MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 1403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	GAGC	2	8	446	453	25 %	0 %	50 %	25 %	292493939
2	NC_013964	GCCG	2	8	1014	1021	0 %	0 %	50 %	50 %	292493939
3	NC_013964	GCGG	2	8	1067	1074	0 %	0 %	75 %	25 %	292493939
4	NC_013964	CTGG	2	8	1653	1660	0 %	25 %	50 %	25 %	292493940
5	NC_013964	CGAC	2	8	1704	1711	25 %	0 %	25 %	50 %	292493940
6	NC_013964	GCTC	2	8	1943	1950	0 %	25 %	25 %	50 %	292493940
7	NC_013964	CTCG	2	8	2223	2230	0 %	25 %	25 %	50 %	292493940
8	NC_013964	CCGA	2	8	2449	2456	25 %	0 %	25 %	50 %	292493940
9	NC_013964	GCGG	2	8	2496	2503	0 %	0 %	75 %	25 %	292493940
10	NC_013964	CGTC	2	8	2909	2916	0 %	25 %	25 %	50 %	292493941
11	NC_013964	GGCT	2	8	2944	2951	0 %	25 %	50 %	25 %	292493941
12	NC_013964	CGTG	2	8	2966	2973	0 %	25 %	50 %	25 %	292493941
13	NC_013964	GCCA	2	8	3028	3035	25 %	0 %	25 %	50 %	292493941
14	NC_013964	GATT	2	8	3161	3168	25 %	50 %	25 %	0 %	292493941
15	NC_013964	CGAC	2	8	3473	3480	25 %	0 %	25 %	50 %	292493942
16	NC_013964	TCGC	2	8	4561	4568	0 %	25 %	25 %	50 %	292493942
17	NC_013964	TGAG	2	8	5025	5032	25 %	25 %	50 %	0 %	292493943
18	NC_013964	TCCC	2	8	5039	5046	0 %	25 %	0 %	75 %	292493943
19	NC_013964	GAGC	2	8	5074	5081	25 %	0 %	50 %	25 %	292493943
20	NC_013964	CTCG	2	8	5131	5138	0 %	25 %	25 %	50 %	292493943
21	NC_013964	ACCG	2	8	5237	5244	25 %	0 %	25 %	50 %	292493943
22	NC_013964	TCGC	2	8	5444	5451	0 %	25 %	25 %	50 %	292493943
23	NC_013964	GCGA	2	8	6733	6740	25 %	0 %	50 %	25 %	292493944
24	NC_013964	CGTC	2	8	6800	6807	0 %	25 %	25 %	50 %	292493944
25	NC_013964	CGAG	2	8	7016	7023	25 %	0 %	50 %	25 %	292493944
26	NC_013964	CGTC	2	8	7235	7242	0 %	25 %	25 %	50 %	292493944
27	NC_013964	GACG	2	8	7309	7316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013964	CGAG	2	8	7614	7621	25 %	0 %	50 %	25 %	292493945
29	NC_013964	CGAC	2	8	7644	7651	25 %	0 %	25 %	50 %	292493945
30	NC_013964	TGCC	2	8	8656	8663	0 %	25 %	25 %	50 %	292493947
31	NC_013964	GGTC	2	8	9414	9421	0 %	25 %	50 %	25 %	292493947
32	NC_013964	ACCG	2	8	9591	9598	25 %	0 %	25 %	50 %	292493947
33	NC_013964	CGTT	2	8	9660	9667	0 %	50 %	25 %	25 %	292493947
34	NC_013964	AACG	2	8	10305	10312	50 %	0 %	25 %	25 %	292493949
35	NC_013964	ACGA	2	8	10470	10477	50 %	0 %	25 %	25 %	292493949
36	NC_013964	ACCG	2	8	10497	10504	25 %	0 %	25 %	50 %	292493949
37	NC_013964	TCGC	2	8	10860	10867	0 %	25 %	25 %	50 %	292493949
38	NC_013964	GTTG	2	8	11195	11202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013964	CGGT	2	8	11230	11237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013964	GTGG	2	8	11282	11289	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013964	CGGT	2	8	11383	11390	0 %	25 %	50 %	25 %	292493950
42	NC_013964	CATC	2	8	11476	11483	25 %	25 %	0 %	50 %	292493950
43	NC_013964	AGTA	2	8	11663	11670	50 %	25 %	25 %	0 %	292493950
44	NC_013964	GCGA	2	8	11997	12004	25 %	0 %	50 %	25 %	292493950
45	NC_013964	CGGC	2	8	12222	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	292493950
46	NC_013964	CTCG	2	8	12373	12380	0 %	25 %	25 %	50 %	292493950
47	NC_013964	GGCC	2	8	12643	12650	0 %	0 %	50 %	50 %	292493950
48	NC_013964	GTCG	2	8	13049	13056	0 %	25 %	50 %	25 %	292493950
49	NC_013964	CGCT	2	8	13158	13165	0 %	25 %	25 %	50 %	292493951
50	NC_013964	CCCT	2	8	13435	13442	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_013964	GGCG	2	8	14017	14024	0 %	0 %	75 %	25 %	292493952
52	NC_013964	ACCC	2	8	14453	14460	25 %	0 %	0 %	75 %	292493952
53	NC_013964	TGGA	2	8	14669	14676	25 %	25 %	50 %	0 %	292493952
54	NC_013964	CGGA	2	8	14832	14839	25 %	0 %	50 %	25 %	292493952
55	NC_013964	ACGA	2	8	15128	15135	50 %	0 %	25 %	25 %	292493952
56	NC_013964	CGCC	2	8	15214	15221	0 %	0 %	25 %	75 %	292493952
57	NC_013964	ACCT	2	8	15449	15456	25 %	25 %	0 %	50 %	292493952
58	NC_013964	CCGA	2	8	15524	15531	25 %	0 %	25 %	50 %	292493952
59	NC_013964	GGAC	2	8	15648	15655	25 %	0 %	50 %	25 %	292493952
60	NC_013964	CCAG	2	8	16538	16545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013964	CGGC	2	8	16596	16603	0 %	0 %	50 %	50 %	292493954
62	NC_013964	AGAA	2	8	16842	16849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013964	CCAC	2	8	16874	16881	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_013964	CCGA	2	8	17516	17523	25 %	0 %	25 %	50 %	292493956
65	NC_013964	GGTC	2	8	17696	17703	0 %	25 %	50 %	25 %	292493956
66	NC_013964	CCGA	2	8	18481	18488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013964	TCCT	2	8	18583	18590	0 %	50 %	0 %	50 %	292493957
68	NC_013964	CGTC	2	8	19106	19113	0 %	25 %	25 %	50 %	292493957
69	NC_013964	CCCA	2	8	19148	19155	25 %	0 %	0 %	75 %	292493957
70	NC_013964	CGAC	2	8	20238	20245	25 %	0 %	25 %	50 %	292493958
71	NC_013964	GATA	2	8	20760	20767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013964	CGAG	2	8	21129	21136	25 %	0 %	50 %	25 %	292493959
73	NC_013964	CGAC	3	12	21420	21431	25 %	0 %	25 %	50 %	292493959
74	NC_013964	TCGT	2	8	21584	21591	0 %	50 %	25 %	25 %	292493959
75	NC_013964	ACTC	2	8	21811	21818	25 %	25 %	0 %	50 %	292493959
76	NC_013964	GTCG	2	8	21940	21947	0 %	25 %	50 %	25 %	292493959
77	NC_013964	GATA	2	8	22468	22475	50 %	25 %	25 %	0 %	292493959
78	NC_013964	AGCC	2	8	23069	23076	25 %	0 %	25 %	50 %	292493960
79	NC_013964	ACCG	2	8	24030	24037	25 %	0 %	25 %	50 %	292493961
80	NC_013964	GCCC	2	8	24333	24340	0 %	0 %	25 %	75 %	292493961
81	NC_013964	CCCG	2	8	24621	24628	0 %	0 %	25 %	75 %	292493961
82	NC_013964	CGAC	2	8	24757	24764	25 %	0 %	25 %	50 %	292493962
83	NC_013964	AGCG	2	8	24951	24958	25 %	0 %	50 %	25 %	292493962
84	NC_013964	CTCG	2	8	25016	25023	0 %	25 %	25 %	50 %	292493962
85	NC_013964	GCGT	2	8	25557	25564	0 %	25 %	50 %	25 %	292493962
86	NC_013964	AGCC	2	8	25797	25804	25 %	0 %	25 %	50 %	292493962
87	NC_013964	CGGG	2	8	26453	26460	0 %	0 %	75 %	25 %	292493962
88	NC_013964	GAGC	2	8	26666	26673	25 %	0 %	50 %	25 %	292493962
89	NC_013964	CTCG	2	8	28583	28590	0 %	25 %	25 %	50 %	292493964
90	NC_013964	GCGA	2	8	28981	28988	25 %	0 %	50 %	25 %	292493964
91	NC_013964	TTCG	2	8	29072	29079	0 %	50 %	25 %	25 %	292493964
92	NC_013964	CGTG	2	8	29465	29472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013964	CCGG	2	8	29805	29812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013964	CGAC	2	8	30064	30071	25 %	0 %	25 %	50 %	292493965
95	NC_013964	CCGG	2	8	30253	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	292493965
96	NC_013964	GTCG	2	8	31161	31168	0 %	25 %	50 %	25 %	292493966
97	NC_013964	GCCG	2	8	31245	31252	0 %	0 %	50 %	50 %	292493966
98	NC_013964	CCGC	2	8	31475	31482	0 %	0 %	25 %	75 %	292493966
99	NC_013964	GCCA	2	8	31570	31577	25 %	0 %	25 %	50 %	292493966
100	NC_013964	GCGA	2	8	32080	32087	25 %	0 %	50 %	25 %	292493967
101	NC_013964	GCGA	2	8	32124	32131	25 %	0 %	50 %	25 %	292493967
102	NC_013964	CGAC	2	8	32603	32610	25 %	0 %	25 %	50 %	292493967
103	NC_013964	CCGC	2	8	32672	32679	0 %	0 %	25 %	75 %	292493967
104	NC_013964	CGGC	2	8	32736	32743	0 %	0 %	50 %	50 %	292493967
105	NC_013964	CGAC	2	8	32801	32808	25 %	0 %	25 %	50 %	292493967
106	NC_013964	GACA	2	8	32838	32845	50 %	0 %	25 %	25 %	292493967
107	NC_013964	CCGC	2	8	32995	33002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_013964	TCGC	2	8	33442	33449	0 %	25 %	25 %	50 %	292493968
109	NC_013964	CGCC	3	12	33536	33547	0 %	0 %	25 %	75 %	292493968
110	NC_013964	CCCG	2	8	33576	33583	0 %	0 %	25 %	75 %	292493968
111	NC_013964	ACCG	2	8	33910	33917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013964	TCGG	2	8	34214	34221	0 %	25 %	50 %	25 %	292493969
113	NC_013964	CGAG	2	8	34518	34525	25 %	0 %	50 %	25 %	292493969
114	NC_013964	CGTC	2	8	34581	34588	0 %	25 %	25 %	50 %	292493969
115	NC_013964	AGCG	2	8	34633	34640	25 %	0 %	50 %	25 %	292493969
116	NC_013964	GCGG	2	8	34660	34667	0 %	0 %	75 %	25 %	292493969
117	NC_013964	GGTC	2	8	34784	34791	0 %	25 %	50 %	25 %	292493969
118	NC_013964	GACG	2	8	34849	34856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013964	CGAC	2	8	35187	35194	25 %	0 %	25 %	50 %	292493970
120	NC_013964	GTCG	2	8	35454	35461	0 %	25 %	50 %	25 %	292493970
121	NC_013964	CCGC	2	8	35625	35632	0 %	0 %	25 %	75 %	292493970
122	NC_013964	GAGC	2	8	35660	35667	25 %	0 %	50 %	25 %	292493970
123	NC_013964	CGGT	2	8	36237	36244	0 %	25 %	50 %	25 %	292493972
124	NC_013964	CGAC	2	8	37389	37396	25 %	0 %	25 %	50 %	292493973
125	NC_013964	TCTG	2	8	37671	37678	0 %	50 %	25 %	25 %	292493973
126	NC_013964	TCGT	2	8	37769	37776	0 %	50 %	25 %	25 %	292493973
127	NC_013964	CTGG	2	8	37867	37874	0 %	25 %	50 %	25 %	292493973
128	NC_013964	ACCT	2	8	38024	38031	25 %	25 %	0 %	50 %	292493973
129	NC_013964	CGTC	2	8	38061	38068	0 %	25 %	25 %	50 %	292493973
130	NC_013964	CCGC	2	8	38140	38147	0 %	0 %	25 %	75 %	292493973
131	NC_013964	GGAC	2	8	38154	38161	25 %	0 %	50 %	25 %	292493973
132	NC_013964	ACGA	2	8	38458	38465	50 %	0 %	25 %	25 %	292493974
133	NC_013964	GTCG	2	8	38466	38473	0 %	25 %	50 %	25 %	292493974
134	NC_013964	CTCG	2	8	38474	38481	0 %	25 %	25 %	50 %	292493974
135	NC_013964	CGGT	2	8	38498	38505	0 %	25 %	50 %	25 %	292493974
136	NC_013964	GGCG	2	8	38651	38658	0 %	0 %	75 %	25 %	292493974
137	NC_013964	CTCG	2	8	38904	38911	0 %	25 %	25 %	50 %	292493974
138	NC_013964	CTCG	2	8	39306	39313	0 %	25 %	25 %	50 %	292493975
139	NC_013964	CGAC	2	8	40762	40769	25 %	0 %	25 %	50 %	292493976
140	NC_013964	GCGG	2	8	40916	40923	0 %	0 %	75 %	25 %	292493976
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142	NC_013964	ACCG	2	8	42204	42211	25 %	0 %	25 %	50 %	292493977
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