MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	CG	3	6	689	694	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
2	NC_013973	GC	3	6	955	960	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
3	NC_013973	CG	3	6	1133	1138	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
4	NC_013973	GC	3	6	1578	1583	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
5	NC_013973	CT	3	6	1945	1950	0 %	50 %	0 %	50 %	293386422
6	NC_013973	GT	3	6	2020	2025	0 %	50 %	50 %	0 %	293386422
7	NC_013973	TA	3	6	2402	2407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013973	AC	3	6	2664	2669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013973	GA	3	6	3255	3260	50 %	0 %	50 %	0 %	293386425
10	NC_013973	CG	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	293386428
11	NC_013973	GA	3	6	5141	5146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013973	AT	4	8	5257	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013973	CG	3	6	6032	6037	0 %	0 %	50 %	50 %	293386431
14	NC_013973	TG	3	6	6590	6595	0 %	50 %	50 %	0 %	293386433
15	NC_013973	AG	3	6	8943	8948	50 %	0 %	50 %	0 %	293386435
16	NC_013973	AT	3	6	9289	9294	50 %	50 %	0 %	0 %	293386436
17	NC_013973	CG	3	6	10356	10361	0 %	0 %	50 %	50 %	293386437
18	NC_013973	GC	3	6	10832	10837	0 %	0 %	50 %	50 %	293386439
19	NC_013973	GC	3	6	11631	11636	0 %	0 %	50 %	50 %	293386440
20	NC_013973	GT	3	6	11776	11781	0 %	50 %	50 %	0 %	293386440
21	NC_013973	GC	4	8	11991	11998	0 %	0 %	50 %	50 %	293386440
22	NC_013973	GA	3	6	12025	12030	50 %	0 %	50 %	0 %	293386440
23	NC_013973	TG	3	6	13002	13007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013973	CA	3	6	13535	13540	50 %	0 %	0 %	50 %	293386443
25	NC_013973	CA	4	8	15328	15335	50 %	0 %	0 %	50 %	293386447
26	NC_013973	CG	3	6	15766	15771	0 %	0 %	50 %	50 %	293386447
27	NC_013973	CG	3	6	15923	15928	0 %	0 %	50 %	50 %	293386448
28	NC_013973	CG	3	6	16517	16522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013973	CA	3	6	17219	17224	50 %	0 %	0 %	50 %	293386451
30	NC_013973	GA	3	6	17367	17372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013973	GC	4	8	19501	19508	0 %	0 %	50 %	50 %	293386453
32	NC_013973	AC	3	6	20164	20169	50 %	0 %	0 %	50 %	293386454
33	NC_013973	GA	3	6	20972	20977	50 %	0 %	50 %	0 %	293386456
34	NC_013973	CT	3	6	21405	21410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013973	TC	3	6	21415	21420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013973	CT	3	6	21858	21863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013973	CG	3	6	21946	21951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013973	GC	3	6	22728	22733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013973	GC	4	8	22959	22966	0 %	0 %	50 %	50 %	293386458
40	NC_013973	AG	3	6	23339	23344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013973	GC	3	6	23943	23948	0 %	0 %	50 %	50 %	293386459
42	NC_013973	CG	3	6	24646	24651	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
43	NC_013973	CT	3	6	24822	24827	0 %	50 %	0 %	50 %	293386461
44	NC_013973	TG	3	6	24838	24843	0 %	50 %	50 %	0 %	293386461
45	NC_013973	AC	3	6	25138	25143	50 %	0 %	0 %	50 %	293386461
46	NC_013973	CG	3	6	25402	25407	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
47	NC_013973	CG	4	8	25689	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
48	NC_013973	GC	3	6	25924	25929	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
49	NC_013973	CG	3	6	26028	26033	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
50	NC_013973	GC	3	6	26417	26422	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
51	NC_013973	CT	3	6	27781	27786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013973	AT	3	6	28322	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	293386465
53	NC_013973	TC	3	6	28666	28671	0 %	50 %	0 %	50 %	293386466
54	NC_013973	CG	3	6	30927	30932	0 %	0 %	50 %	50 %	293386468
55	NC_013973	CT	3	6	31022	31027	0 %	50 %	0 %	50 %	293386468
56	NC_013973	CG	3	6	32434	32439	0 %	0 %	50 %	50 %	293386469
57	NC_013973	CG	3	6	32912	32917	0 %	0 %	50 %	50 %	293386469
58	NC_013973	CG	3	6	33010	33015	0 %	0 %	50 %	50 %	293386469
59	NC_013973	GT	3	6	33199	33204	0 %	50 %	50 %	0 %	293386469
60	NC_013973	GA	3	6	34189	34194	50 %	0 %	50 %	0 %	293386471
61	NC_013973	TG	3	6	36192	36197	0 %	50 %	50 %	0 %	293386472
62	NC_013973	TG	3	6	36617	36622	0 %	50 %	50 %	0 %	293386472
63	NC_013973	GC	3	6	36961	36966	0 %	0 %	50 %	50 %	293386473
64	NC_013973	GC	3	6	37154	37159	0 %	0 %	50 %	50 %	293386473
65	NC_013973	CG	3	6	37475	37480	0 %	0 %	50 %	50 %	293386474
66	NC_013973	GC	3	6	38736	38741	0 %	0 %	50 %	50 %	293386475
67	NC_013973	GC	3	6	38829	38834	0 %	0 %	50 %	50 %	293386475
68	NC_013973	GC	3	6	38984	38989	0 %	0 %	50 %	50 %	293386475
69	NC_013973	GT	3	6	40327	40332	0 %	50 %	50 %	0 %	293386476
70	NC_013973	TC	3	6	40602	40607	0 %	50 %	0 %	50 %	293386476
71	NC_013973	CG	3	6	42140	42145	0 %	0 %	50 %	50 %	293386479
72	NC_013973	GC	3	6	42483	42488	0 %	0 %	50 %	50 %	293386480
73	NC_013973	GC	3	6	43259	43264	0 %	0 %	50 %	50 %	293386481
74	NC_013973	CG	4	8	43612	43619	0 %	0 %	50 %	50 %	293386482
75	NC_013973	GC	3	6	45374	45379	0 %	0 %	50 %	50 %	293386484
76	NC_013973	GC	4	8	45711	45718	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
77	NC_013973	GC	3	6	46297	46302	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
78	NC_013973	GC	3	6	46423	46428	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
79	NC_013973	TC	3	6	46945	46950	0 %	50 %	0 %	50 %	293386485
80	NC_013973	GC	3	6	47083	47088	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
81	NC_013973	GT	3	6	47140	47145	0 %	50 %	50 %	0 %	293386485
82	NC_013973	GC	3	6	47951	47956	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
83	NC_013973	GC	3	6	48324	48329	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
84	NC_013973	GC	3	6	48551	48556	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
85	NC_013973	GC	3	6	49358	49363	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
86	NC_013973	GC	3	6	49581	49586	0 %	0 %	50 %	50 %	293386485
87	NC_013973	TA	3	6	51137	51142	50 %	50 %	0 %	0 %	293386487
88	NC_013973	GC	3	6	51437	51442	0 %	0 %	50 %	50 %	293386487
89	NC_013973	CG	3	6	51582	51587	0 %	0 %	50 %	50 %	293386487
90	NC_013973	GC	3	6	53119	53124	0 %	0 %	50 %	50 %	293386489
91	NC_013973	CG	3	6	53541	53546	0 %	0 %	50 %	50 %	293386489
92	NC_013973	GC	3	6	53827	53832	0 %	0 %	50 %	50 %	293386489
93	NC_013973	CT	3	6	54311	54316	0 %	50 %	0 %	50 %	293386490
94	NC_013973	TC	3	6	55033	55038	0 %	50 %	0 %	50 %	293386491
95	NC_013973	GT	3	6	55136	55141	0 %	50 %	50 %	0 %	293386491
96	NC_013973	TG	3	6	55144	55149	0 %	50 %	50 %	0 %	293386491
97	NC_013973	CG	3	6	55301	55306	0 %	0 %	50 %	50 %	293386492
98	NC_013973	GT	3	6	55483	55488	0 %	50 %	50 %	0 %	293386492
99	NC_013973	AC	3	6	55754	55759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013973	CG	3	6	56034	56039	0 %	0 %	50 %	50 %	293386493
101	NC_013973	CG	3	6	56411	56416	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
102	NC_013973	CA	3	6	57081	57086	50 %	0 %	0 %	50 %	293386494
103	NC_013973	TG	3	6	57501	57506	0 %	50 %	50 %	0 %	293386494
104	NC_013973	GC	4	8	58395	58402	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
105	NC_013973	GC	3	6	58522	58527	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
106	NC_013973	GC	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
107	NC_013973	CG	3	6	59002	59007	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
108	NC_013973	GC	3	6	59017	59022	0 %	0 %	50 %	50 %	293386494
109	NC_013973	GC	3	6	59904	59909	0 %	0 %	50 %	50 %	293386495
110	NC_013973	CG	3	6	60267	60272	0 %	0 %	50 %	50 %	293386495
111	NC_013973	GC	3	6	60624	60629	0 %	0 %	50 %	50 %	293386495
112	NC_013973	CG	3	6	61047	61052	0 %	0 %	50 %	50 %	293386496
113	NC_013973	GC	3	6	61334	61339	0 %	0 %	50 %	50 %	293386496
114	NC_013973	TG	3	6	61791	61796	0 %	50 %	50 %	0 %	293386497
115	NC_013973	GC	4	8	62084	62091	0 %	0 %	50 %	50 %	293386498
116	NC_013973	AT	3	6	62245	62250	50 %	50 %	0 %	0 %	293386498
117	NC_013973	CG	3	6	63447	63452	0 %	0 %	50 %	50 %	293386500
118	NC_013973	AT	3	6	65268	65273	50 %	50 %	0 %	0 %	293386501
119	NC_013973	AT	3	6	65583	65588	50 %	50 %	0 %	0 %	293386501
120	NC_013973	CG	3	6	66512	66517	0 %	0 %	50 %	50 %	293386502
121	NC_013973	GC	4	8	67101	67108	0 %	0 %	50 %	50 %	293386502
122	NC_013973	CG	4	8	67648	67655	0 %	0 %	50 %	50 %	293386503
123	NC_013973	TG	3	6	67760	67765	0 %	50 %	50 %	0 %	293386503
124	NC_013973	GC	3	6	67900	67905	0 %	0 %	50 %	50 %	293386503
125	NC_013973	CG	3	6	69717	69722	0 %	0 %	50 %	50 %	293386504
126	NC_013973	GC	3	6	70943	70948	0 %	0 %	50 %	50 %	293386506
127	NC_013973	GC	3	6	71387	71392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.