MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 9222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	GTG	2	6	44	49	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013964	TAC	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013964	TCG	2	6	85	90	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013964	TTA	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013964	CGA	2	6	326	331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
6	NC_013964	GCG	2	6	511	516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493939
7	NC_013964	TCA	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493939
8	NC_013964	ACT	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493939
9	NC_013964	CGA	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
10	NC_013964	CGA	3	9	701	709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
11	NC_013964	ACG	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
12	NC_013964	CGT	2	6	859	864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493939
13	NC_013964	ACG	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
14	NC_013964	CGA	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
15	NC_013964	CGC	2	6	962	967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493939
16	NC_013964	CGA	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
17	NC_013964	CTC	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493939
18	NC_013964	TCC	2	6	1159	1164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493939
19	NC_013964	CGG	2	6	1169	1174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493939
20	NC_013964	CCG	2	6	1183	1188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493939
21	NC_013964	ACG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
22	NC_013964	CGA	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493939
23	NC_013964	CTC	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493939
24	NC_013964	GAC	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013964	TCG	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
26	NC_013964	CCG	2	6	1612	1617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493940
27	NC_013964	GGC	4	12	1626	1637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
28	NC_013964	TCG	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
29	NC_013964	GTC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
30	NC_013964	CGG	2	6	1781	1786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
31	NC_013964	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
32	NC_013964	GAG	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493940
33	NC_013964	CTC	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493940
34	NC_013964	ACG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
35	NC_013964	CGT	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
36	NC_013964	CGA	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
37	NC_013964	CGG	2	6	2106	2111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
38	NC_013964	CGA	2	6	2136	2141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
39	NC_013964	ACG	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
40	NC_013964	CGT	2	6	2283	2288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
41	NC_013964	GCT	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493940
42	NC_013964	CGG	3	9	2438	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
43	NC_013964	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493940
44	NC_013964	GCG	2	6	2533	2538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493940
45	NC_013964	ACG	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
46	NC_013964	ACG	2	6	2621	2626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493940
47	NC_013964	TCC	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493940
48	NC_013964	CGC	2	6	2748	2753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013964	CGA	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493941
50	NC_013964	TTC	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292493941
51	NC_013964	CGC	3	9	2825	2833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493941
52	NC_013964	CGA	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493941
53	NC_013964	GCC	3	9	2880	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493941
54	NC_013964	GAC	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493941
55	NC_013964	GCC	2	6	2989	2994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493941
56	NC_013964	CGT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493941
57	NC_013964	TCG	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013964	CTC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013964	ACG	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013964	AAC	3	9	3310	3318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013964	CGG	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493942
62	NC_013964	TCG	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
63	NC_013964	CGA	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493942
64	NC_013964	TCG	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
65	NC_013964	GCG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493942
66	NC_013964	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493942
67	NC_013964	CCT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493942
68	NC_013964	GTC	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
69	NC_013964	CGT	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
70	NC_013964	GCG	3	9	3784	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493942
71	NC_013964	CGA	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493942
72	NC_013964	CTC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493942
73	NC_013964	CGT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
74	NC_013964	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
75	NC_013964	ATG	3	9	3946	3954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493942
76	NC_013964	CCG	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493942
77	NC_013964	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493942
78	NC_013964	CGA	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493942
79	NC_013964	GGT	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292493942
80	NC_013964	GAT	3	9	4152	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493942
81	NC_013964	GCC	2	6	4293	4298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493942
82	NC_013964	TCG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493942
83	NC_013964	GCC	2	6	4467	4472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493942
84	NC_013964	GTA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493942
85	NC_013964	GTT	2	6	4506	4511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292493942
86	NC_013964	CCG	2	6	5005	5010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013964	GCC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013964	CGT	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
89	NC_013964	TCG	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
90	NC_013964	ACA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292493943
91	NC_013964	CGA	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
92	NC_013964	TCG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
93	NC_013964	GAG	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493943
94	NC_013964	ACG	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
95	NC_013964	GTC	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
96	NC_013964	CGG	4	12	5575	5586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493943
97	NC_013964	CAC	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493943
98	NC_013964	CGT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
99	NC_013964	CGA	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
100	NC_013964	CGG	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493943
101	NC_013964	CGA	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
102	NC_013964	GTC	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
103	NC_013964	TCC	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493943
104	NC_013964	GTC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
105	NC_013964	CGC	2	6	5893	5898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493943
106	NC_013964	CGA	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
107	NC_013964	ACG	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
108	NC_013964	CCT	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493943
109	NC_013964	CGG	2	6	6198	6203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493943
110	NC_013964	CGT	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493943
111	NC_013964	CGA	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493943
112	NC_013964	ACG	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013964	GCG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013964	ACG	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013964	CGA	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013964	ACG	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
117	NC_013964	GTC	3	9	6480	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
118	NC_013964	CGT	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
119	NC_013964	GGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493944
120	NC_013964	CCG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493944
121	NC_013964	GGT	2	6	6703	6708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292493944
122	NC_013964	ACG	3	9	6749	6757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
123	NC_013964	CGT	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
124	NC_013964	CGT	3	9	6938	6946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
125	NC_013964	TCG	3	9	6965	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
126	NC_013964	GAC	3	9	6993	7001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
127	NC_013964	GCA	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
128	NC_013964	CGT	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493944
129	NC_013964	CGA	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
130	NC_013964	GAC	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493944
131	NC_013964	GCC	2	6	7271	7276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493944
132	NC_013964	GCG	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013964	ACT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013964	ACG	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493945
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253	NC_013964	TCG	2	6	13296	13301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493951
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255	NC_013964	CTC	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_013964	TCG	2	6	13379	13384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013964	TCG	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_013964	GTG	2	6	13425	13430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_013964	CGA	2	6	19099	19104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493957
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412	NC_013964	TTG	2	6	20713	20718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_013964	CAC	2	6	24648	24653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493961
498	NC_013964	GAA	2	6	24682	24687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292493961
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500	NC_013964	CCT	2	6	24722	24727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493962

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