25 %	293386502
161	NC_013973	AACG	2	8	67390	67397	50 %	0 %	25 %	25 %	293386503
162	NC_013973	CCGC	2	8	67553	67560	0 %	0 %	25 %	75 %	293386503
163	NC_013973	GTCG	2	8	68205	68212	0 %	25 %	50 %	25 %	293386504
164	NC_013973	CGCT	2	8	68248	68255	0 %	25 %	25 %	50 %	293386504
165	NC_013973	GCCG	2	8	68529	68536	0 %	0 %	50 %	50 %	293386504
166	NC_013973	GATG	2	8	68552	68559	25 %	25 %	50 %	0 %	293386504
167	NC_013973	CCCG	2	8	68809	68816	0 %	0 %	25 %	75 %	293386504
168	NC_013973	TCAG	2	8	69394	69401	25 %	25 %	25 %	25 %	293386504
169	NC_013973	AGGT	2	8	69493	69500	25 %	25 %	50 %	0 %	293386504
170	NC_013973	CGCT	2	8	69543	69550	0 %	25 %	25 %	50 %	293386504
171	NC_013973	TGCT	2	8	69558	69565	0 %	50 %	25 %	25 %	293386504
172	NC_013973	GCTG	2	8	70106	70113	0 %	25 %	50 %	25 %	293386504
173	NC_013973	GCCT	2	8	70210	70217	0 %	25 %	25 %	50 %	293386504
174	NC_013973	TCGT	2	8	70256	70263	0 %	50 %	25 %	25 %	293386504
175	NC_013973	TGCT	2	8	70581	70588	0 %	50 %	25 %	25 %	293386505
176	NC_013973	AGCC	2	8	70763	70770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_013973	GAAG	2	8	70901	70908	50 %	0 %	50 %	0 %	293386506
178	NC_013973	CATG	2	8	71143	71150	25 %	25 %	25 %	25 %	293386506
179	NC_013973	ACTG	2	8	71312	71319	25 %	25 %	25 %	25 %	293386506

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.