MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013968	TCGAA	2	10	7629	7638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013968	CTCGT	2	10	11374	11383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013968	GGTCG	2	10	14636	14645	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013968	AAAAT	2	10	16980	16989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013968	TTCTA	2	10	18616	18625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013968	TCGAT	2	10	38500	38509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013968	AGACG	3	15	48748	48762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013968	GCGGT	2	10	48867	48876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013968	AGGCC	2	10	48890	48899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013968	CGACG	2	10	51429	51438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013968	ATCAA	2	10	53082	53091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013968	GTGGG	2	10	57881	57890	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013968	TCTCA	2	10	58998	59007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013968	TCTCT	2	10	60918	60927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013968	ATTGC	2	10	76422	76431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013968	AAATG	2	10	79411	79420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013968	ATCAA	2	10	81053	81062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013968	GCGGT	2	10	82963	82972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013968	AGGCC	2	10	82986	82995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013968	CGCGT	2	10	84727	84736	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013968	GACCC	2	10	84741	84750	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.