MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	T	6	6	5793	5798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013966	A	6	6	8224	8229	100 %	0 %	0 %	0 %	292653573
3	NC_013966	A	6	6	16197	16202	100 %	0 %	0 %	0 %	292653579
4	NC_013966	T	6	6	17185	17190	0 %	100 %	0 %	0 %	292653581
5	NC_013966	T	6	6	18698	18703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013966	C	8	8	20004	20011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_013966	T	6	6	21755	21760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013966	A	6	6	31902	31907	100 %	0 %	0 %	0 %	292653600
9	NC_013966	C	6	6	32408	32413	0 %	0 %	0 %	100 %	292653600
10	NC_013966	C	6	6	39935	39940	0 %	0 %	0 %	100 %	292653608
11	NC_013966	G	6	6	42758	42763	0 %	0 %	100 %	0 %	292653612
12	NC_013966	C	6	6	44396	44401	0 %	0 %	0 %	100 %	292653614
13	NC_013966	G	6	6	44917	44922	0 %	0 %	100 %	0 %	292653614
14	NC_013966	C	6	6	45843	45848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_013966	G	6	6	46875	46880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013966	G	6	6	51128	51133	0 %	0 %	100 %	0 %	292653623
17	NC_013966	T	6	6	52065	52070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013966	C	6	6	55184	55189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_013966	C	6	6	55269	55274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_013966	C	6	6	55311	55316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_013966	C	6	6	55354	55359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_013966	C	6	6	57097	57102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_013966	C	6	6	57269	57274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_013966	C	6	6	57410	57415	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_013966	G	6	6	57447	57452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013966	G	6	6	57773	57778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013966	G	6	6	57863	57868	0 %	0 %	100 %	0 %	292653630
28	NC_013966	G	6	6	64152	64157	0 %	0 %	100 %	0 %	292653635
29	NC_013966	C	6	6	64641	64646	0 %	0 %	0 %	100 %	292653636
30	NC_013966	G	6	6	65482	65487	0 %	0 %	100 %	0 %	292653637
31	NC_013966	G	6	6	66512	66517	0 %	0 %	100 %	0 %	292653638
32	NC_013966	T	6	6	76391	76396	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
33	NC_013966	T	6	6	76530	76535	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
34	NC_013966	T	6	6	77912	77917	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
35	NC_013966	C	6	6	80476	80481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_013966	A	6	6	80661	80666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013966	G	6	6	84194	84199	0 %	0 %	100 %	0 %	292653647
38	NC_013966	G	6	6	85610	85615	0 %	0 %	100 %	0 %	292653648
39	NC_013966	G	6	6	92983	92988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013966	T	6	6	98938	98943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013966	A	6	6	100535	100540	100 %	0 %	0 %	0 %	292653659
42	NC_013966	G	6	6	100636	100641	0 %	0 %	100 %	0 %	292653659
43	NC_013966	G	6	6	103316	103321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013966	A	6	6	105442	105447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013966	T	7	7	106035	106041	0 %	100 %	0 %	0 %	292653663
46	NC_013966	A	6	6	106868	106873	100 %	0 %	0 %	0 %	292653664
47	NC_013966	A	6	6	108511	108516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013966	A	6	6	108919	108924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013966	C	6	6	111040	111045	0 %	0 %	0 %	100 %	292653673
50	NC_013966	T	6	6	114204	114209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013966	T	6	6	116079	116084	0 %	100 %	0 %	0 %	292653680
52	NC_013966	A	6	6	124454	124459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013966	A	6	6	125472	125477	100 %	0 %	0 %	0 %	292653689
54	NC_013966	T	6	6	126383	126388	0 %	100 %	0 %	0 %	292653690
55	NC_013966	G	6	6	127710	127715	0 %	0 %	100 %	0 %	292653691
56	NC_013966	T	7	7	129599	129605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013966	A	6	6	130132	130137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013966	T	6	6	131479	131484	0 %	100 %	0 %	0 %	292653694
59	NC_013966	A	6	6	135100	135105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013966	G	6	6	135140	135145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013966	A	6	6	135469	135474	100 %	0 %	0 %	0 %	292653698
62	NC_013966	A	6	6	138051	138056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013966	A	6	6	138459	138464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013966	G	6	6	140822	140827	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013966	G	6	6	150811	150816	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013966	C	6	6	153478	153483	0 %	0 %	0 %	100 %	292653715
67	NC_013966	G	6	6	171896	171901	0 %	0 %	100 %	0 %	292653731
68	NC_013966	G	6	6	174160	174165	0 %	0 %	100 %	0 %	292653732
69	NC_013966	C	6	6	175390	175395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_013966	G	6	6	176204	176209	0 %	0 %	100 %	0 %	292653734
71	NC_013966	C	6	6	180918	180923	0 %	0 %	0 %	100 %	292653737
72	NC_013966	G	6	6	182172	182177	0 %	0 %	100 %	0 %	292653738
73	NC_013966	G	7	7	194315	194321	0 %	0 %	100 %	0 %	292653754
74	NC_013966	A	6	6	195726	195731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013966	G	6	6	204890	204895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013966	G	6	6	214701	214706	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
77	NC_013966	G	6	6	214973	214978	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
78	NC_013966	G	6	6	215560	215565	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
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80	NC_013966	C	6	6	217722	217727	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_013966	G	6	6	217728	217733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013966	G	8	8	227713	227720	0 %	0 %	100 %	0 %	292653781
83	NC_013966	C	7	7	235076	235082	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_013966	A	7	7	246109	246115	100 %	0 %	0 %	0 %	292653802
85	NC_013966	C	6	6	251689	251694	0 %	0 %	0 %	100 %	292653810
86	NC_013966	G	6	6	253578	253583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013966	T	6	6	258245	258250	0 %	100 %	0 %	0 %	292653817
88	NC_013966	C	6	6	258945	258950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_013966	A	7	7	259439	259445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013966	C	6	6	272311	272316	0 %	0 %	0 %	100 %	292653825
91	NC_013966	C	7	7	272525	272531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_013966	T	6	6	280194	280199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013966	T	6	6	286418	286423	0 %	100 %	0 %	0 %	292653836
94	NC_013966	A	6	6	289516	289521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013966	C	6	6	290577	290582	0 %	0 %	0 %	100 %	292653839
96	NC_013966	G	6	6	296434	296439	0 %	0 %	100 %	0 %	292653845
97	NC_013966	C	6	6	297299	297304	0 %	0 %	0 %	100 %	292653845
98	NC_013966	C	6	6	312213	312218	0 %	0 %	0 %	100 %	292653858
99	NC_013966	G	6	6	323910	323915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013966	G	6	6	332307	332312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013966	G	6	6	337907	337912	0 %	0 %	100 %	0 %	292653884
102	NC_013966	T	6	6	341649	341654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013966	G	6	6	343094	343099	0 %	0 %	100 %	0 %	292653890
104	NC_013966	A	6	6	346723	346728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013966	C	6	6	348388	348393	0 %	0 %	0 %	100 %	292653894
106	NC_013966	C	6	6	350252	350257	0 %	0 %	0 %	100 %	292653896
107	NC_013966	C	6	6	352580	352585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_013966	G	6	6	371321	371326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013966	C	6	6	383007	383012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_013966	T	6	6	384376	384381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013966	G	6	6	385697	385702	0 %	0 %	100 %	0 %	292653925
112	NC_013966	G	6	6	389214	389219	0 %	0 %	100 %	0 %	292653928
113	NC_013966	G	6	6	394318	394323	0 %	0 %	100 %	0 %	292653931
114	NC_013966	C	6	6	396745	396750	0 %	0 %	0 %	100 %	292653933
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116	NC_013966	G	6	6	406680	406685	0 %	0 %	100 %	0 %	292653944
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119	NC_013966	A	7	7	410927	410933	100 %	0 %	0 %	0 %	292653950
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121	NC_013966	G	6	6	414629	414634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013966	G	6	6	415003	415008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013966	C	6	6	415613	415618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_013966	G	7	7	415629	415635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013966	T	6	6	416724	416729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013966	G	6	6	417566	417571	0 %	0 %	100 %	0 %	292653955
127	NC_013966	A	6	6	422225	422230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013966	C	6	6	424577	424582	0 %	0 %	0 %	100 %	292653965
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131	NC_013966	G	6	6	441519	441524	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013966	G	6	6	442626	442631	0 %	0 %	100 %	0 %	292653980
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135	NC_013966	C	6	6	458274	458279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_013966	C	6	6	465883	465888	0 %	0 %	0 %	100 %	292654004
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138	NC_013966	C	6	6	468613	468618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_013966	C	6	6	477840	477845	0 %	0 %	0 %	100 %	292654016
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141	NC_013966	C	6	6	482249	482254	0 %	0 %	0 %	100 %	292654022
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143	NC_013966	C	6	6	489321	489326	0 %	0 %	0 %	100 %	292654027
144	NC_013966	G	6	6	491912	491917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013966	C	6	6	499586	499591	0 %	0 %	0 %	100 %	292654035
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.