MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	TC	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	292493939
2	NC_013964	CG	4	8	727	734	0 %	0 %	50 %	50 %	292493939
3	NC_013964	GC	3	6	955	960	0 %	0 %	50 %	50 %	292493939
4	NC_013964	CG	3	6	1025	1030	0 %	0 %	50 %	50 %	292493939
5	NC_013964	AC	3	6	1519	1524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013964	GC	3	6	1931	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	292493940
7	NC_013964	GC	3	6	2470	2475	0 %	0 %	50 %	50 %	292493940
8	NC_013964	GA	3	6	3011	3016	50 %	0 %	50 %	0 %	292493941
9	NC_013964	TC	3	6	3259	3264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013964	GA	3	6	4315	4320	50 %	0 %	50 %	0 %	292493942
11	NC_013964	TC	3	6	4919	4924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013964	GC	3	6	5068	5073	0 %	0 %	50 %	50 %	292493943
13	NC_013964	CG	3	6	5205	5210	0 %	0 %	50 %	50 %	292493943
14	NC_013964	CG	3	6	5376	5381	0 %	0 %	50 %	50 %	292493943
15	NC_013964	TC	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	292493944
16	NC_013964	GC	3	6	6447	6452	0 %	0 %	50 %	50 %	292493944
17	NC_013964	CG	3	6	6853	6858	0 %	0 %	50 %	50 %	292493944
18	NC_013964	TA	3	6	7360	7365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013964	TC	3	6	7632	7637	0 %	50 %	0 %	50 %	292493945
20	NC_013964	AC	3	6	7789	7794	50 %	0 %	0 %	50 %	292493945
21	NC_013964	GT	3	6	8633	8638	0 %	50 %	50 %	0 %	292493947
22	NC_013964	GC	3	6	8667	8672	0 %	0 %	50 %	50 %	292493947
23	NC_013964	AC	3	6	9741	9746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013964	CG	3	6	10095	10100	0 %	0 %	50 %	50 %	292493949
25	NC_013964	CG	3	6	10344	10349	0 %	0 %	50 %	50 %	292493949
26	NC_013964	TC	3	6	11266	11271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013964	CG	3	6	12487	12492	0 %	0 %	50 %	50 %	292493950
28	NC_013964	GC	3	6	12588	12593	0 %	0 %	50 %	50 %	292493950
29	NC_013964	GC	3	6	12882	12887	0 %	0 %	50 %	50 %	292493950
30	NC_013964	AG	3	6	13283	13288	50 %	0 %	50 %	0 %	292493951
31	NC_013964	CG	3	6	13368	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013964	GA	3	6	13484	13489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013964	CG	3	6	13746	13751	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
34	NC_013964	CG	3	6	13905	13910	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
35	NC_013964	GC	3	6	14009	14014	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
36	NC_013964	GC	3	6	14196	14201	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
37	NC_013964	GC	3	6	14721	14726	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
38	NC_013964	CG	3	6	14820	14825	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
39	NC_013964	GC	4	8	14842	14849	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
40	NC_013964	GC	3	6	15099	15104	0 %	0 %	50 %	50 %	292493952
41	NC_013964	CT	3	6	16763	16768	0 %	50 %	0 %	50 %	292493954
42	NC_013964	CG	4	8	17738	17745	0 %	0 %	50 %	50 %	292493956
43	NC_013964	CG	3	6	17858	17863	0 %	0 %	50 %	50 %	292493956
44	NC_013964	GT	3	6	18127	18132	0 %	50 %	50 %	0 %	292493956
45	NC_013964	CA	3	6	18336	18341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013964	TG	3	6	18448	18453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013964	GC	3	6	18494	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013964	CG	3	6	18878	18883	0 %	0 %	50 %	50 %	292493957
49	NC_013964	CG	3	6	18927	18932	0 %	0 %	50 %	50 %	292493957
50	NC_013964	GC	3	6	19001	19006	0 %	0 %	50 %	50 %	292493957
51	NC_013964	CG	3	6	19532	19537	0 %	0 %	50 %	50 %	292493957
52	NC_013964	CG	3	6	19919	19924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013964	TA	3	6	20748	20753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013964	GC	3	6	21486	21491	0 %	0 %	50 %	50 %	292493959
55	NC_013964	CG	3	6	22508	22513	0 %	0 %	50 %	50 %	292493959
56	NC_013964	GC	3	6	23444	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
57	NC_013964	CG	3	6	23495	23500	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
58	NC_013964	CG	3	6	23527	23532	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
59	NC_013964	GC	3	6	24098	24103	0 %	0 %	50 %	50 %	292493961
60	NC_013964	AG	3	6	24370	24375	50 %	0 %	50 %	0 %	292493961
61	NC_013964	GC	4	8	24394	24401	0 %	0 %	50 %	50 %	292493961
62	NC_013964	GC	3	6	25042	25047	0 %	0 %	50 %	50 %	292493962
63	NC_013964	CG	3	6	26192	26197	0 %	0 %	50 %	50 %	292493962
64	NC_013964	TC	3	6	26395	26400	0 %	50 %	0 %	50 %	292493962
65	NC_013964	GT	3	6	27009	27014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013964	AT	3	6	27027	27032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013964	TA	3	6	27078	27083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013964	AT	3	6	27138	27143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013964	GC	3	6	27583	27588	0 %	0 %	50 %	50 %	292493963
70	NC_013964	GC	3	6	27699	27704	0 %	0 %	50 %	50 %	292493963
71	NC_013964	GC	4	8	27794	27801	0 %	0 %	50 %	50 %	292493963
72	NC_013964	GC	3	6	27869	27874	0 %	0 %	50 %	50 %	292493963
73	NC_013964	CG	3	6	28314	28319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013964	GC	3	6	28604	28609	0 %	0 %	50 %	50 %	292493964
75	NC_013964	CG	3	6	28805	28810	0 %	0 %	50 %	50 %	292493964
76	NC_013964	CG	3	6	28872	28877	0 %	0 %	50 %	50 %	292493964
77	NC_013964	TC	3	6	29159	29164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013964	GC	4	8	29198	29205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013964	TG	3	6	29404	29409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013964	CT	3	6	29455	29460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82	NC_013964	GT	3	6	29705	29710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013964	CT	3	6	29711	29716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013964	GC	3	6	30197	30202	0 %	0 %	50 %	50 %	292493965
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87	NC_013964	GC	3	6	31812	31817	0 %	0 %	50 %	50 %	292493966
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89	NC_013964	CG	3	6	32612	32617	0 %	0 %	50 %	50 %	292493967
90	NC_013964	GC	3	6	33084	33089	0 %	0 %	50 %	50 %	292493968
91	NC_013964	CA	3	6	33262	33267	50 %	0 %	0 %	50 %	292493968
92	NC_013964	GC	3	6	33415	33420	0 %	0 %	50 %	50 %	292493968
93	NC_013964	CG	3	6	33632	33637	0 %	0 %	50 %	50 %	292493968
94	NC_013964	CT	3	6	34399	34404	0 %	50 %	0 %	50 %	292493969
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97	NC_013964	CG	3	6	35460	35465	0 %	0 %	50 %	50 %	292493970
98	NC_013964	CG	3	6	35473	35478	0 %	0 %	50 %	50 %	292493970
99	NC_013964	TC	3	6	35589	35594	0 %	50 %	0 %	50 %	292493970
100	NC_013964	GC	3	6	35610	35615	0 %	0 %	50 %	50 %	292493970
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103	NC_013964	CG	3	6	36419	36424	0 %	0 %	50 %	50 %	292493972
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105	NC_013964	CG	3	6	38757	38762	0 %	0 %	50 %	50 %	292493974
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108	NC_013964	CG	3	6	40848	40853	0 %	0 %	50 %	50 %	292493976
109	NC_013964	GA	3	6	41704	41709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_013964	CG	3	6	42372	42377	0 %	0 %	50 %	50 %	292493977
112	NC_013964	CG	3	6	42453	42458	0 %	0 %	50 %	50 %	292493977
113	NC_013964	GT	3	6	43079	43084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013964	CG	3	6	43112	43117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013964	GC	3	6	43517	43522	0 %	0 %	50 %	50 %	292493978
116	NC_013964	CG	3	6	43767	43772	0 %	0 %	50 %	50 %	292493978
117	NC_013964	CG	3	6	44121	44126	0 %	0 %	50 %	50 %	292493978
118	NC_013964	GT	3	6	45302	45307	0 %	50 %	50 %	0 %	292493979
119	NC_013964	TC	3	6	45878	45883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013964	TC	3	6	45928	45933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013964	TC	3	6	46008	46013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013964	CG	3	6	46604	46609	0 %	0 %	50 %	50 %	292493980
123	NC_013964	CG	3	6	46611	46616	0 %	0 %	50 %	50 %	292493980
124	NC_013964	GT	3	6	47463	47468	0 %	50 %	50 %	0 %	292493980
125	NC_013964	TC	3	6	47896	47901	0 %	50 %	0 %	50 %	292493980
126	NC_013964	CG	3	6	49172	49177	0 %	0 %	50 %	50 %	292493981
127	NC_013964	GC	3	6	49503	49508	0 %	0 %	50 %	50 %	292493981
128	NC_013964	CG	3	6	49776	49781	0 %	0 %	50 %	50 %	292493982
129	NC_013964	CG	3	6	49917	49922	0 %	0 %	50 %	50 %	292493982
130	NC_013964	GC	3	6	50565	50570	0 %	0 %	50 %	50 %	292493983
131	NC_013964	CG	3	6	51359	51364	0 %	0 %	50 %	50 %	292493983
132	NC_013964	AG	3	6	51857	51862	50 %	0 %	50 %	0 %	292493983
133	NC_013964	CG	3	6	52080	52085	0 %	0 %	50 %	50 %	292493984
134	NC_013964	GC	3	6	52671	52676	0 %	0 %	50 %	50 %	292493984
135	NC_013964	CG	3	6	52720	52725	0 %	0 %	50 %	50 %	292493984
136	NC_013964	GC	3	6	53470	53475	0 %	0 %	50 %	50 %	292493984
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139	NC_013964	GC	3	6	54479	54484	0 %	0 %	50 %	50 %	292493985
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145	NC_013964	AG	3	6	55974	55979	50 %	0 %	50 %	0 %	292493986
146	NC_013964	CG	3	6	56013	56018	0 %	0 %	50 %	50 %	292493986
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