MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	TACT	2	8	353	360	25 %	50 %	0 %	25 %	292653567
2	NC_013966	CGCC	2	8	892	899	0 %	0 %	25 %	75 %	292653567
3	NC_013966	ACCG	2	8	950	957	25 %	0 %	25 %	50 %	292653567
4	NC_013966	GTAG	2	8	1399	1406	25 %	25 %	50 %	0 %	292653567
5	NC_013966	TCGG	2	8	1541	1548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013966	GTCG	2	8	2163	2170	0 %	25 %	50 %	25 %	292653568
7	NC_013966	GGAG	2	8	3376	3383	25 %	0 %	75 %	0 %	292653569
8	NC_013966	TCGC	2	8	3718	3725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013966	GTGG	2	8	4259	4266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013966	ACCC	2	8	4382	4389	25 %	0 %	0 %	75 %	292653570
11	NC_013966	GACG	2	8	4738	4745	25 %	0 %	50 %	25 %	292653570
12	NC_013966	CTCC	2	8	4879	4886	0 %	25 %	0 %	75 %	292653570
13	NC_013966	CGCC	2	8	5437	5444	0 %	0 %	25 %	75 %	292653570
14	NC_013966	CTTC	2	8	5971	5978	0 %	50 %	0 %	50 %	292653571
15	NC_013966	ACGG	2	8	5983	5990	25 %	0 %	50 %	25 %	292653571
16	NC_013966	TCCC	2	8	6066	6073	0 %	25 %	0 %	75 %	292653571
17	NC_013966	ACCC	2	8	6203	6210	25 %	0 %	0 %	75 %	292653571
18	NC_013966	AACG	2	8	6341	6348	50 %	0 %	25 %	25 %	292653571
19	NC_013966	CTGT	2	8	6504	6511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013966	TCGC	2	8	7727	7734	0 %	25 %	25 %	50 %	292653572
21	NC_013966	GCTG	2	8	7935	7942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013966	ACGA	2	8	8002	8009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013966	AAAC	2	8	8067	8074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013966	CACG	2	8	8669	8676	25 %	0 %	25 %	50 %	292653573
25	NC_013966	GCTC	2	8	8769	8776	0 %	25 %	25 %	50 %	292653573
26	NC_013966	TGGC	2	8	9036	9043	0 %	25 %	50 %	25 %	292653573
27	NC_013966	TCGC	2	8	9267	9274	0 %	25 %	25 %	50 %	292653573
28	NC_013966	GTCG	2	8	9687	9694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013966	TCAG	2	8	10282	10289	25 %	25 %	25 %	25 %	292653574
30	NC_013966	ACGT	2	8	11045	11052	25 %	25 %	25 %	25 %	292653575
31	NC_013966	GCTC	2	8	11852	11859	0 %	25 %	25 %	50 %	292653576
32	NC_013966	GCCC	2	8	12775	12782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013966	GCTC	2	8	13141	13148	0 %	25 %	25 %	50 %	292653577
34	NC_013966	CGAA	2	8	13245	13252	50 %	0 %	25 %	25 %	292653577
35	NC_013966	GCGG	2	8	13736	13743	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013966	TTCC	2	8	13892	13899	0 %	50 %	0 %	50 %	292653578
37	NC_013966	CTGA	2	8	14387	14394	25 %	25 %	25 %	25 %	292653578
38	NC_013966	GCCG	2	8	14822	14829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013966	CCCG	2	8	14902	14909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_013966	GCAC	2	8	14963	14970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013966	TCGC	2	8	14996	15003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013966	GACC	2	8	15004	15011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013966	ACCG	2	8	15549	15556	25 %	0 %	25 %	50 %	292653579
44	NC_013966	GATC	2	8	15977	15984	25 %	25 %	25 %	25 %	292653579
45	NC_013966	CGGT	2	8	17000	17007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013966	TGTC	2	8	17719	17726	0 %	50 %	25 %	25 %	292653581
47	NC_013966	CGGT	2	8	17831	17838	0 %	25 %	50 %	25 %	292653581
48	NC_013966	CGAG	2	8	17975	17982	25 %	0 %	50 %	25 %	292653581
49	NC_013966	AGCA	2	8	18660	18667	50 %	0 %	25 %	25 %	292653582
50	NC_013966	ACGA	2	8	18763	18770	50 %	0 %	25 %	25 %	292653583
51	NC_013966	ACCG	2	8	19053	19060	25 %	0 %	25 %	50 %	292653583
52	NC_013966	ACGC	2	8	19062	19069	25 %	0 %	25 %	50 %	292653583
53	NC_013966	CAAT	2	8	19126	19133	50 %	25 %	0 %	25 %	292653583
54	NC_013966	CAAG	2	8	19763	19770	50 %	0 %	25 %	25 %	292653583
55	NC_013966	ACGA	2	8	19785	19792	50 %	0 %	25 %	25 %	292653583
56	NC_013966	GTAG	2	8	20065	20072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013966	CGAG	2	8	20206	20213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013966	GCAC	2	8	20352	20359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013966	TCGC	2	8	20385	20392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013966	GACC	2	8	20393	20400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013966	CGGG	2	8	20649	20656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013966	TCGC	2	8	20700	20707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013966	GCGA	2	8	20732	20739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013966	GTCG	2	8	20758	20765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013966	GCGG	2	8	21206	21213	0 %	0 %	75 %	25 %	292653584
66	NC_013966	CGGT	2	8	21719	21726	0 %	25 %	50 %	25 %	292653584
67	NC_013966	GACC	2	8	21772	21779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013966	AGCA	2	8	22153	22160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013966	CGGC	2	8	22632	22639	0 %	0 %	50 %	50 %	292653585
70	NC_013966	GTGG	2	8	22851	22858	0 %	25 %	75 %	0 %	292653585
71	NC_013966	CGGT	2	8	23332	23339	0 %	25 %	50 %	25 %	292653586
72	NC_013966	GGTC	2	8	23731	23738	0 %	25 %	50 %	25 %	292653587
73	NC_013966	TTCT	2	8	24645	24652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013966	TCCG	2	8	24684	24691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013966	GTTG	2	8	25472	25479	0 %	50 %	50 %	0 %	292653589
76	NC_013966	TCGA	2	8	25633	25640	25 %	25 %	25 %	25 %	292653589
77	NC_013966	ACGG	2	8	25910	25917	25 %	0 %	50 %	25 %	292653590
78	NC_013966	GGCG	2	8	26000	26007	0 %	0 %	75 %	25 %	292653590
79	NC_013966	GAAC	2	8	26026	26033	50 %	0 %	25 %	25 %	292653590
80	NC_013966	GAAC	2	8	26109	26116	50 %	0 %	25 %	25 %	292653590
81	NC_013966	CTCG	2	8	26140	26147	0 %	25 %	25 %	50 %	292653590
82	NC_013966	GCCT	2	8	26626	26633	0 %	25 %	25 %	50 %	292653590
83	NC_013966	CTGC	2	8	27158	27165	0 %	25 %	25 %	50 %	292653591
84	NC_013966	AAGA	2	8	27228	27235	75 %	0 %	25 %	0 %	292653591
85	NC_013966	GTGC	2	8	27328	27335	0 %	25 %	50 %	25 %	292653592
86	NC_013966	ACCG	2	8	27705	27712	25 %	0 %	25 %	50 %	292653592
87	NC_013966	GCCG	2	8	28322	28329	0 %	0 %	50 %	50 %	292653593
88	NC_013966	CGAC	2	8	28711	28718	25 %	0 %	25 %	50 %	292653593
89	NC_013966	CAAG	2	8	28979	28986	50 %	0 %	25 %	25 %	292653594
90	NC_013966	CGTC	2	8	29917	29924	0 %	25 %	25 %	50 %	292653596
91	NC_013966	GTCG	2	8	29925	29932	0 %	25 %	50 %	25 %	292653596
92	NC_013966	GCAA	2	8	30575	30582	50 %	0 %	25 %	25 %	292653597
93	NC_013966	GAGC	3	12	30905	30916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013966	CGAC	2	8	31029	31036	25 %	0 %	25 %	50 %	292653598
95	NC_013966	GTGG	2	8	31187	31194	0 %	25 %	75 %	0 %	292653598
96	NC_013966	CTCG	2	8	31288	31295	0 %	25 %	25 %	50 %	292653598
97	NC_013966	GAGC	2	8	32627	32634	25 %	0 %	50 %	25 %	292653600
98	NC_013966	GCCG	2	8	32721	32728	0 %	0 %	50 %	50 %	292653600
99	NC_013966	GTTC	2	8	33004	33011	0 %	50 %	25 %	25 %	292653600
100	NC_013966	CCCG	2	8	33046	33053	0 %	0 %	25 %	75 %	292653600
101	NC_013966	CTAC	2	8	33096	33103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013966	GAAC	3	12	33594	33605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013966	TCAG	2	8	33606	33613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013966	AGCC	2	8	34124	34131	25 %	0 %	25 %	50 %	292653601
105	NC_013966	AAGA	2	8	34344	34351	75 %	0 %	25 %	0 %	292653601
106	NC_013966	ACTG	2	8	34776	34783	25 %	25 %	25 %	25 %	292653602
107	NC_013966	GCGT	2	8	35125	35132	0 %	25 %	50 %	25 %	292653603
108	NC_013966	TAAT	2	8	35472	35479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013966	TCCT	2	8	35705	35712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013966	TGGA	2	8	36647	36654	25 %	25 %	50 %	0 %	292653604
111	NC_013966	GTGG	2	8	36731	36738	0 %	25 %	75 %	0 %	292653604
112	NC_013966	TCAA	2	8	36781	36788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013966	ACTC	2	8	36819	36826	25 %	25 %	0 %	50 %	292653605
114	NC_013966	TGAG	2	8	36831	36838	25 %	25 %	50 %	0 %	292653605
115	NC_013966	TGGG	2	8	37069	37076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013966	ACTC	2	8	37546	37553	25 %	25 %	0 %	50 %	292653607
117	NC_013966	ACCG	2	8	38644	38651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013966	GCAG	2	8	38879	38886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013966	GAAG	2	8	39031	39038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013966	GGGC	2	8	39260	39267	0 %	0 %	75 %	25 %	292653608
121	NC_013966	CCTG	2	8	39461	39468	0 %	25 %	25 %	50 %	292653608
122	NC_013966	GTCA	2	8	39820	39827	25 %	25 %	25 %	25 %	292653608
123	NC_013966	GCGA	2	8	40285	40292	25 %	0 %	50 %	25 %	292653609
124	NC_013966	AGCG	2	8	41788	41795	25 %	0 %	50 %	25 %	292653611
125	NC_013966	GCCA	2	8	42066	42073	25 %	0 %	25 %	50 %	292653611
126	NC_013966	GCAA	2	8	42625	42632	50 %	0 %	25 %	25 %	292653612
127	NC_013966	GCGG	2	8	43541	43548	0 %	0 %	75 %	25 %	292653613
128	NC_013966	TTCT	2	8	44011	44018	0 %	75 %	0 %	25 %	292653614
129	NC_013966	CAGT	2	8	44162	44169	25 %	25 %	25 %	25 %	292653614
130	NC_013966	ACTC	2	8	44512	44519	25 %	25 %	0 %	50 %	292653614
131	NC_013966	GTAC	2	8	45065	45072	25 %	25 %	25 %	25 %	292653614
132	NC_013966	GAAC	2	8	45105	45112	50 %	0 %	25 %	25 %	292653614
133	NC_013966	CGAC	2	8	45403	45410	25 %	0 %	25 %	50 %	292653615
134	NC_013966	CCTG	2	8	45625	45632	0 %	25 %	25 %	50 %	292653615
135	NC_013966	CGTT	2	8	45789	45796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013966	CCGT	2	8	46251	46258	0 %	25 %	25 %	50 %	292653616
137	NC_013966	ACCC	2	8	46293	46300	25 %	0 %	0 %	75 %	292653617
138	NC_013966	CGAC	2	8	46325	46332	25 %	0 %	25 %	50 %	292653617
139	NC_013966	TCAC	2	8	46387	46394	25 %	25 %	0 %	50 %	292653617
140	NC_013966	CGAA	2	8	46644	46651	50 %	0 %	25 %	25 %	292653618
141	NC_013966	GCGA	2	8	46948	46955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013966	CGGG	2	8	47805	47812	0 %	0 %	75 %	25 %	292653621
143	NC_013966	CGAG	2	8	47875	47882	25 %	0 %	50 %	25 %	292653621
144	NC_013966	CGTT	2	8	48207	48214	0 %	50 %	25 %	25 %	292653621
145	NC_013966	CGTT	2	8	48640	48647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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