MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	A	6	6	8224	8229	100 %	0 %	0 %	0 %	292653573
2	NC_013966	A	6	6	16197	16202	100 %	0 %	0 %	0 %	292653579
3	NC_013966	T	6	6	17185	17190	0 %	100 %	0 %	0 %	292653581
4	NC_013966	A	6	6	31902	31907	100 %	0 %	0 %	0 %	292653600
5	NC_013966	C	6	6	32408	32413	0 %	0 %	0 %	100 %	292653600
6	NC_013966	C	6	6	39935	39940	0 %	0 %	0 %	100 %	292653608
7	NC_013966	G	6	6	42758	42763	0 %	0 %	100 %	0 %	292653612
8	NC_013966	C	6	6	44396	44401	0 %	0 %	0 %	100 %	292653614
9	NC_013966	G	6	6	44917	44922	0 %	0 %	100 %	0 %	292653614
10	NC_013966	G	6	6	51128	51133	0 %	0 %	100 %	0 %	292653623
11	NC_013966	G	6	6	57863	57868	0 %	0 %	100 %	0 %	292653630
12	NC_013966	G	6	6	64152	64157	0 %	0 %	100 %	0 %	292653635
13	NC_013966	C	6	6	64641	64646	0 %	0 %	0 %	100 %	292653636
14	NC_013966	G	6	6	65482	65487	0 %	0 %	100 %	0 %	292653637
15	NC_013966	G	6	6	66512	66517	0 %	0 %	100 %	0 %	292653638
16	NC_013966	T	6	6	76391	76396	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
17	NC_013966	T	6	6	76530	76535	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
18	NC_013966	T	6	6	77912	77917	0 %	100 %	0 %	0 %	292653642
19	NC_013966	G	6	6	84194	84199	0 %	0 %	100 %	0 %	292653647
20	NC_013966	G	6	6	85610	85615	0 %	0 %	100 %	0 %	292653648
21	NC_013966	A	6	6	100535	100540	100 %	0 %	0 %	0 %	292653659
22	NC_013966	G	6	6	100636	100641	0 %	0 %	100 %	0 %	292653659
23	NC_013966	T	7	7	106035	106041	0 %	100 %	0 %	0 %	292653663
24	NC_013966	A	6	6	106868	106873	100 %	0 %	0 %	0 %	292653664
25	NC_013966	C	6	6	111040	111045	0 %	0 %	0 %	100 %	292653673
26	NC_013966	T	6	6	116079	116084	0 %	100 %	0 %	0 %	292653680
27	NC_013966	A	6	6	125472	125477	100 %	0 %	0 %	0 %	292653689
28	NC_013966	T	6	6	126383	126388	0 %	100 %	0 %	0 %	292653690
29	NC_013966	G	6	6	127710	127715	0 %	0 %	100 %	0 %	292653691
30	NC_013966	T	6	6	131479	131484	0 %	100 %	0 %	0 %	292653694
31	NC_013966	A	6	6	135469	135474	100 %	0 %	0 %	0 %	292653698
32	NC_013966	C	6	6	153478	153483	0 %	0 %	0 %	100 %	292653715
33	NC_013966	G	6	6	171896	171901	0 %	0 %	100 %	0 %	292653731
34	NC_013966	G	6	6	174160	174165	0 %	0 %	100 %	0 %	292653732
35	NC_013966	G	6	6	176204	176209	0 %	0 %	100 %	0 %	292653734
36	NC_013966	C	6	6	180918	180923	0 %	0 %	0 %	100 %	292653737
37	NC_013966	G	6	6	182172	182177	0 %	0 %	100 %	0 %	292653738
38	NC_013966	G	7	7	194315	194321	0 %	0 %	100 %	0 %	292653754
39	NC_013966	G	6	6	214701	214706	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
40	NC_013966	G	6	6	214973	214978	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
41	NC_013966	G	6	6	215560	215565	0 %	0 %	100 %	0 %	292653769
42	NC_013966	A	6	6	216305	216310	100 %	0 %	0 %	0 %	292653770
43	NC_013966	G	8	8	227713	227720	0 %	0 %	100 %	0 %	292653781
44	NC_013966	A	7	7	246109	246115	100 %	0 %	0 %	0 %	292653802
45	NC_013966	C	6	6	251689	251694	0 %	0 %	0 %	100 %	292653810
46	NC_013966	T	6	6	258245	258250	0 %	100 %	0 %	0 %	292653817
47	NC_013966	C	6	6	272311	272316	0 %	0 %	0 %	100 %	292653825
48	NC_013966	T	6	6	286418	286423	0 %	100 %	0 %	0 %	292653836
49	NC_013966	C	6	6	290577	290582	0 %	0 %	0 %	100 %	292653839
50	NC_013966	G	6	6	296434	296439	0 %	0 %	100 %	0 %	292653845
51	NC_013966	C	6	6	297299	297304	0 %	0 %	0 %	100 %	292653845
52	NC_013966	C	6	6	312213	312218	0 %	0 %	0 %	100 %	292653858
53	NC_013966	G	6	6	337907	337912	0 %	0 %	100 %	0 %	292653884
54	NC_013966	G	6	6	343094	343099	0 %	0 %	100 %	0 %	292653890
55	NC_013966	C	6	6	348388	348393	0 %	0 %	0 %	100 %	292653894
56	NC_013966	C	6	6	350252	350257	0 %	0 %	0 %	100 %	292653896
57	NC_013966	G	6	6	385697	385702	0 %	0 %	100 %	0 %	292653925
58	NC_013966	G	6	6	389214	389219	0 %	0 %	100 %	0 %	292653928
59	NC_013966	G	6	6	394318	394323	0 %	0 %	100 %	0 %	292653931
60	NC_013966	C	6	6	396745	396750	0 %	0 %	0 %	100 %	292653933
61	NC_013966	C	6	6	400284	400289	0 %	0 %	0 %	100 %	292653935
62	NC_013966	G	6	6	406680	406685	0 %	0 %	100 %	0 %	292653944
63	NC_013966	C	6	6	406926	406931	0 %	0 %	0 %	100 %	292653945
64	NC_013966	A	6	6	408977	408982	100 %	0 %	0 %	0 %	292653948
65	NC_013966	A	7	7	410927	410933	100 %	0 %	0 %	0 %	292653950
66	NC_013966	T	6	6	412800	412805	0 %	100 %	0 %	0 %	292653953
67	NC_013966	G	6	6	417566	417571	0 %	0 %	100 %	0 %	292653955
68	NC_013966	C	6	6	424577	424582	0 %	0 %	0 %	100 %	292653965
69	NC_013966	T	6	6	429427	429432	0 %	100 %	0 %	0 %	292653969
70	NC_013966	G	6	6	430337	430342	0 %	0 %	100 %	0 %	292653970
71	NC_013966	G	6	6	442626	442631	0 %	0 %	100 %	0 %	292653980
72	NC_013966	C	6	6	452084	452089	0 %	0 %	0 %	100 %	292653991
73	NC_013966	C	6	6	465883	465888	0 %	0 %	0 %	100 %	292654004
74	NC_013966	G	6	6	468421	468426	0 %	0 %	100 %	0 %	292654007
75	NC_013966	C	6	6	477840	477845	0 %	0 %	0 %	100 %	292654016
76	NC_013966	C	6	6	478862	478867	0 %	0 %	0 %	100 %	292654017
77	NC_013966	C	6	6	482249	482254	0 %	0 %	0 %	100 %	292654022
78	NC_013966	G	6	6	487103	487108	0 %	0 %	100 %	0 %	292654025
79	NC_013966	C	6	6	489321	489326	0 %	0 %	0 %	100 %	292654027
80	NC_013966	C	6	6	499586	499591	0 %	0 %	0 %	100 %	292654035
81	NC_013966	C	6	6	507256	507261	0 %	0 %	0 %	100 %	292654042
82	NC_013966	G	6	6	525649	525654	0 %	0 %	100 %	0 %	292654065
83	NC_013966	G	6	6	527787	527792	0 %	0 %	100 %	0 %	292654066
84	NC_013966	C	6	6	531201	531206	0 %	0 %	0 %	100 %	292654070
85	NC_013966	G	6	6	533425	533430	0 %	0 %	100 %	0 %	292654072
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89	NC_013966	G	7	7	551918	551924	0 %	0 %	100 %	0 %	292654093
90	NC_013966	C	6	6	553285	553290	0 %	0 %	0 %	100 %	292654093
91	NC_013966	G	7	7	560445	560451	0 %	0 %	100 %	0 %	292654099
92	NC_013966	G	6	6	565472	565477	0 %	0 %	100 %	0 %	292654103
93	NC_013966	C	6	6	582192	582197	0 %	0 %	0 %	100 %	292654118
94	NC_013966	G	6	6	584625	584630	0 %	0 %	100 %	0 %	292654120
95	NC_013966	C	6	6	590053	590058	0 %	0 %	0 %	100 %	292654125
96	NC_013966	C	6	6	591378	591383	0 %	0 %	0 %	100 %	292654127
97	NC_013966	G	6	6	595592	595597	0 %	0 %	100 %	0 %	292654132
98	NC_013966	C	6	6	608887	608892	0 %	0 %	0 %	100 %	292654146
99	NC_013966	G	6	6	628643	628648	0 %	0 %	100 %	0 %	292654168
100	NC_013966	G	6	6	633407	633412	0 %	0 %	100 %	0 %	292654174

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.