MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 6998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	GACC	2	8	668	675	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
2	NC_013967	CCGA	2	8	1092	1099	25 %	0 %	25 %	50 %	292654179
3	NC_013967	CGGC	2	8	1501	1508	0 %	0 %	50 %	50 %	292654179
4	NC_013967	GTCC	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	292654179
5	NC_013967	GGGC	2	8	2167	2174	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
6	NC_013967	ACCC	2	8	2220	2227	25 %	0 %	0 %	75 %	292654180
7	NC_013967	GGGC	2	8	2837	2844	0 %	0 %	75 %	25 %	292654180
8	NC_013967	GCCG	2	8	4213	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	292654181
9	NC_013967	GACC	2	8	5141	5148	25 %	0 %	25 %	50 %	292654182
10	NC_013967	CCGC	2	8	5155	5162	0 %	0 %	25 %	75 %	292654182
11	NC_013967	GCGG	2	8	5174	5181	0 %	0 %	75 %	25 %	292654182
12	NC_013967	CTAC	2	8	5237	5244	25 %	25 %	0 %	50 %	292654182
13	NC_013967	ATGG	2	8	6338	6345	25 %	25 %	50 %	0 %	292654183
14	NC_013967	CCCG	2	8	6512	6519	0 %	0 %	25 %	75 %	292654183
15	NC_013967	CGAG	2	8	6598	6605	25 %	0 %	50 %	25 %	292654183
16	NC_013967	GCGA	2	8	6711	6718	25 %	0 %	50 %	25 %	292654183
17	NC_013967	CTCG	2	8	7499	7506	0 %	25 %	25 %	50 %	292654185
18	NC_013967	GCGA	2	8	8255	8262	25 %	0 %	50 %	25 %	292654185
19	NC_013967	ACCG	2	8	8269	8276	25 %	0 %	25 %	50 %	292654185
20	NC_013967	CGCC	2	8	9285	9292	0 %	0 %	25 %	75 %	292654187
21	NC_013967	GACC	2	8	9805	9812	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
22	NC_013967	ACCG	2	8	9874	9881	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
23	NC_013967	ACCG	2	8	10025	10032	25 %	0 %	25 %	50 %	292654187
24	NC_013967	CGGC	2	8	10125	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	292654187
25	NC_013967	GGCC	2	8	10289	10296	0 %	0 %	50 %	50 %	292654188
26	NC_013967	GTCG	2	8	10823	10830	0 %	25 %	50 %	25 %	292654188
27	NC_013967	TACA	2	8	11524	11531	50 %	25 %	0 %	25 %	292654189
28	NC_013967	CGGC	2	8	13703	13710	0 %	0 %	50 %	50 %	292654191
29	NC_013967	CGAG	2	8	14106	14113	25 %	0 %	50 %	25 %	292654191
30	NC_013967	TCCA	2	8	14462	14469	25 %	25 %	0 %	50 %	292654191
31	NC_013967	CGAG	2	8	14487	14494	25 %	0 %	50 %	25 %	292654191
32	NC_013967	CCGT	2	8	14753	14760	0 %	25 %	25 %	50 %	292654191
33	NC_013967	GGCC	2	8	14763	14770	0 %	0 %	50 %	50 %	292654191
34	NC_013967	GACC	2	8	15748	15755	25 %	0 %	25 %	50 %	292654193
35	NC_013967	CGAG	2	8	15924	15931	25 %	0 %	50 %	25 %	292654193
36	NC_013967	GTCG	2	8	16336	16343	0 %	25 %	50 %	25 %	292654193
37	NC_013967	CGGT	2	8	16806	16813	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
38	NC_013967	CGGT	2	8	16842	16849	0 %	25 %	50 %	25 %	292654194
39	NC_013967	CGAC	2	8	18210	18217	25 %	0 %	25 %	50 %	292654196
40	NC_013967	TCGG	2	8	19242	19249	0 %	25 %	50 %	25 %	292654197
41	NC_013967	CGAC	2	8	19333	19340	25 %	0 %	25 %	50 %	292654197
42	NC_013967	CGAG	2	8	19793	19800	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
43	NC_013967	GCCG	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
44	NC_013967	GGAC	2	8	20342	20349	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
45	NC_013967	GCTG	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	292654198
46	NC_013967	CGAG	2	8	20657	20664	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
47	NC_013967	GAGC	2	8	20901	20908	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
48	NC_013967	CTCG	2	8	21039	21046	0 %	25 %	25 %	50 %	292654198
49	NC_013967	GCCG	2	8	21077	21084	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
50	NC_013967	GGTC	2	8	21584	21591	0 %	25 %	50 %	25 %	292654199
51	NC_013967	CGAG	2	8	21869	21876	25 %	0 %	50 %	25 %	292654199
52	NC_013967	CGGT	2	8	22859	22866	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
53	NC_013967	CGGT	2	8	22879	22886	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
54	NC_013967	GTCG	2	8	23295	23302	0 %	25 %	50 %	25 %	292654200
55	NC_013967	GTGG	2	8	23335	23342	0 %	25 %	75 %	0 %	292654200
56	NC_013967	CGGC	2	8	23772	23779	0 %	0 %	50 %	50 %	292654201
57	NC_013967	CTCG	2	8	23809	23816	0 %	25 %	25 %	50 %	292654201
58	NC_013967	TCGC	2	8	24956	24963	0 %	25 %	25 %	50 %	292654202
59	NC_013967	CGAG	2	8	25984	25991	25 %	0 %	50 %	25 %	292654203
60	NC_013967	CGAG	2	8	26008	26015	25 %	0 %	50 %	25 %	292654203
61	NC_013967	GTCG	2	8	26069	26076	0 %	25 %	50 %	25 %	292654203
62	NC_013967	ACGA	2	8	26427	26434	50 %	0 %	25 %	25 %	292654203
63	NC_013967	CGAA	2	8	26578	26585	50 %	0 %	25 %	25 %	292654203
64	NC_013967	CGGC	2	8	26659	26666	0 %	0 %	50 %	50 %	292654203
65	NC_013967	CGAC	2	8	26668	26675	25 %	0 %	25 %	50 %	292654203
66	NC_013967	CCTG	2	8	26773	26780	0 %	25 %	25 %	50 %	292654203
67	NC_013967	GTGG	2	8	28378	28385	0 %	25 %	75 %	0 %	292654206
68	NC_013967	CTCG	2	8	29302	29309	0 %	25 %	25 %	50 %	292654206
69	NC_013967	CCGC	2	8	29347	29354	0 %	0 %	25 %	75 %	292654206
70	NC_013967	GACG	2	8	29893	29900	25 %	0 %	50 %	25 %	292654206
71	NC_013967	CGGC	2	8	30321	30328	0 %	0 %	50 %	50 %	292654207
72	NC_013967	TCGT	2	8	31547	31554	0 %	50 %	25 %	25 %	292654209
73	NC_013967	CCGA	2	8	32297	32304	25 %	0 %	25 %	50 %	292654210
74	NC_013967	CGGC	2	8	32421	32428	0 %	0 %	50 %	50 %	292654210
75	NC_013967	CTCG	2	8	32921	32928	0 %	25 %	25 %	50 %	292654211
76	NC_013967	TCCA	2	8	33108	33115	25 %	25 %	0 %	50 %	292654211
77	NC_013967	CCGC	2	8	33125	33132	0 %	0 %	25 %	75 %	292654211
78	NC_013967	CGAC	2	8	33217	33224	25 %	0 %	25 %	50 %	292654211
79	NC_013967	ACGT	2	8	33918	33925	25 %	25 %	25 %	25 %	292654212
80	NC_013967	CGAA	2	8	34983	34990	50 %	0 %	25 %	25 %	292654213
81	NC_013967	CGCC	2	8	35260	35267	0 %	0 %	25 %	75 %	292654214
82	NC_013967	CGCT	2	8	35580	35587	0 %	25 %	25 %	50 %	292654214
83	NC_013967	GCGG	2	8	35979	35986	0 %	0 %	75 %	25 %	292654215
84	NC_013967	CCGC	2	8	36235	36242	0 %	0 %	25 %	75 %	292654215
85	NC_013967	TCCG	2	8	36788	36795	0 %	25 %	25 %	50 %	292654215
86	NC_013967	TCCG	2	8	39394	39401	0 %	25 %	25 %	50 %	292654216
87	NC_013967	GCTC	2	8	39659	39666	0 %	25 %	25 %	50 %	292654217
88	NC_013967	CGGG	2	8	39749	39756	0 %	0 %	75 %	25 %	292654217
89	NC_013967	CGAG	2	8	40161	40168	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
90	NC_013967	GGCA	2	8	40217	40224	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
91	NC_013967	GTCG	2	8	40378	40385	0 %	25 %	50 %	25 %	292654218
92	NC_013967	ACGA	2	8	40499	40506	50 %	0 %	25 %	25 %	292654218
93	NC_013967	GTGG	2	8	40975	40982	0 %	25 %	75 %	0 %	292654218
94	NC_013967	GTTC	2	8	41150	41157	0 %	50 %	25 %	25 %	292654219
95	NC_013967	CGCC	2	8	43908	43915	0 %	0 %	25 %	75 %	292654221
96	NC_013967	ACGT	2	8	44027	44034	25 %	25 %	25 %	25 %	292654221
97	NC_013967	CGAC	2	8	44580	44587	25 %	0 %	25 %	50 %	292654222
98	NC_013967	CGGC	2	8	46425	46432	0 %	0 %	50 %	50 %	292654224
99	NC_013967	CGAG	2	8	46853	46860	25 %	0 %	50 %	25 %	292654225
100	NC_013967	CCGA	2	8	46951	46958	25 %	0 %	25 %	50 %	292654225
101	NC_013967	TCGG	2	8	46978	46985	0 %	25 %	50 %	25 %	292654225
102	NC_013967	GCGG	2	8	47094	47101	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
103	NC_013967	GGCC	2	8	47141	47148	0 %	0 %	50 %	50 %	292654225
104	NC_013967	GGCG	2	8	47723	47730	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
105	NC_013967	AGCG	2	8	47868	47875	25 %	0 %	50 %	25 %	292654225
106	NC_013967	GCGG	2	8	47949	47956	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
107	NC_013967	TCGC	2	8	48085	48092	0 %	25 %	25 %	50 %	292654225
108	NC_013967	CGGG	2	8	48205	48212	0 %	0 %	75 %	25 %	292654225
109	NC_013967	CGGG	2	8	48466	48473	0 %	0 %	75 %	25 %	292654226
110	NC_013967	GGTC	2	8	48888	48895	0 %	25 %	50 %	25 %	292654226
111	NC_013967	CGAG	2	8	50164	50171	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
112	NC_013967	GCGA	2	8	50625	50632	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
113	NC_013967	CGAG	2	8	50671	50678	25 %	0 %	50 %	25 %	292654228
114	NC_013967	GACG	2	8	51325	51332	25 %	0 %	50 %	25 %	292654229
115	NC_013967	CACC	2	8	51961	51968	25 %	0 %	0 %	75 %	292654230
116	NC_013967	CCGA	2	8	52550	52557	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
117	NC_013967	GCCG	2	8	52589	52596	0 %	0 %	50 %	50 %	292654231
118	NC_013967	CGAC	2	8	52684	52691	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
119	NC_013967	CGAC	2	8	53680	53687	25 %	0 %	25 %	50 %	292654231
120	NC_013967	CTCA	2	8	54104	54111	25 %	25 %	0 %	50 %	292654231
121	NC_013967	ACGT	2	8	54532	54539	25 %	25 %	25 %	25 %	292654232
122	NC_013967	TCGC	2	8	55618	55625	0 %	25 %	25 %	50 %	292654233
123	NC_013967	AGGT	2	8	56323	56330	25 %	25 %	50 %	0 %	292654235
124	NC_013967	GCGT	2	8	56722	56729	0 %	25 %	50 %	25 %	292654235
125	NC_013967	CAGC	2	8	60175	60182	25 %	0 %	25 %	50 %	292654238
126	NC_013967	CGAG	2	8	60303	60310	25 %	0 %	50 %	25 %	292654238
127	NC_013967	ACGA	2	8	60458	60465	50 %	0 %	25 %	25 %	292654238
128	NC_013967	GCGG	2	8	60527	60534	0 %	0 %	75 %	25 %	292654238
129	NC_013967	GCCA	2	8	60629	60636	25 %	0 %	25 %	50 %	292654238
130	NC_013967	GTCG	2	8	61521	61528	0 %	25 %	50 %	25 %	292654239
131	NC_013967	GGCG	2	8	61865	61872	0 %	0 %	75 %	25 %	292654239
132	NC_013967	TCGC	2	8	61924	61931	0 %	25 %	25 %	50 %	292654239
133	NC_013967	ACGG	2	8	62139	62146	25 %	0 %	50 %	25 %	292654239
134	NC_013967	GTCG	2	8	62886	62893	0 %	25 %	50 %	25 %	292654239
135	NC_013967	CGCA	2	8	63890	63897	25 %	0 %	25 %	50 %	292654241
136	NC_013967	GACC	2	8	64017	64024	25 %	0 %	25 %	50 %	292654241
137	NC_013967	CGCT	2	8	64527	64534	0 %	25 %	25 %	50 %	292654242
138	NC_013967	CCGC	2	8	64750	64757	0 %	0 %	25 %	75 %	292654242
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