MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013968	GA	3	6	3277	3282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013968	AC	3	6	6999	7004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013968	AT	3	6	7064	7069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013968	AC	3	6	9290	9295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013968	TC	3	6	11099	11104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013968	CT	3	6	11427	11432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013968	GT	3	6	12413	12418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013968	CA	3	6	12588	12593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013968	CG	3	6	13929	13934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013968	GA	3	6	14271	14276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013968	TA	3	6	14913	14918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013968	TC	3	6	16458	16463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013968	CG	3	6	17567	17572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013968	AC	3	6	17987	17992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013968	AT	3	6	30614	30619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013968	AC	3	6	32736	32741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013968	TA	3	6	35868	35873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013968	TC	3	6	47094	47099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013968	AT	3	6	49176	49181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013968	CA	3	6	49276	49281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013968	AG	3	6	50868	50873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013968	AT	3	6	54984	54989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013968	AC	3	6	55866	55871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013968	AG	3	6	56191	56196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013968	CA	3	6	57684	57689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013968	GT	3	6	57898	57903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013968	GT	3	6	57938	57943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013968	GA	3	6	57981	57986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013968	AT	3	6	58130	58135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013968	GA	3	6	58210	58215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013968	TC	3	6	59048	59053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013968	TC	3	6	59468	59473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013968	CG	3	6	59805	59810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013968	AC	3	6	60292	60297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013968	AG	3	6	60705	60710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013968	CT	3	6	60735	60740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013968	GC	3	6	60761	60766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013968	CT	3	6	60980	60985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013968	AG	3	6	62923	62928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013968	TC	3	6	63204	63209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013968	CT	3	6	63253	63258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013968	TG	3	6	63512	63517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013968	GT	3	6	63712	63717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013968	GA	3	6	66360	66365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013968	TC	3	6	68796	68801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013968	GA	3	6	68906	68911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013968	TG	3	6	74496	74501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013968	GT	3	6	74608	74613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013968	GC	3	6	76565	76570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013968	GA	4	8	79064	79071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013968	CA	3	6	80896	80901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013968	TC	3	6	81223	81228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013968	AC	6	12	84553	84564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013968	TA	3	6	84616	84621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013968	GT	6	12	84763	84774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013968	AC	3	6	84838	84843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013968	AC	3	6	84859	84864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013968	AC	3	6	85072	85077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.