MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013964	A	6	6	2737	2742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013964	G	6	6	9899	9904	0 %	0 %	100 %	0 %	292493948
4	NC_013964	C	6	6	13448	13453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_013964	G	6	6	13667	13672	0 %	0 %	100 %	0 %	292493952
6	NC_013964	C	6	6	18853	18858	0 %	0 %	0 %	100 %	292493957
7	NC_013964	C	6	6	19944	19949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_013964	G	6	6	22795	22800	0 %	0 %	100 %	0 %	292493960
9	NC_013964	G	6	6	23082	23087	0 %	0 %	100 %	0 %	292493960
10	NC_013964	G	6	6	25176	25181	0 %	0 %	100 %	0 %	292493962
11	NC_013964	G	6	6	26231	26236	0 %	0 %	100 %	0 %	292493962
12	NC_013964	C	6	6	29365	29370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_013964	G	6	6	30375	30380	0 %	0 %	100 %	0 %	292493965
14	NC_013964	G	6	6	31682	31687	0 %	0 %	100 %	0 %	292493966
15	NC_013964	G	6	6	38293	38298	0 %	0 %	100 %	0 %	292493973
16	NC_013964	C	7	7	47793	47799	0 %	0 %	0 %	100 %	292493980
17	NC_013964	C	7	7	71736	71742	0 %	0 %	0 %	100 %	292494000
18	NC_013964	G	6	6	84756	84761	0 %	0 %	100 %	0 %	292494014
19	NC_013964	C	6	6	88599	88604	0 %	0 %	0 %	100 %	292494018
20	NC_013964	T	6	6	107598	107603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013964	G	6	6	110052	110057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013964	C	6	6	111388	111393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_013964	C	6	6	112566	112571	0 %	0 %	0 %	100 %	292494039
24	NC_013964	C	6	6	140402	140407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_013964	G	6	6	140948	140953	0 %	0 %	100 %	0 %	292494063
26	NC_013964	G	6	6	145152	145157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013964	G	6	6	145491	145496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013964	C	6	6	155014	155019	0 %	0 %	0 %	100 %	292494077
29	NC_013964	C	6	6	157002	157007	0 %	0 %	0 %	100 %	292494079
30	NC_013964	T	6	6	167930	167935	0 %	100 %	0 %	0 %	292494087
31	NC_013964	C	6	6	170210	170215	0 %	0 %	0 %	100 %	292494089
32	NC_013964	T	6	6	175256	175261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013964	G	6	6	179128	179133	0 %	0 %	100 %	0 %	292494092
34	NC_013964	G	6	6	184852	184857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013964	G	6	6	187552	187557	0 %	0 %	100 %	0 %	292494099
36	NC_013964	G	6	6	188233	188238	0 %	0 %	100 %	0 %	292494100
37	NC_013964	C	6	6	188288	188293	0 %	0 %	0 %	100 %	292494100
38	NC_013964	C	6	6	193682	193687	0 %	0 %	0 %	100 %	292494104
39	NC_013964	G	6	6	203331	203336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013964	A	8	8	208778	208785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013964	C	6	6	209321	209326	0 %	0 %	0 %	100 %	292494116
42	NC_013964	G	6	6	216992	216997	0 %	0 %	100 %	0 %	292494123
43	NC_013964	G	6	6	217412	217417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013964	C	6	6	220726	220731	0 %	0 %	0 %	100 %	292494127
45	NC_013964	C	6	6	225267	225272	0 %	0 %	0 %	100 %	292494131
46	NC_013964	T	6	6	226718	226723	0 %	100 %	0 %	0 %	292494134
47	NC_013964	C	6	6	229993	229998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_013964	C	6	6	237934	237939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_013964	C	6	6	244129	244134	0 %	0 %	0 %	100 %	292494146
50	NC_013964	G	6	6	246385	246390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013964	C	6	6	251701	251706	0 %	0 %	0 %	100 %	292494152
52	NC_013964	C	6	6	254812	254817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_013964	G	6	6	255452	255457	0 %	0 %	100 %	0 %	292494153
54	NC_013964	G	6	6	267347	267352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013964	G	6	6	277976	277981	0 %	0 %	100 %	0 %	292494171
56	NC_013964	A	6	6	278583	278588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013964	C	7	7	280488	280494	0 %	0 %	0 %	100 %	292494172
58	NC_013964	A	6	6	284869	284874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013964	G	6	6	289627	289632	0 %	0 %	100 %	0 %	292494180
60	NC_013964	G	6	6	291175	291180	0 %	0 %	100 %	0 %	292494181
61	NC_013964	G	6	6	291309	291314	0 %	0 %	100 %	0 %	292494181
62	NC_013964	C	6	6	294505	294510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_013964	T	7	7	300496	300502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013964	G	6	6	300811	300816	0 %	0 %	100 %	0 %	292494187
65	NC_013964	T	6	6	307072	307077	0 %	100 %	0 %	0 %	292494192
66	NC_013964	G	6	6	307664	307669	0 %	0 %	100 %	0 %	292494193
67	NC_013964	C	6	6	312979	312984	0 %	0 %	0 %	100 %	292494196
68	NC_013964	G	6	6	319350	319355	0 %	0 %	100 %	0 %	292494200
69	NC_013964	T	6	6	320378	320383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013964	C	6	6	324389	324394	0 %	0 %	0 %	100 %	292494204
71	NC_013964	C	6	6	328586	328591	0 %	0 %	0 %	100 %	292494209
72	NC_013964	G	6	6	331501	331506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013964	G	6	6	331548	331553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013964	G	6	6	334023	334028	0 %	0 %	100 %	0 %	292494216
75	NC_013964	C	6	6	337601	337606	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_013964	G	6	6	341653	341658	0 %	0 %	100 %	0 %	292494225
77	NC_013964	A	6	6	345980	345985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013964	T	6	6	346247	346252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013964	G	6	6	348341	348346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013964	G	6	6	360327	360332	0 %	0 %	100 %	0 %	292494247
81	NC_013964	G	6	6	366169	366174	0 %	0 %	100 %	0 %	292494251
82	NC_013964	G	6	6	367507	367512	0 %	0 %	100 %	0 %	292494252
83	NC_013964	C	6	6	373491	373496	0 %	0 %	0 %	100 %	292494256
84	NC_013964	C	6	6	374374	374379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_013964	C	6	6	375169	375174	0 %	0 %	0 %	100 %	292494257
86	NC_013964	G	6	6	382180	382185	0 %	0 %	100 %	0 %	292494262
87	NC_013964	T	6	6	383814	383819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013964	G	6	6	384715	384720	0 %	0 %	100 %	0 %	292494264
89	NC_013964	C	6	6	391119	391124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_013964	G	6	6	395865	395870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013964	G	6	6	397362	397367	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013964	C	6	6	401644	401649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_013964	G	6	6	423476	423481	0 %	0 %	100 %	0 %	292494298
94	NC_013964	C	6	6	424268	424273	0 %	0 %	0 %	100 %	292494300
95	NC_013964	C	6	6	424924	424929	0 %	0 %	0 %	100 %	292494301
96	NC_013964	T	7	7	429068	429074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013964	T	6	6	437499	437504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013964	C	6	6	437633	437638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_013964	C	6	6	437684	437689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_013964	C	6	6	437746	437751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_013964	C	6	6	437896	437901	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.