MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	GT	3	6	62	67	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013966	TA	3	6	79	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013966	GA	3	6	4077	4082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013966	CA	3	6	9558	9563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013966	TG	3	6	9605	9610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013966	CG	3	6	9763	9768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013966	TG	4	8	10716	10723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013966	AT	3	6	12541	12546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013966	GC	3	6	12646	12651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013966	GT	3	6	12761	12766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013966	GA	3	6	13693	13698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013966	GC	3	6	14839	14844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013966	GC	3	6	16528	16533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013966	TG	3	6	16794	16799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013966	TC	3	6	16933	16938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013966	AG	3	6	18383	18388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013966	GC	3	6	18724	18729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013966	GA	3	6	20122	20127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013966	CG	3	6	20541	20546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013966	GC	3	6	20660	20665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013966	GC	3	6	20692	20697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013966	GC	3	6	20742	20747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013966	GC	4	8	21822	21829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013966	GA	3	6	27245	27250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013966	AT	3	6	27848	27853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013966	AG	5	10	31840	31849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013966	CT	3	6	33186	33191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013966	GA	3	6	37401	37406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013966	AT	3	6	42178	42183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013966	TA	3	6	42334	42339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013966	AG	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013966	AG	3	6	46273	46278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013966	AG	3	6	48700	48705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013966	GA	3	6	49779	49784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013966	CT	3	6	49820	49825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013966	AT	3	6	57600	57605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013966	CA	3	6	61334	61339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013966	AG	3	6	62793	62798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013966	GA	3	6	66364	66369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013966	AC	3	6	70829	70834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013966	CT	3	6	70859	70864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013966	GA	3	6	79030	79035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013966	CA	3	6	80357	80362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013966	AG	3	6	80594	80599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013966	GA	3	6	80934	80939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013966	AT	3	6	83304	83309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013966	TG	3	6	88502	88507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013966	TG	3	6	94782	94787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013966	CT	3	6	94798	94803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013966	GA	3	6	94959	94964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013966	AT	3	6	96141	96146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013966	AC	3	6	96267	96272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013966	AT	3	6	97083	97088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013966	AC	3	6	97248	97253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013966	GC	3	6	99846	99851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013966	CG	3	6	99872	99877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013966	AT	3	6	103193	103198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013966	AC	3	6	103966	103971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013966	AC	3	6	105061	105066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013966	CG	3	6	105400	105405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013966	CA	3	6	106613	106618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013966	GC	3	6	107466	107471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013966	GC	3	6	107475	107480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013966	CA	3	6	110345	110350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013966	GA	3	6	112237	112242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013966	GT	3	6	112563	112568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013966	AC	4	8	112632	112639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013966	GC	3	6	112680	112685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013966	TC	3	6	115594	115599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013966	CA	3	6	117246	117251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013966	CA	3	6	119575	119580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013966	AG	3	6	120470	120475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013966	AC	3	6	120863	120868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013966	GA	3	6	121196	121201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013966	TC	3	6	122774	122779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013966	CT	3	6	124335	124340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013966	CA	3	6	124358	124363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013966	TA	3	6	124587	124592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013966	TC	3	6	126131	126136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013966	AT	3	6	127647	127652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013966	GA	3	6	129080	129085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013966	TG	3	6	129194	129199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013966	CT	3	6	129923	129928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013966	GA	3	6	130208	130213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013966	TC	3	6	130456	130461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013966	AG	3	6	132158	132163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013966	TG	3	6	132729	132734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013966	AT	3	6	132914	132919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013966	CA	3	6	133037	133042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013966	AT	3	6	133095	133100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013966	CG	3	6	135059	135064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013966	GC	3	6	136068	136073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013966	GC	3	6	136077	136082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013966	TA	3	6	136986	136991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013966	TC	3	6	138015	138020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013966	GC	3	6	138473	138478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013966	AG	4	8	139176	139183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013966	CA	3	6	139302	139307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013966	TC	3	6	150564	150569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013966	AG	3	6	150787	150792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013966	GA	4	8	151007	151014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013966	AG	3	6	158039	158044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013966	GA	3	6	169346	169351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013966	TA	3	6	170152	170157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013966	GC	3	6	174288	174293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013966	GT	3	6	184882	184887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013966	CG	3	6	187093	187098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013966	CG	3	6	189023	189028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013966	GA	4	8	191502	191509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013966	GT	3	6	191571	191576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013966	CA	3	6	194620	194625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013966	CG	3	6	195779	195784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013966	AC	3	6	198693	198698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013966	GA	3	6	202675	202680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013966	GC	3	6	205335	205340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013966	TC	3	6	205764	205769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013966	GC	3	6	205928	205933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013966	AG	3	6	207405	207410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013966	GT	3	6	207607	207612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013966	CG	4	8	207796	207803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013966	CA	3	6	207924	207929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013966	AT	3	6	217873	217878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013966	TG	3	6	218551	218556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013966	GC	4	8	219748	219755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013966	CT	3	6	220927	220932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013966	GA	3	6	220992	220997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013966	CG	3	6	221089	221094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013966	AG	3	6	228431	228436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013966	TA	3	6	243541	243546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013966	CA	3	6	246384	246389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013966	TG	3	6	247006	247011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013966	CT	3	6	247427	247432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013966	GA	3	6	248695	248700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013966	GA	3	6	248729	248734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013966	AG	4	8	248792	248799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013966	AC	3	6	252812	252817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013966	TG	3	6	254705	254710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013966	AT	3	6	254876	254881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013966	GA	3	6	257192	257197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013966	AC	3	6	257224	257229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013966	GT	3	6	257367	257372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013966	GA	3	6	259169	259174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013966	AG	3	6	259307	259312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013966	AC	3	6	259319	259324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013966	CT	3	6	259529	259534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013966	GT	4	8	259626	259633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013966	TC	4	8	261076	261083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013966	CT	3	6	262810	262815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013966	AC	3	6	262881	262886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013966	CA	3	6	263376	263381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013966	TC	3	6	265554	265559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013966	AT	3	6	265665	265670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013966	AT	3	6	265807	265812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013966	TG	3	6	269108	269113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013966	GA	3	6	269173	269178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.