MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	CTG	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013972	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
3	NC_013972	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386374
4	NC_013972	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386374
5	NC_013972	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386374
6	NC_013972	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
7	NC_013972	TGC	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386374
8	NC_013972	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
9	NC_013972	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013972	TTG	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013972	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013972	GAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013972	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386375
14	NC_013972	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
15	NC_013972	TGC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
16	NC_013972	ACC	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386375
17	NC_013972	TGC	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
18	NC_013972	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013972	CGG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013972	TGA	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386376
21	NC_013972	GTG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386376
22	NC_013972	CAC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386376
23	NC_013972	CGG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386376
24	NC_013972	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386376
25	NC_013972	GCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386376
26	NC_013972	GAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013972	TCA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013972	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386377
29	NC_013972	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386378
30	NC_013972	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386379
31	NC_013972	GAG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386379
32	NC_013972	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386379
33	NC_013972	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386379
34	NC_013972	ACT	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386379
35	NC_013972	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386381
36	NC_013972	CCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013972	ACA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013972	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013972	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013972	GCC	2	6	3880	3885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013972	CGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386382
42	NC_013972	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386382
43	NC_013972	CTT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386382
44	NC_013972	TGT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386382
45	NC_013972	TAA	2	6	4071	4076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293386382
46	NC_013972	GTT	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386382
47	NC_013972	ATT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386382
48	NC_013972	TCA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386382
49	NC_013972	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013972	AGG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013972	TAT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013972	CGG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386383
53	NC_013972	GAT	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386383
54	NC_013972	CTC	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386383
55	NC_013972	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386383
56	NC_013972	CTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386383
57	NC_013972	CTT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386383
58	NC_013972	ATT	3	9	5657	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013972	ATG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
60	NC_013972	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
61	NC_013972	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386384
62	NC_013972	CGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
63	NC_013972	GCT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
64	NC_013972	CAG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
65	NC_013972	ATG	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
66	NC_013972	GCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
67	NC_013972	CTG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
68	NC_013972	GCA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
69	NC_013972	GGT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386384
70	NC_013972	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386384
71	NC_013972	GCG	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
72	NC_013972	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
73	NC_013972	TGC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
74	NC_013972	GCG	2	6	6604	6609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
75	NC_013972	CGA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
76	NC_013972	TGC	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
77	NC_013972	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
78	NC_013972	ACT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386384
79	NC_013972	GAT	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
80	NC_013972	CGG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
81	NC_013972	TGG	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386384
82	NC_013972	GAA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386384
83	NC_013972	CTC	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013972	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013972	CGG	2	6	7446	7451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
86	NC_013972	AGC	2	6	7519	7524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
87	NC_013972	CCA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
88	NC_013972	AGC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
89	NC_013972	TGC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
90	NC_013972	GCA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
91	NC_013972	CCA	2	6	7704	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
92	NC_013972	GGC	2	6	7768	7773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
93	NC_013972	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
94	NC_013972	CAA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386385
95	NC_013972	CCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386385
96	NC_013972	TGA	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
97	NC_013972	TGA	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
98	NC_013972	GTT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386385
99	NC_013972	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386385
100	NC_013972	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386385
101	NC_013972	TGC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
102	NC_013972	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
103	NC_013972	TGC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
104	NC_013972	CCA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
105	NC_013972	CCT	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386385
106	NC_013972	CCT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386385
107	NC_013972	TGC	3	9	8329	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
108	NC_013972	GAG	2	6	8425	8430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386385
109	NC_013972	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
110	NC_013972	GAT	2	6	8645	8650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
111	NC_013972	GAC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
112	NC_013972	ATC	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386385
113	NC_013972	CCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013972	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013972	GCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013972	TCT	2	6	9437	9442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386386
117	NC_013972	GCT	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386386
118	NC_013972	GTC	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386386
119	NC_013972	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386386
120	NC_013972	GAA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386387
121	NC_013972	GGC	2	6	10622	10627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386388
122	NC_013972	TGG	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386388
123	NC_013972	CTT	2	6	10873	10878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386388
124	NC_013972	AAG	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386388
125	NC_013972	GCA	2	6	10934	10939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386388
126	NC_013972	GAT	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386388
127	NC_013972	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386388
128	NC_013972	CAA	2	6	11449	11454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386389
129	NC_013972	TGG	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386389
130	NC_013972	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386390
131	NC_013972	CGC	2	6	11670	11675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386390
132	NC_013972	TGC	2	6	11679	11684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386390
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237	NC_013972	ATA	2	6	19021	19026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_013972	CAA	2	6	19255	19260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386405
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250	NC_013972	GAA	2	6	20113	20118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_013972	CAC	2	6	20456	20461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386406
256	NC_013972	CTT	2	6	20483	20488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386406
257	NC_013972	GAC	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386406
258	NC_013972	TCA	2	6	20549	20554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386406
259	NC_013972	GCT	2	6	20567	20572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386406
260	NC_013972	GGC	2	6	20599	20604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386406
261	NC_013972	GCG	2	6	20625	20630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386406
262	NC_013972	TCT	2	6	20635	20640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386406
263	NC_013972	GAA	2	6	20673	20678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386406
264	NC_013972	CAT	2	6	20810	20815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386406
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283	NC_013972	ATG	2	6	22150	22155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386406
284	NC_013972	AAG	2	6	22174	22179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013972	CCG	2	6	22233	22238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_013972	TCC	2	6	22324	22329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_013972	CGT	2	6	22337	22342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_013972	AAG	2	6	22352	22357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013972	TGT	2	6	22407	22412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013972	CTG	2	6	22441	22446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_013972	CAG	2	6	22496	22501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_013972	CGC	2	6	22606	22611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386407
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362	NC_013972	GTT	2	6	28172	28177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
363	NC_013972	AAT	2	6	28218	28223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.