MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 chromosome

Total Repeats: 2014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013971	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292897738
2	NC_013971	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292897738
3	NC_013971	CATGC	2	10	9545	9554	20 %	20 %	20 %	40 %	292897741
4	NC_013971	CTTGC	2	10	10428	10437	0 %	40 %	20 %	40 %	292897741
5	NC_013971	ATTGC	2	10	11999	12008	20 %	40 %	20 %	20 %	292897741
6	NC_013971	GGGGT	2	10	12421	12430	0 %	20 %	80 %	0 %	292897741
7	NC_013971	TACTG	2	10	14367	14376	20 %	40 %	20 %	20 %	292897741
8	NC_013971	CGTTT	2	10	14853	14862	0 %	60 %	20 %	20 %	292897741
9	NC_013971	CTTGC	2	10	17405	17414	0 %	40 %	20 %	40 %	292897742
10	NC_013971	CTTCT	2	10	18418	18427	0 %	60 %	0 %	40 %	292897742
11	NC_013971	CCTGC	2	10	20059	20068	0 %	20 %	20 %	60 %	292897742
12	NC_013971	TTCTG	2	10	27381	27390	0 %	60 %	20 %	20 %	292897743
13	NC_013971	GCCTT	2	10	27425	27434	0 %	40 %	20 %	40 %	292897743
14	NC_013971	CCGGG	2	10	30424	30433	0 %	0 %	60 %	40 %	292897747
15	NC_013971	GCGCC	2	10	30751	30760	0 %	0 %	40 %	60 %	292897747
16	NC_013971	GCGCT	2	10	33644	33653	0 %	20 %	40 %	40 %	292897750
17	NC_013971	TTCCG	2	10	38027	38036	0 %	40 %	20 %	40 %	292897753
18	NC_013971	CCGAT	2	10	39006	39015	20 %	20 %	20 %	40 %	292897754
19	NC_013971	CGCCA	2	10	39253	39262	20 %	0 %	20 %	60 %	292897755
20	NC_013971	CAAAC	2	10	39859	39868	60 %	0 %	0 %	40 %	292897755
21	NC_013971	ACAGC	2	10	50688	50697	40 %	0 %	20 %	40 %	292897759
22	NC_013971	GGTGA	2	10	53536	53545	20 %	20 %	60 %	0 %	292897760
23	NC_013971	GCTTT	2	10	55560	55569	0 %	60 %	20 %	20 %	292897762
24	NC_013971	AGCTG	2	10	58337	58346	20 %	20 %	40 %	20 %	292897764
25	NC_013971	CATCG	2	10	59220	59229	20 %	20 %	20 %	40 %	292897765
26	NC_013971	TTTGG	2	10	65897	65906	0 %	60 %	40 %	0 %	292897771
27	NC_013971	ACGCC	2	10	69681	69690	20 %	0 %	20 %	60 %	292897773
28	NC_013971	TGCGG	2	10	69890	69899	0 %	20 %	60 %	20 %	292897773
29	NC_013971	CGCGA	2	10	72346	72355	20 %	0 %	40 %	40 %	292897775
30	NC_013971	AGGCA	2	10	77247	77256	40 %	0 %	40 %	20 %	292897779
31	NC_013971	ACAGA	2	10	79690	79699	60 %	0 %	20 %	20 %	292897781
32	NC_013971	AAAGC	2	10	81011	81020	60 %	0 %	20 %	20 %	292897782
33	NC_013971	AAAAT	2	10	85894	85903	80 %	20 %	0 %	0 %	292897786
34	NC_013971	AAAAT	2	10	86479	86488	80 %	20 %	0 %	0 %	292897786
35	NC_013971	TATTC	2	10	89099	89108	20 %	60 %	0 %	20 %	292897790
36	NC_013971	GCTGA	2	10	89357	89366	20 %	20 %	40 %	20 %	292897791
37	NC_013971	CCAAA	2	10	90896	90905	60 %	0 %	0 %	40 %	292897792
38	NC_013971	TTAGC	2	10	91386	91395	20 %	40 %	20 %	20 %	292897792
39	NC_013971	GAGGG	2	10	91890	91899	20 %	0 %	80 %	0 %	292897793
40	NC_013971	GCTGC	2	10	96538	96547	0 %	20 %	40 %	40 %	292897796
41	NC_013971	ATCTC	2	10	96825	96834	20 %	40 %	0 %	40 %	292897797
42	NC_013971	GCAGC	2	10	101627	101636	20 %	0 %	40 %	40 %	292897803
43	NC_013971	TGGCA	2	10	102866	102875	20 %	20 %	40 %	20 %	292897804
44	NC_013971	TAAGG	2	10	103853	103862	40 %	20 %	40 %	0 %	292897805
45	NC_013971	CAGCG	2	10	105363	105372	20 %	0 %	40 %	40 %	292897808
46	NC_013971	TTCAG	2	10	110654	110663	20 %	40 %	20 %	20 %	292897813
47	NC_013971	TAAAA	2	10	113569	113578	80 %	20 %	0 %	0 %	292897816
48	NC_013971	ACAAG	2	10	117002	117011	60 %	0 %	20 %	20 %	292897819
49	NC_013971	GGGCA	2	10	117348	117357	20 %	0 %	60 %	20 %	292897819
50	NC_013971	AGCGT	2	10	117430	117439	20 %	20 %	40 %	20 %	292897819
51	NC_013971	AGCGT	2	10	117607	117616	20 %	20 %	40 %	20 %	292897819
52	NC_013971	GCGCT	2	10	118464	118473	0 %	20 %	40 %	40 %	292897820
53	NC_013971	TCGCA	2	10	118690	118699	20 %	20 %	20 %	40 %	292897820
54	NC_013971	GGCCG	2	10	119233	119242	0 %	0 %	60 %	40 %	292897821
55	NC_013971	GGAAC	2	10	120428	120437	40 %	0 %	40 %	20 %	292897822
56	NC_013971	CGCTG	2	10	122949	122958	0 %	20 %	40 %	40 %	292897824
57	NC_013971	CTCTT	2	10	122978	122987	0 %	60 %	0 %	40 %	292897824
58	NC_013971	GCACA	2	10	124182	124191	40 %	0 %	20 %	40 %	292897826
59	NC_013971	AACAA	2	10	124346	124355	80 %	0 %	0 %	20 %	292897827
60	NC_013971	GTGCA	2	10	124775	124784	20 %	20 %	40 %	20 %	292897827
61	NC_013971	GTTTG	2	10	125110	125119	0 %	60 %	40 %	0 %	292897828
62	NC_013971	CCGCA	2	10	125441	125450	20 %	0 %	20 %	60 %	292897828
63	NC_013971	GCGCT	2	10	125488	125497	0 %	20 %	40 %	40 %	292897828
64	NC_013971	CCACG	2	10	125971	125980	20 %	0 %	20 %	60 %	292897829
65	NC_013971	GCCCG	2	10	127128	127137	0 %	0 %	40 %	60 %	292897830
66	NC_013971	TCTGC	2	10	127706	127715	0 %	40 %	20 %	40 %	292897831
67	NC_013971	TGCCC	2	10	130814	130823	0 %	20 %	20 %	60 %	292897834
68	NC_013971	GCCTG	2	10	130860	130869	0 %	20 %	40 %	40 %	292897834
69	NC_013971	AAATC	2	10	133673	133682	60 %	20 %	0 %	20 %	292897837
70	NC_013971	GGCAG	2	10	137205	137214	20 %	0 %	60 %	20 %	292897840
71	NC_013971	CGCCA	2	10	139974	139983	20 %	0 %	20 %	60 %	292897843
72	NC_013971	CCGGG	2	10	140447	140456	0 %	0 %	60 %	40 %	292897844
73	NC_013971	CGTGC	2	10	140496	140505	0 %	20 %	40 %	40 %	292897844
74	NC_013971	TCAGT	2	10	143464	143473	20 %	40 %	20 %	20 %	292897847
75	NC_013971	ACATC	2	10	143997	144006	40 %	20 %	0 %	40 %	292897848
76	NC_013971	TGGCC	2	10	144318	144327	0 %	20 %	40 %	40 %	292897848
77	NC_013971	GGGCA	2	10	145628	145637	20 %	0 %	60 %	20 %	292897849
78	NC_013971	ACTTC	2	10	146727	146736	20 %	40 %	0 %	40 %	292897850
79	NC_013971	ACGCG	2	10	146818	146827	20 %	0 %	40 %	40 %	292897850
80	NC_013971	CGTAT	2	10	149492	149501	20 %	40 %	20 %	20 %	292897853
81	NC_013971	GCTCG	2	10	149974	149983	0 %	20 %	40 %	40 %	292897854
82	NC_013971	GTTGG	2	10	152130	152139	0 %	40 %	60 %	0 %	292897856
83	NC_013971	AGCGG	2	10	154441	154450	20 %	0 %	60 %	20 %	292897858
84	NC_013971	CTGTT	2	10	154675	154684	0 %	60 %	20 %	20 %	292897858
85	NC_013971	GGCAT	2	10	155852	155861	20 %	20 %	40 %	20 %	292897858
86	NC_013971	AAGGG	2	10	155923	155932	40 %	0 %	60 %	0 %	292897858
87	NC_013971	ACGGT	2	10	161623	161632	20 %	20 %	40 %	20 %	292897866
88	NC_013971	AACCG	2	10	161675	161684	40 %	0 %	20 %	40 %	292897866
89	NC_013971	GGGGC	2	10	162063	162072	0 %	0 %	80 %	20 %	292897866
90	NC_013971	GGCAT	2	10	164734	164743	20 %	20 %	40 %	20 %	292897868
91	NC_013971	CGGCC	2	10	166746	166755	0 %	0 %	40 %	60 %	292897869
92	NC_013971	ATCAC	2	10	173552	173561	40 %	20 %	0 %	40 %	292897875
93	NC_013971	CAGAG	2	10	175583	175592	40 %	0 %	40 %	20 %	292897877
94	NC_013971	TCACG	2	10	184975	184984	20 %	20 %	20 %	40 %	292897881
95	NC_013971	CAGCG	2	10	186422	186431	20 %	0 %	40 %	40 %	292897882
96	NC_013971	CCGGC	2	10	191425	191434	0 %	0 %	40 %	60 %	292897886
97	NC_013971	CTTTG	2	10	192056	192065	0 %	60 %	20 %	20 %	292897886
98	NC_013971	TGCGG	2	10	192499	192508	0 %	20 %	60 %	20 %	292897887
99	NC_013971	TGCTG	2	10	192730	192739	0 %	40 %	40 %	20 %	292897887
100	NC_013971	GGGCA	2	10	194039	194048	20 %	0 %	60 %	20 %	292897888
101	NC_013971	GAAGT	2	10	195367	195376	40 %	20 %	40 %	0 %	292897889
102	NC_013971	ATGAA	2	10	195950	195959	60 %	20 %	20 %	0 %	292897889
103	NC_013971	CTTCT	2	10	196502	196511	0 %	60 %	0 %	40 %	292897890
104	NC_013971	AGCGG	2	10	197606	197615	20 %	0 %	60 %	20 %	292897891
105	NC_013971	CAGGC	2	10	200391	200400	20 %	0 %	40 %	40 %	292897893
106	NC_013971	TTCTG	2	10	201444	201453	0 %	60 %	20 %	20 %	292897893
107	NC_013971	CGCCC	2	10	202830	202839	0 %	0 %	20 %	80 %	292897895
108	NC_013971	TCACG	2	10	203008	203017	20 %	20 %	20 %	40 %	292897895
109	NC_013971	CGATG	2	10	203478	203487	20 %	20 %	40 %	20 %	292897895
110	NC_013971	CGAAC	2	10	206459	206468	40 %	0 %	20 %	40 %	292897898
111	NC_013971	GGGCT	2	10	207215	207224	0 %	20 %	60 %	20 %	292897899
112	NC_013971	CCGCG	2	10	208632	208641	0 %	0 %	40 %	60 %	292897900
113	NC_013971	CTGCG	2	10	211033	211042	0 %	20 %	40 %	40 %	292897902
114	NC_013971	AGGTC	2	10	211742	211751	20 %	20 %	40 %	20 %	292897903
115	NC_013971	GGCGC	2	10	212802	212811	0 %	0 %	60 %	40 %	292897904
116	NC_013971	GGCGT	2	10	215000	215009	0 %	20 %	60 %	20 %	292897906
117	NC_013971	CGCCA	2	10	216420	216429	20 %	0 %	20 %	60 %	292897907
118	NC_013971	CGGCG	2	10	216635	216644	0 %	0 %	60 %	40 %	292897907
119	NC_013971	CGCGG	2	10	219264	219273	0 %	0 %	60 %	40 %	292897909
120	NC_013971	CAACA	2	10	224110	224119	60 %	0 %	0 %	40 %	292897913
121	NC_013971	TTGGC	2	10	227642	227651	0 %	40 %	40 %	20 %	292897916
122	NC_013971	GCCGG	2	10	229373	229382	0 %	0 %	60 %	40 %	292897918
123	NC_013971	GCCGC	2	10	229736	229745	0 %	0 %	40 %	60 %	292897919
124	NC_013971	CCGTA	2	10	230798	230807	20 %	20 %	20 %	40 %	292897919
125	NC_013971	AGGCC	2	10	231313	231322	20 %	0 %	40 %	40 %	292897919
126	NC_013971	GGAAG	2	10	232641	232650	40 %	0 %	60 %	0 %	292897920
127	NC_013971	GCTGG	2	10	234506	234515	0 %	20 %	60 %	20 %	292897922
128	NC_013971	TCATC	2	10	237476	237485	20 %	40 %	0 %	40 %	292897925
129	NC_013971	GGGCG	2	10	237753	237762	0 %	0 %	80 %	20 %	292897925
130	NC_013971	CGGGC	2	10	238069	238078	0 %	0 %	60 %	40 %	292897925
131	NC_013971	CGATA	2	10	240220	240229	40 %	20 %	20 %	20 %	292897927
132	NC_013971	GGCAG	2	10	241880	241889	20 %	0 %	60 %	20 %	292897929
133	NC_013971	CAAAC	2	10	243445	243454	60 %	0 %	0 %	40 %	292897930
134	NC_013971	CGACT	2	10	244075	244084	20 %	20 %	20 %	40 %	292897930
135	NC_013971	CCGGT	2	10	244403	244412	0 %	20 %	40 %	40 %	292897930
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155	NC_013971	GTTCG	2	10	292065	292074	0 %	40 %	40 %	20 %	292897964
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258	NC_013971	CCGAG	2	10	511142	511151	20 %	0 %	40 %	40 %	292898151
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260	NC_013971	GCCTG	2	10	518271	518280	0 %	20 %	40 %	40 %	292898155
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