MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	CG	3	6	630	635	0 %	0 %	50 %	50 %	293386374
2	NC_013972	TG	3	6	2613	2618	0 %	50 %	50 %	0 %	293386378
3	NC_013972	TA	3	6	3397	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	293386381
4	NC_013972	TC	3	6	3721	3726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013972	GC	3	6	5298	5303	0 %	0 %	50 %	50 %	293386383
6	NC_013972	CG	3	6	5869	5874	0 %	0 %	50 %	50 %	293386384
7	NC_013972	TC	3	6	6162	6167	0 %	50 %	0 %	50 %	293386384
8	NC_013972	TG	3	6	6463	6468	0 %	50 %	50 %	0 %	293386384
9	NC_013972	AG	3	6	6649	6654	50 %	0 %	50 %	0 %	293386384
10	NC_013972	AT	3	6	7646	7651	50 %	50 %	0 %	0 %	293386385
11	NC_013972	TA	3	6	9213	9218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013972	GC	3	6	9451	9456	0 %	0 %	50 %	50 %	293386386
13	NC_013972	AG	3	6	9885	9890	50 %	0 %	50 %	0 %	293386387
14	NC_013972	TC	3	6	9929	9934	0 %	50 %	0 %	50 %	293386387
15	NC_013972	CT	3	6	10363	10368	0 %	50 %	0 %	50 %	293386388
16	NC_013972	GA	3	6	10584	10589	50 %	0 %	50 %	0 %	293386388
17	NC_013972	GC	3	6	10640	10645	0 %	0 %	50 %	50 %	293386388
18	NC_013972	GA	3	6	10801	10806	50 %	0 %	50 %	0 %	293386388
19	NC_013972	CA	3	6	11123	11128	50 %	0 %	0 %	50 %	293386388
20	NC_013972	AC	3	6	11194	11199	50 %	0 %	0 %	50 %	293386388
21	NC_013972	GC	3	6	11578	11583	0 %	0 %	50 %	50 %	293386389
22	NC_013972	GC	4	8	12323	12330	0 %	0 %	50 %	50 %	293386390
23	NC_013972	CG	3	6	12684	12689	0 %	0 %	50 %	50 %	293386391
24	NC_013972	GC	3	6	12905	12910	0 %	0 %	50 %	50 %	293386391
25	NC_013972	CG	3	6	13106	13111	0 %	0 %	50 %	50 %	293386391
26	NC_013972	GC	3	6	13196	13201	0 %	0 %	50 %	50 %	293386391
27	NC_013972	CG	3	6	14215	14220	0 %	0 %	50 %	50 %	293386393
28	NC_013972	GC	3	6	14317	14322	0 %	0 %	50 %	50 %	293386393
29	NC_013972	TG	3	6	14485	14490	0 %	50 %	50 %	0 %	293386393
30	NC_013972	TC	3	6	14715	14720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013972	GT	3	6	16262	16267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013972	GT	3	6	16394	16399	0 %	50 %	50 %	0 %	293386399
33	NC_013972	TA	3	6	16590	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013972	AC	3	6	16715	16720	50 %	0 %	0 %	50 %	293386400
35	NC_013972	AT	3	6	16746	16751	50 %	50 %	0 %	0 %	293386400
36	NC_013972	AG	3	6	17002	17007	50 %	0 %	50 %	0 %	293386400
37	NC_013972	GC	4	8	17176	17183	0 %	0 %	50 %	50 %	293386400
38	NC_013972	TA	3	6	17281	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013972	TA	3	6	17305	17310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013972	AC	3	6	17346	17351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013972	TG	3	6	17395	17400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013972	AT	3	6	19141	19146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013972	AC	3	6	20502	20507	50 %	0 %	0 %	50 %	293386406
44	NC_013972	GC	3	6	21026	21031	0 %	0 %	50 %	50 %	293386406
45	NC_013972	CG	3	6	21116	21121	0 %	0 %	50 %	50 %	293386406
46	NC_013972	GC	3	6	22205	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013972	CG	3	6	22652	22657	0 %	0 %	50 %	50 %	293386407
48	NC_013972	AG	3	6	22745	22750	50 %	0 %	50 %	0 %	293386407
49	NC_013972	TC	3	6	23727	23732	0 %	50 %	0 %	50 %	293386408
50	NC_013972	TC	3	6	23896	23901	0 %	50 %	0 %	50 %	293386408
51	NC_013972	AG	3	6	24537	24542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013972	GT	3	6	25258	25263	0 %	50 %	50 %	0 %	293386411
53	NC_013972	CA	3	6	25398	25403	50 %	0 %	0 %	50 %	293386411
54	NC_013972	AT	3	6	25996	26001	50 %	50 %	0 %	0 %	293386413
55	NC_013972	GA	3	6	27268	27273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013972	GA	3	6	27312	27317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013972	CT	3	6	27402	27407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013972	GA	3	6	27767	27772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013972	TG	3	6	28211	28216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.