MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 chromosome

Total Repeats: 50466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013971	CGG	2	6	67	72	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897735
2	NC_013971	CAG	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897735
3	NC_013971	GCT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897735
4	NC_013971	TGT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897735
5	NC_013971	GTG	3	9	369	377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897735
6	NC_013971	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897735
7	NC_013971	GAT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897735
8	NC_013971	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897736
9	NC_013971	GGT	2	6	861	866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897736
10	NC_013971	CCA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897736
11	NC_013971	CTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897736
12	NC_013971	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897736
13	NC_013971	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897736
14	NC_013971	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897736
15	NC_013971	AGC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897736
16	NC_013971	CGT	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897736
17	NC_013971	TGA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897736
18	NC_013971	CGG	2	6	1394	1399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897737
19	NC_013971	CAG	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897737
20	NC_013971	GCC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
21	NC_013971	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897737
22	NC_013971	CGC	2	6	1523	1528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
23	NC_013971	AGT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
24	NC_013971	ACC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897737
25	NC_013971	TGC	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
26	NC_013971	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897737
27	NC_013971	GCC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
28	NC_013971	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
29	NC_013971	GTG	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897737
30	NC_013971	CCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
31	NC_013971	TCC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897737
32	NC_013971	GCC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
33	NC_013971	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897737
34	NC_013971	CAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897737
35	NC_013971	GCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
36	NC_013971	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
37	NC_013971	TCA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
38	NC_013971	CCA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897737
39	NC_013971	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897737
40	NC_013971	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
41	NC_013971	TGT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
42	NC_013971	CTG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
43	NC_013971	TCG	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
44	NC_013971	TCA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
45	NC_013971	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
46	NC_013971	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
47	NC_013971	ATA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897737
48	NC_013971	TCG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
49	NC_013971	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
50	NC_013971	TGG	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897737
51	NC_013971	TGT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
52	NC_013971	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
53	NC_013971	GCT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
54	NC_013971	ACC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
55	NC_013971	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897738
56	NC_013971	AGC	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
57	NC_013971	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
58	NC_013971	TGG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897738
59	NC_013971	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
60	NC_013971	CCA	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
61	NC_013971	GCC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897738
62	NC_013971	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
63	NC_013971	CAG	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
64	NC_013971	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897738
65	NC_013971	ATC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897738
66	NC_013971	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
67	NC_013971	CGC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897738
68	NC_013971	CAG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
69	NC_013971	GCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
70	NC_013971	AGC	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
71	NC_013971	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
72	NC_013971	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897738
73	NC_013971	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
74	NC_013971	CTG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
75	NC_013971	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
76	NC_013971	TTG	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897738
77	NC_013971	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
78	NC_013971	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897738
79	NC_013971	CCA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
80	NC_013971	CTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
81	NC_013971	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897739
82	NC_013971	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
83	NC_013971	CTG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
84	NC_013971	GTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
85	NC_013971	CGG	2	6	5383	5388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897739
86	NC_013971	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897739
87	NC_013971	TGC	4	12	5472	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
88	NC_013971	GGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897739
89	NC_013971	TTG	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897739
90	NC_013971	GCT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
91	NC_013971	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
92	NC_013971	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
93	NC_013971	GCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
94	NC_013971	CTG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
95	NC_013971	CTC	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897739
96	NC_013971	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
97	NC_013971	CAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
98	NC_013971	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897739
99	NC_013971	AGC	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
100	NC_013971	TCA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897739
101	NC_013971	TCA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897739
102	NC_013971	CGG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897739
103	NC_013971	CAG	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
104	NC_013971	ATG	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897739
105	NC_013971	GAA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897740
106	NC_013971	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
107	NC_013971	GGC	2	6	7042	7047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897740
108	NC_013971	TCT	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897740
109	NC_013971	GGT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897740
110	NC_013971	CGG	2	6	7079	7084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897740
111	NC_013971	CTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
112	NC_013971	TGC	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
113	NC_013971	GGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897740
114	NC_013971	TGT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897740
115	NC_013971	GCT	3	9	7509	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
116	NC_013971	TCT	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897740
117	NC_013971	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897740
118	NC_013971	GCT	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
119	NC_013971	GGT	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897740
120	NC_013971	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897740
121	NC_013971	GCA	2	6	7862	7867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897740
122	NC_013971	TGT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897740
123	NC_013971	GTG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897740
124	NC_013971	CGG	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897740
125	NC_013971	ACC	2	6	8029	8034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897740
126	NC_013971	CTG	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897740
127	NC_013971	GAT	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897740
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129	NC_013971	CCG	2	6	8144	8149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897740
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254	NC_013971	ATC	2	6	19550	19555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897742
255	NC_013971	TCC	2	6	19583	19588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897742
256	NC_013971	ACC	2	6	19624	19629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897742
257	NC_013971	TGA	2	6	19651	19656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897742
258	NC_013971	TAA	2	6	19678	19683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897742
259	NC_013971	AAC	2	6	19739	19744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292897742
260	NC_013971	CTG	2	6	19878	19883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897742
261	NC_013971	TCC	2	6	19892	19897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897742
262	NC_013971	TCA	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897742
263	NC_013971	TGT	2	6	20026	20031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897742
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266	NC_013971	TGT	2	6	20341	20346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897742
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270	NC_013971	TAT	2	6	20708	20713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292897742
271	NC_013971	TGG	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897742
272	NC_013971	AAG	2	6	20786	20791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897742
273	NC_013971	CTC	2	6	20858	20863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897742
274	NC_013971	GCT	2	6	20882	20887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897742
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280	NC_013971	TTA	2	6	21480	21485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292897742
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282	NC_013971	TGC	2	6	21554	21559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897742
283	NC_013971	GTG	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897742
284	NC_013971	TAA	2	6	21884	21889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897743
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287	NC_013971	ATA	2	6	22240	22245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897743
288	NC_013971	TCA	2	6	22331	22336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897743
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