MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013971	TCATTC	2	12	83263	83274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013971	TTTTTC	2	12	89627	89638	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013971	TTACCT	2	12	202026	202037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013971	ATCAGA	2	12	203775	203786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013971	ATGGGC	2	12	239293	239304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013971	GCCAGC	2	12	351934	351945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013971	ATTTTA	2	12	364636	364647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013971	CGGCAA	2	12	386808	386819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013971	ATTTCT	2	12	393009	393020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013971	TAAATT	2	12	407907	407918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013971	CAGGTT	2	12	418472	418483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013971	TTTAAC	2	12	439021	439032	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013971	CTGTTT	2	12	455235	455246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013971	ATCAAT	2	12	477836	477847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013971	GACCGG	2	12	480671	480682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013971	GACAGA	2	12	510238	510249	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013971	GTTTTT	2	12	573306	573317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013971	GTTTTT	2	12	573423	573434	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013971	AGGGAA	2	12	582780	582791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013971	TTATGG	2	12	603532	603543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013971	CAAAAA	2	12	622355	622366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013971	GCTGGT	2	12	628862	628873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013971	ATCATT	2	12	631099	631110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013971	CAGCTG	2	12	676717	676728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013971	GTCGCT	2	12	718150	718161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013971	GATGCA	2	12	845061	845072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013971	TTTTTA	2	12	871311	871322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013971	CCCAGG	2	12	906430	906441	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013971	AATCAG	2	12	907302	907313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013971	CCGACA	2	12	924240	924251	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013971	CGATAA	2	12	949128	949139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013971	ATGGTG	2	12	995440	995451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013971	TATTTT	2	12	1038886	1038897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013971	TTAACC	2	12	1093071	1093082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013971	TGCGTA	2	12	1183139	1183150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013971	AATGTT	2	12	1231950	1231961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013971	TAGTAT	2	12	1258480	1258491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013971	AGCGAG	2	12	1283844	1283855	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013971	CGTAGT	2	12	1283899	1283910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013971	TGGCAA	14	84	1291577	1291660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013971	GCCCGC	2	12	1410596	1410607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013971	GGATCT	2	12	1511442	1511453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013971	GGCAAA	2	12	1516718	1516729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013971	TTTGCT	2	12	1539022	1539033	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013971	TTTAAT	2	12	1584320	1584331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013971	TGGTAT	2	12	1629595	1629606	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013971	CCGGGA	2	12	1642947	1642958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013971	GTAGCG	2	12	1655964	1655975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013971	TTTTAT	2	12	1721081	1721092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013971	CACAAC	2	12	1741490	1741501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013971	GTCAGC	2	12	1776713	1776724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013971	TCCGAC	2	12	1811727	1811738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013971	AGCGTA	2	12	1876889	1876900	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013971	ATTTGC	2	12	1922330	1922341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013971	GATAAG	2	12	1936236	1936247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013971	TTAACC	2	12	1970864	1970875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013971	GTCTGA	2	12	1972941	1972952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013971	TTGCGC	2	12	2004638	2004649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013971	TTACCT	2	12	2013088	2013099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013971	GTAAAA	2	12	2096235	2096246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013971	CTTTTT	2	12	2098395	2098406	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013971	GGACCG	2	12	2131490	2131501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013971	CGGCTG	2	12	2134050	2134061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013971	ATAATC	2	12	2152903	2152914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013971	ATTATC	2	12	2209944	2209955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013971	CGCCAG	2	12	2217883	2217894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013971	GGGTTA	2	12	2221815	2221826	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013971	TTCAGG	2	12	2238067	2238078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013971	CTGCCA	2	12	2246090	2246101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013971	TAAAAA	2	12	2256961	2256972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013971	CGGCTT	2	12	2261136	2261147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013971	CTTTCA	2	12	2270754	2270765	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013971	TCCAGC	2	12	2292868	2292879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013971	GCTGCC	2	12	2356472	2356483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013971	TGAGCC	2	12	2425596	2425607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013971	TTTTGT	2	12	2494639	2494650	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013971	GGAGCG	2	12	2494688	2494699	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013971	CATTAT	2	12	2556767	2556778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013971	TGCATC	2	12	2559848	2559859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013971	GCTTAA	2	12	2602919	2602930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013971	CGCAGC	2	12	2674251	2674262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013971	ACAAAA	2	12	2689368	2689379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013971	ATGCTG	2	12	2720371	2720382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013971	AAGGGG	2	12	2744408	2744419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013971	TGAAAT	2	12	2752824	2752835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013971	CTGTTA	2	12	2862824	2862835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013971	GCGTTA	2	12	2885672	2885683	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013971	ATTCAG	2	12	2967366	2967377	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013971	ACGCGG	2	12	2967420	2967431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013971	TTCGTT	2	12	3027861	3027872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013971	TTCCCG	2	12	3064317	3064328	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013971	CATCTG	2	12	3107860	3107871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013971	CTCATC	2	12	3152770	3152781	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013971	TCATAA	2	12	3305810	3305821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013971	CTGAAC	2	12	3329960	3329971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013971	GGCAAT	2	12	3337538	3337549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013971	GCGCCA	2	12	3382050	3382061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013971	TCGGGA	2	12	3423766	3423777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013971	TAAACA	2	12	3472950	3472961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013971	GCGGCT	2	12	3500622	3500633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013971	CAGCGG	2	12	3587710	3587721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013971	ATTCAA	2	12	3633682	3633693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013971	GCTAAA	2	12	3633830	3633841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013971	AATGAG	3	18	3651149	3651166	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013971	GGCCCC	2	12	3684488	3684499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013971	ATTTAA	2	12	3734205	3734216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013971	ATATAG	2	12	3782208	3782219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013971	TCAATA	2	12	3787981	3787992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.