MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	CAAAC	2	10	3891	3900	60 %	0 %	0 %	40 %	293386382
2	NC_013972	CCGGT	2	10	4294	4303	0 %	20 %	40 %	40 %	293386382
3	NC_013972	GGATG	2	10	8283	8292	20 %	20 %	60 %	0 %	293386385
4	NC_013972	GTTTT	2	10	8740	8749	0 %	80 %	20 %	0 %	293386385
5	NC_013972	AAACG	2	10	11896	11905	60 %	0 %	20 %	20 %	293386390
6	NC_013972	GTTGA	2	10	13536	13545	20 %	40 %	40 %	0 %	293386392
7	NC_013972	GGCGG	2	10	14580	14589	0 %	0 %	80 %	20 %	293386393
8	NC_013972	CCCCG	2	10	15626	15635	0 %	0 %	20 %	80 %	293386395
9	NC_013972	AGAAA	2	10	17242	17251	80 %	0 %	20 %	0 %	293386400
10	NC_013972	GGAAA	2	10	18019	18028	60 %	0 %	40 %	0 %	293386403
11	NC_013972	ATTTC	2	10	18200	18209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013972	CGGTT	2	10	18383	18392	0 %	40 %	40 %	20 %	293386404
13	NC_013972	TGCCT	2	10	19845	19854	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013972	AGTGG	2	10	19871	19880	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013972	AAAGC	2	10	21220	21229	60 %	0 %	20 %	20 %	293386406
16	NC_013972	TGACG	2	10	23054	23063	20 %	20 %	40 %	20 %	293386407
17	NC_013972	GCCGG	2	10	23904	23913	0 %	0 %	60 %	40 %	293386408
18	NC_013972	GAAAG	2	10	26137	26146	60 %	0 %	40 %	0 %	293386413
19	NC_013972	TGCAG	2	10	26778	26787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013972	AGTTA	2	10	27586	27595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.