MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 1037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013968	GAT	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657125
2	NC_013968	GAC	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
3	NC_013968	ATC	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657125
4	NC_013968	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657125
5	NC_013968	CGA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
6	NC_013968	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657125
7	NC_013968	CCT	2	6	583	588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657125
8	NC_013968	ATG	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657125
9	NC_013968	CGA	3	9	642	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
10	NC_013968	CGA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
11	NC_013968	CAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657125
12	NC_013968	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657125
13	NC_013968	TCA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657125
14	NC_013968	AAG	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657125
15	NC_013968	CAG	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657126
16	NC_013968	GAG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657126
17	NC_013968	TCG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657126
18	NC_013968	GAG	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657126
19	NC_013968	CGC	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657126
20	NC_013968	GTG	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657126
21	NC_013968	ACG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657126
22	NC_013968	TGC	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657126
23	NC_013968	GTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657126
24	NC_013968	TGA	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657126
25	NC_013968	GCT	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657127
26	NC_013968	GAA	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657127
27	NC_013968	AAC	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657127
28	NC_013968	CCA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657127
29	NC_013968	CTC	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657127
30	NC_013968	TAT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657127
31	NC_013968	TCT	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657127
32	NC_013968	ATT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657127
33	NC_013968	TGC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657127
34	NC_013968	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657127
35	NC_013968	AGA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657127
36	NC_013968	ACT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657127
37	NC_013968	ATG	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657127
38	NC_013968	AAT	2	6	3076	3081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292657127
39	NC_013968	ATG	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657127
40	NC_013968	GTC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
41	NC_013968	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657128
42	NC_013968	CGG	2	6	3513	3518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657128
43	NC_013968	CAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657128
44	NC_013968	CAG	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
45	NC_013968	GTC	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
46	NC_013968	GTG	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657128
47	NC_013968	GCG	2	6	3723	3728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657128
48	NC_013968	TCG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
49	NC_013968	AGC	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
50	NC_013968	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
51	NC_013968	TTC	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657128
52	NC_013968	GGT	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657128
53	NC_013968	GTC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
54	NC_013968	TAG	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657128
55	NC_013968	CTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657128
56	NC_013968	GGA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657128
57	NC_013968	CGA	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657128
58	NC_013968	TCG	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
59	NC_013968	CGA	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
60	NC_013968	CGA	4	12	4696	4707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
61	NC_013968	CAT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657129
62	NC_013968	GAA	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657129
63	NC_013968	CAG	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
64	NC_013968	ACG	3	9	4761	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
65	NC_013968	GTC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
66	NC_013968	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
67	NC_013968	CCG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657129
68	NC_013968	TCG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
69	NC_013968	CGT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657129
70	NC_013968	GAC	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
71	NC_013968	ACC	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657129
72	NC_013968	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657129
73	NC_013968	GTG	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657129
74	NC_013968	ACG	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
75	NC_013968	AGG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657129
76	NC_013968	CGA	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
77	NC_013968	ACC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657129
78	NC_013968	GAG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657129
79	NC_013968	ACG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
80	NC_013968	CGA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657129
81	NC_013968	CAC	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657130
82	NC_013968	CGC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657130
83	NC_013968	TCG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657130
84	NC_013968	TGC	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657130
85	NC_013968	TCC	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657130
86	NC_013968	TCG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
87	NC_013968	TTC	2	6	5800	5805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657131
88	NC_013968	TCG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
89	NC_013968	CAC	3	9	5829	5837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657131
90	NC_013968	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657131
91	NC_013968	CGT	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
92	NC_013968	GTC	3	9	5974	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657131
93	NC_013968	GGA	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657132
94	NC_013968	GAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657132
95	NC_013968	CGA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657132
96	NC_013968	CTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657132
97	NC_013968	GCA	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
98	NC_013968	CTG	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
99	NC_013968	ACG	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
100	NC_013968	TTC	2	6	6680	6685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657133
101	NC_013968	ACG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657133
102	NC_013968	GTC	3	9	6812	6820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
103	NC_013968	TCG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657133
104	NC_013968	CGC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657133
105	NC_013968	CGT	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657134
106	NC_013968	GAG	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657134
107	NC_013968	CGG	3	9	7375	7383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657134
108	NC_013968	TGA	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657134
109	NC_013968	CAC	2	6	7762	7767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657135
110	NC_013968	CGA	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
111	NC_013968	ACG	2	6	7872	7877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
112	NC_013968	CAA	2	6	7963	7968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657135
113	NC_013968	CGA	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
114	NC_013968	GAC	2	6	8027	8032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
115	NC_013968	GAC	2	6	8059	8064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
116	NC_013968	CGT	2	6	8158	8163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657135
117	NC_013968	CGA	2	6	8326	8331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
118	NC_013968	ACG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
119	NC_013968	ACC	2	6	8460	8465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657135
120	NC_013968	ACG	2	6	8590	8595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
121	NC_013968	GTC	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657135
122	NC_013968	CGA	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
123	NC_013968	CGA	2	6	8647	8652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
124	NC_013968	CGA	2	6	8680	8685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
125	NC_013968	GAC	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
126	NC_013968	CGA	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657135
127	NC_013968	TCG	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657135
128	NC_013968	GAA	2	6	9313	9318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657136
129	NC_013968	TGG	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657136
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131	NC_013968	TAC	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657136
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249	NC_013968	GCC	2	6	21821	21826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657154
250	NC_013968	TCA	2	6	21837	21842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657154
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252	NC_013968	CAG	2	6	21899	21904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657154
253	NC_013968	TCG	2	6	21924	21929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657154
254	NC_013968	CGC	2	6	21970	21975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657154
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497	NC_013968	GTC	2	6	39083	39088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657163
498	NC_013968	TCG	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657163
499	NC_013968	ACG	2	6	39304	39309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657163
500	NC_013968	TGA	2	6	39362	39367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657163

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