MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 1520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	CCCG	2	8	57	64	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_013967	GTAT	2	8	6811	6818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013967	GCCG	2	8	6836	6843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013967	CCGC	2	8	7316	7323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013967	CGTC	3	12	11575	11586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013967	GTTT	2	8	11821	11828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013967	CGAC	2	8	15336	15343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013967	ACCG	2	8	18308	18315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013967	CTCG	2	8	23402	23409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013967	ACCG	3	12	25326	25337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013967	TCAC	2	8	27583	27590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013967	ACCC	2	8	27609	27616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013967	TTCG	2	8	27748	27755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013967	TGAG	2	8	27789	27796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013967	GCTC	2	8	32726	32733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013967	CGGG	2	8	33493	33500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013967	GACG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013967	GTCG	2	8	46689	46696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013967	TCGG	2	8	49934	49941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013967	TTTG	2	8	63181	63188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013967	CTCG	2	8	63603	63610	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013967	CGGT	2	8	67658	67665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013967	CGGT	2	8	67756	67763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013967	GCTC	2	8	69183	69190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013967	CGCC	2	8	69585	69592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_013967	CGCC	2	8	73790	73797	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013967	CTCG	2	8	80708	80715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013967	TCGG	2	8	88618	88625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013967	TTTC	2	8	90784	90791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013967	CCGA	2	8	94072	94079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013967	ACCG	2	8	94082	94089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013967	GCCG	2	8	95090	95097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013967	GTCG	2	8	97447	97454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013967	CCCG	2	8	97498	97505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_013967	TCGG	2	8	102847	102854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013967	CTCG	2	8	102866	102873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013967	GCCG	2	8	102874	102881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013967	CTCC	2	8	102916	102923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013967	TAGG	2	8	103073	103080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013967	GCCG	2	8	104689	104696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013967	ACCG	2	8	109514	109521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013967	GGTC	2	8	110768	110775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013967	CGAC	2	8	112076	112083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013967	TTTC	2	8	114159	114166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013967	TGCC	2	8	117324	117331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013967	CCGA	2	8	118578	118585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013967	ACCG	2	8	118606	118613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013967	CGCT	2	8	121291	121298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013967	CTCG	2	8	121310	121317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013967	GCTC	2	8	121473	121480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013967	CTCG	2	8	121491	121498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013967	CGGC	2	8	122357	122364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013967	CGCC	2	8	122899	122906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013967	CGAG	2	8	123029	123036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013967	TTGT	2	8	124783	124790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013967	AACA	2	8	126564	126571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013967	AAAC	2	8	131730	131737	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013967	GACC	2	8	135127	135134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013967	GATA	2	8	136883	136890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013967	CGCT	2	8	143217	143224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013967	CGGC	2	8	144330	144337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013967	GACC	2	8	144341	144348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013967	AGTC	2	8	145410	145417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013967	CGCC	2	8	153392	153399	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013967	CCGC	2	8	154309	154316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013967	GCCC	2	8	163810	163817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013967	CGCC	2	8	163839	163846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_013967	CCGT	2	8	164594	164601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013967	CGGC	2	8	164607	164614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013967	CCCG	2	8	171951	171958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_013967	CGCC	2	8	176025	176032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_013967	GCCG	2	8	176056	176063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013967	TCGG	2	8	176894	176901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013967	TGGG	2	8	178142	178149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013967	GCGG	2	8	180115	180122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013967	CGGT	2	8	181296	181303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013967	TTCG	2	8	185341	185348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013967	GTCG	2	8	188228	188235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013967	GCTT	2	8	188274	188281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013967	GACG	2	8	188293	188300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013967	TCGC	2	8	188308	188315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013967	ACAT	2	8	191336	191343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013967	CGCC	2	8	191676	191683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013967	GACC	2	8	191775	191782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013967	TCAC	2	8	192675	192682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013967	CCGA	2	8	193214	193221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013967	AATC	2	8	196482	196489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013967	GTCG	2	8	196529	196536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013967	GCCC	2	8	201495	201502	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_013967	TTTC	2	8	202002	202009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013967	GTTC	2	8	204891	204898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013967	TCCG	2	8	206597	206604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013967	CGCC	2	8	207412	207419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_013967	AAAG	2	8	208787	208794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013967	CGTG	2	8	208807	208814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013967	GACC	2	8	212203	212210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013967	GAAA	2	8	215911	215918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013967	TCCG	2	8	218182	218189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013967	GTTC	2	8	220611	220618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013967	CACT	2	8	222368	222375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013967	ACCC	2	8	223473	223480	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_013967	CGGC	2	8	226703	226710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013967	CGTG	2	8	229129	229136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013967	AGCA	2	8	236283	236290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013967	GCTG	2	8	243707	243714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013967	CTGT	2	8	243829	243836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013967	CTGT	2	8	245284	245291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013967	TCGC	2	8	246719	246726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013967	ATCC	2	8	247068	247075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013967	TGCG	2	8	249518	249525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013967	GCAG	2	8	251583	251590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013967	GCCC	2	8	256686	256693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013967	CTAC	2	8	256746	256753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013967	TCGC	2	8	257935	257942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013967	GGTG	2	8	259987	259994	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013967	GGTC	2	8	260442	260449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013967	TCGG	2	8	260552	260559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013967	CGAA	2	8	260574	260581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013967	CGAG	2	8	262257	262264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013967	GCAC	2	8	262282	262289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013967	CGCC	2	8	266339	266346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013967	TGAC	2	8	268204	268211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013967	CGGG	2	8	270123	270130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013967	CGCT	2	8	270156	270163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013967	GTAC	2	8	272282	272289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013967	GAGT	2	8	272486	272493	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013967	ACCG	2	8	274317	274324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013967	GTCG	2	8	277614	277621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013967	CCGG	2	8	288804	288811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013967	CGTT	2	8	295276	295283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013967	CGCC	2	8	295948	295955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_013967	AACG	2	8	304772	304779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013967	GTGA	2	8	311343	311350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013967	CGGT	2	8	322522	322529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013967	CAAC	2	8	323314	323321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013967	GCCC	2	8	329296	329303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_013967	CTTC	2	8	329532	329539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013967	AAGA	2	8	329661	329668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013967	CTGT	2	8	329714	329721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013967	GACT	2	8	334699	334706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013967	TCGT	2	8	336829	336836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013967	ACCG	2	8	336878	336885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013967	ACTC	2	8	337017	337024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013967	AATC	2	8	338104	338111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013967	GGAG	2	8	338515	338522	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013967	GGTC	2	8	339051	339058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013967	TCCG	2	8	339767	339774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013967	CAAT	2	8	339795	339802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013967	AGTA	2	8	339864	339871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013967	GAGC	2	8	341974	341981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013967	GCGA	2	8	341985	341992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013967	TTCC	2	8	342031	342038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013967	GTCA	2	8	342052	342059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_013967	GCGA	2	8	342091	342098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013967	CGAA	2	8	342652	342659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_013967	ACGC	2	8	343295	343302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_013967	GTCG	2	8	354587	354594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_013967	CAGG	2	8	355003	355010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_013967	CGCC	2	8	356576	356583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
160	NC_013967	GCGA	2	8	356639	356646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_013967	ACCG	2	8	359279	359286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013967	ACCC	2	8	359301	359308	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
163	NC_013967	ACCC	5	20	359311	359330	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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165	NC_013967	CTCC	2	8	361500	361507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
166	NC_013967	CCCT	2	8	363425	363432	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_013967	GCCA	2	8	363470	363477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_013967	TCGG	2	8	365271	365278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_013967	GGTC	2	8	373036	373043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_013967	ATAG	2	8	373135	373142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013967	GCTT	2	8	373181	373188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_013967	GGCG	2	8	389834	389841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
177	NC_013967	ACGC	2	8	389927	389934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
178	NC_013967	GGCG	2	8	390366	390373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
179	NC_013967	GCCG	2	8	390423	390430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_013967	GCTC	2	8	391298	391305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_013967	CCGG	2	8	391322	391329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_013967	GGGC	2	8	391473	391480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_013967	GCGG	2	8	394707	394714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
186	NC_013967	CTGC	2	8	398551	398558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_013967	TCTT	2	8	399513	399520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_013967	CCTT	2	8	408459	408466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_013967	TTGG	2	8	409346	409353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013967	CGGT	2	8	1063640	1063647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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