MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 10289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	GTA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653567
2	NC_013966	CAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653567
3	NC_013966	CCG	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653567
4	NC_013966	ACG	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
5	NC_013966	CGT	2	6	409	414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653567
6	NC_013966	ACG	2	6	503	508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
7	NC_013966	CGA	2	6	553	558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
8	NC_013966	GCG	2	6	561	566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653567
9	NC_013966	ATC	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653567
10	NC_013966	CGA	2	6	586	591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
11	NC_013966	ACG	2	6	606	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
12	NC_013966	CGA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
13	NC_013966	CGA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
14	NC_013966	TGA	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653567
15	NC_013966	CGA	3	9	940	948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
16	NC_013966	GAA	2	6	962	967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653567
17	NC_013966	AGG	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653567
18	NC_013966	CGG	2	6	1169	1174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653567
19	NC_013966	ACC	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653567
20	NC_013966	CGG	2	6	1246	1251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653567
21	NC_013966	TCG	2	6	1323	1328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653567
22	NC_013966	CGA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653567
23	NC_013966	CGA	2	6	2037	2042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653568
24	NC_013966	TTC	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653568
25	NC_013966	CGG	2	6	2058	2063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653568
26	NC_013966	CGT	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
27	NC_013966	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
28	NC_013966	CGG	2	6	2123	2128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653568
29	NC_013966	CGT	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
30	NC_013966	GTC	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
31	NC_013966	GCC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653568
32	NC_013966	CGG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653568
33	NC_013966	TCG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
34	NC_013966	CGT	2	6	2325	2330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
35	NC_013966	GTG	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653568
36	NC_013966	TCG	3	9	2507	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
37	NC_013966	TCG	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653568
38	NC_013966	CGA	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653569
39	NC_013966	GTC	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
40	NC_013966	CGG	2	6	2765	2770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653569
41	NC_013966	GAT	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653569
42	NC_013966	GTT	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653569
43	NC_013966	TGT	2	6	2898	2903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653569
44	NC_013966	GAG	2	6	2945	2950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653569
45	NC_013966	GAC	3	9	2954	2962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653569
46	NC_013966	CGG	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653569
47	NC_013966	CGA	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653569
48	NC_013966	CGA	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653569
49	NC_013966	GTC	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
50	NC_013966	GTC	3	9	3194	3202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
51	NC_013966	GTC	2	6	3242	3247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
52	NC_013966	CTG	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
53	NC_013966	CCA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653569
54	NC_013966	CGT	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
55	NC_013966	TCG	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653569
56	NC_013966	CAG	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
57	NC_013966	GGA	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
58	NC_013966	ACG	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
59	NC_013966	CAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653570
60	NC_013966	CTA	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653570
61	NC_013966	ACG	3	9	4695	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
62	NC_013966	GGA	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
63	NC_013966	CGG	2	6	4761	4766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653570
64	NC_013966	GAG	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
65	NC_013966	CGC	2	6	4804	4809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653570
66	NC_013966	CCT	2	6	4981	4986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653570
67	NC_013966	GAC	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
68	NC_013966	CGG	2	6	5080	5085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653570
69	NC_013966	ACG	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
70	NC_013966	GGC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653570
71	NC_013966	GCG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653570
72	NC_013966	CCG	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653570
73	NC_013966	GGA	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
74	NC_013966	CCG	2	6	5426	5431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653570
75	NC_013966	GGA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
76	NC_013966	GGA	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
77	NC_013966	CTG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653570
78	NC_013966	GAC	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653570
79	NC_013966	GGC	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653570
80	NC_013966	GAG	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653570
81	NC_013966	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653571
82	NC_013966	CTA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653571
83	NC_013966	CTT	2	6	5917	5922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653571
84	NC_013966	AAC	2	6	5924	5929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653571
85	NC_013966	GAA	2	6	5935	5940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653571
86	NC_013966	CAC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653571
87	NC_013966	TCG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653571
88	NC_013966	GAC	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653571
89	NC_013966	TTC	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653571
90	NC_013966	ACG	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653571
91	NC_013966	TGA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653572
92	NC_013966	GCT	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653572
93	NC_013966	CGC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653572
94	NC_013966	GAC	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653572
95	NC_013966	GTT	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653572
96	NC_013966	CGG	2	6	7180	7185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653572
97	NC_013966	TCG	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653572
98	NC_013966	CTG	2	6	7511	7516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653572
99	NC_013966	GAC	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653572
100	NC_013966	CAT	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653572
101	NC_013966	ATC	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653572
102	NC_013966	TGA	3	9	7611	7619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653572
103	NC_013966	GCC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653572
104	NC_013966	TCG	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653572
105	NC_013966	CTA	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653572
106	NC_013966	GGA	2	6	8152	8157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653573
107	NC_013966	CGA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653573
108	NC_013966	TCC	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653573
109	NC_013966	ACT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653573
110	NC_013966	GAC	2	6	8282	8287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653573
111	NC_013966	ACA	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653573
112	NC_013966	CGT	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653573
113	NC_013966	CGA	2	6	8812	8817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653573
114	NC_013966	ATC	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653573
115	NC_013966	CAA	2	6	8864	8869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653573
116	NC_013966	GAA	2	6	8969	8974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653573
117	NC_013966	CGG	2	6	9191	9196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653573
118	NC_013966	ATT	2	6	9972	9977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292653574
119	NC_013966	TGA	2	6	10018	10023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653574
120	NC_013966	GAA	2	6	10043	10048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653574
121	NC_013966	TGA	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653574
122	NC_013966	TGA	2	6	10351	10356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653574
123	NC_013966	TAC	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653574
124	NC_013966	GGA	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653574
125	NC_013966	ACG	2	6	10494	10499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653574
126	NC_013966	CGT	2	6	10569	10574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653574
127	NC_013966	TCG	2	6	10791	10796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653575
128	NC_013966	GCT	2	6	10877	10882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653575
129	NC_013966	CGT	2	6	10999	11004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653575
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132	NC_013966	CTG	2	6	11293	11298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653575
133	NC_013966	TTC	2	6	11356	11361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653575
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241	NC_013966	GGC	2	6	21281	21286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653584
242	NC_013966	GCG	2	6	21339	21344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653584
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247	NC_013966	GAG	2	6	21414	21419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653584
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249	NC_013966	AAG	2	6	21478	21483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653584
250	NC_013966	GAC	2	6	21558	21563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653584
251	NC_013966	GAG	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653584
252	NC_013966	GCG	2	6	21645	21650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653584
253	NC_013966	CGT	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653585
254	NC_013966	TGA	2	6	22370	22375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653585
255	NC_013966	CAT	3	9	22449	22457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653585
256	NC_013966	TTC	2	6	22543	22548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653585
257	NC_013966	TCC	2	6	22574	22579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653585
258	NC_013966	TCG	2	6	22619	22624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653585
259	NC_013966	CCG	2	6	22641	22646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653585
260	NC_013966	GAC	2	6	22741	22746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653585
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263	NC_013966	GAT	2	6	22885	22890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653585
264	NC_013966	CTG	2	6	22903	22908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653585
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266	NC_013966	CAT	2	6	23137	23142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653586
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372	NC_013966	GTG	2	6	30019	30024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653596
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375	NC_013966	CGT	2	6	30201	30206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653596
376	NC_013966	GAC	2	6	30441	30446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653597
377	NC_013966	CGA	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653597
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495	NC_013966	GGC	2	6	39534	39539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653608
496	NC_013966	GCT	2	6	39550	39555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653608
497	NC_013966	CAG	2	6	39562	39567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653608
498	NC_013966	CGT	2	6	39581	39586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653608
499	NC_013966	GGA	2	6	39597	39602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653608
500	NC_013966	TCG	2	6	39659	39664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653608

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